Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07112
• Subject: NM_001093771.3
• Aligned Length: 1947
• Identities: 1494
• Gaps: 450

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCTGCGCCGAGGGCAAGGCAGTGGCGGCGGCCGCCCCAACGGAGCTGCAGACGAAAGGCAAGAACGGCGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGGCCGCCGTAGGTCAGCTAAAGATCATCACCCTGGTAAAACTTTGCCAGAGAACCCAGCAGGATTCACCAGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CGGCCACTGCAGACTCCAGAGCCCTGCTTCAGGCCTATATAGATGGTCACTCTGTGGTCATCTTCAGTAGGTCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACATGCACACGCTGTACTGAGGTAAAGAAGTTATTTAAATCTCTGTGTGTTCCTTATTTTGTGCTTGAACTTGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TCAAACAGAGGACGGTCGGGCCCTGGAAGGAACGCTCTCGGAATTGGCCGCGGAAACCGATCTGCCCGTTGTGT  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  TTGTGAAACAGAGAAAGATAGGCGGCCATGGTCCAACCTTGAAGGCTTATCAGGAGGGCAGACTTCAAAAGCTA  444

Query    1  ------ATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGG  68
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTAAAAATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGG  518

Query   69  AGGTCTGGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCC  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGTCTGGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCC  592

Query  143  CTCTTGGAACTAGATGGGGTCTTGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAA  216
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTTGGAACTAGATGGGGTCTCGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAA  666

Query  217  GCAGCTTTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGA  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGCTTTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGA  740

Query  291  TTGGGACAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGG  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTGGGACAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGG  814

Query  365  AGAAAAAAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAA  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAAAAAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAA  888

Query  439  GGCAAAGAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCC  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCAAAGAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCC  962

Query  513  TGGTGACAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGACAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTG  1036

Query  587  TTGGAGCATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGGAGCATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTT  1110

Query  661  AGGTCCATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCAT  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGTCCATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCAT  1184

Query  735  CAAGTTTATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGTTTATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAG  1258

Query  809  TAGCTCAGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGAT  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAGCTCAGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGAT  1332

Query  883  GCTTGCACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCAC  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTTGCACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCAC  1406

Query  957  AGATGAAGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGATGAAGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCC  1480

Query 1031  CAGTTGCAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAA  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGTTGCAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAA  1554

Query 1105  AATGTTCCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AATGTTCCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAA  1628

Query 1179  GTTTGGGGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTTTGGGGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATA  1702

Query 1253  ACAACAAATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGT  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACAACAAATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGT  1776

Query 1327  CCAAATGCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAG  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAAATGCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAG  1850

Query 1401  CACAATTGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCA  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACAATTGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCA  1924

Query 1475  TCCTCCAGGCTGGCTNCTGNGGT  1497
            |||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 1925  TCCTCCAGGCTGGCTGCTGAGGT  1947