Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07017
• Subject: XM_024449167.1
• Aligned Length: 1656
• Identities: 1634
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ---------------------ATGCTGCTGCTGCACAGAGCTGTGGTCCTCAGGCTCCAACAGGCCTGCAGACT  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAGAAAGGTCTGCTACAATGCTGCTGCTGCACAGAGCTGTGGTCCTCAGGCTCCAACAGGCCTGCAGACT  74

Query   54  CAAGTCAATCCCCTCAAGGATCTGCATTCAGGCCTGCTCCACAAATGATTCATTTCAGCCCCAGCGCCCCAGCC  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGTCAATCCCCTCAAGGATCTGCATTCAGGCCTGCTCCACAAATGATTCATTTCAGCCCCAGCGCCCCAGCC  148

Query  128  TCACCTTCTCTGGTGATAACTCCAGCACCCAGGGATGGAGAGTCATGGGGACCCTATTAGGTCTCGGTGCAGTG  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACCTTCTCTGGTGATAACTCCAGCACCCAGGGATGGAGAGTCATGGGGACCCTATTAGGTCTCGGTGCAGTG  222

Query  202  TTGGCCTATCAGGACCATCGGTGTAGGGCTGCTCAGGAGTCAACACACATATACACTAAGGAGGAAGTGAGTTC  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGCCTATCAGGACCATCGGTGTAGGGCTGCTCAGGAGTCAACACACATATACACTAAGGAGGAAGTGAGTTC  296

Query  276  CCACACCAGCCCTGAGACTGGGATCTGGGTGACTCTGGGCTCTGAGGTCTTTGATGTCACAGAATTTGTGGACC  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCACACCAGCCCTGAGACTGGGATCTGGGTGACTCTGGGCTCTGAGGTCTTTGATGTCACAGAATTTGTGGACC  370

Query  350  TACATCCAGGGGGGCCTTCAAAGCTGATGCTAGCAGCTGGGGGTCCCCTAGAGCCCTTCTGGGCCCTCTATGCT  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACATCCAGGGGGGCCTTCAAAGCTGATGCTAGCAGCTGGGGGTCCCCTAGAGCCCTTCTGGGCCCTCTATGCT  444

Query  424  GTTCACAACCAGTCCCATGTGCGTGAGTTACTGGCTCAGTACAAGATTGGGGAGCTGAATCCTGAAGACAAGGT  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTCACAACCAGTCCCATGTGCGTGAGTTACTGGCTCAGTACAAGATTGGGGAGCTGAATCCTGAAGACAAGGT  518

Query  498  AGCCCCCACCGTGGAGACCTCTGACCCTTATGCTGATGATCCTGTACGTCACCCAGCCCTGAAGGTCAACAGCC  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCCCCACCGTGGAGACCTCTGACCCTTATGCTGATGATCCTGTACGTCACCCAGCCCTGAAGGTCAACAGCC  592

Query  572  AGCGGCCCTTTAATGCAGAGCCTCCCCCTGAGCTGCTGACAGAAAACTACATCACACCCAACCCTATCTTCTTC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCGGCCCTTTAATGCAGAGCCTCCCCCTGAGCTGCTGACAGAAAACTACATCACACCCAACCCTATCTTCTTC  666

Query  646  ACCCGGAACCATCTGCCTGTACCTAACCTGGATCCAGACACCTATCGCTTACACGTAGTAGGAGCACCTGGGGG  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCCGGAACCATCTGCCTGTACCTAACCTGGATCCAGACACCTATCGCTTACACGTAGTAGGAGCACCTGGGGG  740

Query  720  TCAGTCACTGTCTCTTTCCCTGGATGACTTGCACAACTTTCCCAGGTACGAGATCACAGTCACTCTGCAGTGTG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGTCACTGTCTCTTTCCCTGGATGACTTGCACAACTTTCCCAGGTACGAGATCACAGTCACTCTGCAGTGTG  814

Query  794  CCGGCAACCGACGCTCTGAGATGACTCAGGTCAAAGAAGTAAAAGGTCTGGAGTGGAGAACAGGAGCCATCAGC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGGCAACCGACGCTCTGAGATGACTCAGGTCAAAGAAGTAAAAGGTCTGGAGTGGAGAACAGGAGCCATCAGC  888

Query  868  ACTGCACGCTGGGCTGGGGCACGGCTCTGTGATGTGTTAGCCCAGGCTGGCCACCAACTCTGTGAAACTGAGGC  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGCACGCTGGGCTGGGGCACGGCTCTGTGATGTGTTAGCCCAGGCTGGCCACCAACTCTGTGAAACTGAGGC  962

Query  942  CCACGTCTGCTTTGAGGGACTGGACTCAGACCCTACTGGGACTGCCTATGGAGCATCCATCCCTCTGGCTCGGG  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACGTCTGCTTTGAGGGACTGGACTCAGACCCTACTGGGACTGCCTATGGAGCATCCATCCCTCTGGCTCGGG  1036

Query 1016  CCATGGACCCTGAAGCTGAGGTCCTGCTGGCATATGAGATGAATGGGCAGCCTCTGCCACGTGACCACGGCTTC  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATGGACCCTGAAGCTGAGGTCCTGCTGGCATATGAGATGAATGGGCAGCCTCTGCCACGTGACCACGGCTTC  1110

Query 1090  CCTGTGCGTGTGGTGGTTCCTGGAGTGGTGGGTGCCCGCCATGTCAAATGGCTGGGCAGAGTGAGTGTGCAGCC  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGTGCGTGTGGTGGTTCCTGGAGTGGTGGGTGCCCGCCATGTCAAATGGCTGGGCAGAGTGAGTGTGCAGCC  1184

Query 1164  AGAGGAAAGTTACAGCCACTGGCAACGGCGGGATTACAAAGGCTTCTCTCCATCTGTGGACTGGGAGACTGTAG  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGGAAAGTTACAGCCACTGGCAACGGCGGGATTACAAAGGCTTCTCTCCATCTGTGGACTGGGAGACTGTAG  1258

Query 1238  ATTTTGACTCTGCTCCATCCATTCAGGAACTTCCTGTCCAGTCCGCCATCACAGAGCCCCGGGATGGAGAGACT  1311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTTTGACTCTGCTCCATCCATTCAGGAACTTCCTGTCCAGTCGGCCATCACAGAGCCCCGGGATGGAGAGACT  1332

Query 1312  GTAGAATCAGGGGAGGTGACCATCAAGGGCTATGCATGGAGTGGTGGTGGCAGGGCTGTGATCCGGGTGGATGT  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTAGAATCAGGGGAGGTGACCATCAAGGGCTATGCATGGAGTGGTGGTGGCAGGGCTGTGATCCGGGTGGATGT  1406

Query 1386  GTCTCTGGATGGGGGCCTAACCTGGCAGGTGGCTAAGCTGGATGGAGAGGAACAGCGCCCCAGGAAGGCCTGGG  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCTCTGGATGGGGGCCTAACCTGGCAGGTGGCTAAGCTGGATGGAGAGGAACAGCGCCCCAGGAAGGCCTGGG  1480

Query 1460  CATGGCGTCTGTGGCAGTTGAAAGCCCCTGTGCCAGCTGGACAAAAGGAACTGAACATTGTTTGTAAGGCTGTG  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CATGGCGTCTGTGGCAGTTGAAAGCCCCTGTGCCAGCTGGACAAAAGGAACTGAACATTGTTTGTAAGGCTGTG  1554

Query 1534  GATGATGGTTACAATGTGCAGCCAGACACCGTGGCCCCAATCTGGAACCTGCGAGGTGTTCTCAGCAATGCCTG  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATGATGGTTACAATGTGCAGCCAGACACCGTGGCCCCAATCTGGAACCTGCGAGGTGTTCTCAGCAATGCCTG  1628

Query 1608  GCATCGTGTCCATGTCTATGTCTCCCCA  1635
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCATCGTGTCCATGTCTATGTCTCCCCA  1656