Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07112
• Subject: NM_001261445.2
• Aligned Length: 1647
• Identities: 1494
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGGACGGTCGGGCCCTGGAAGGAACGCTCTCGGAATTGGCCGCGGAAACCGATCTGCCCGTTGTGTTTGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAAACAGAGAAAGATAGGCGGCCATGGTCCAACCTTGAAGGCTTATCAGGAGGGCAGACTTCAAAAGCTACTAA  148

Query    1  --ATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGGAGGT  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGGAGGT  222

Query   73  CTGGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCCCTCT  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCCCTCT  296

Query  147  TGGAACTAGATGGGGTCTTGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAAGCAG  220
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAACTAGATGGGGTCTCGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAAGCAG  370

Query  221  CTTTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGATTGG  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTTTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGATTGG  444

Query  295  GACAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGGAGAA  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGGAGAA  518

Query  369  AAAAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAAGGCA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAAGGCA  592

Query  443  AAGAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCCTGGT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCCTGGT  666

Query  517  GACAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTGTTGG  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTGTTGG  740

Query  591  AGCATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTTAGGT  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTTAGGT  814

Query  665  CCATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCATCAAG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCATCAAG  888

Query  739  TTTATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAGTAGC  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAGTAGC  962

Query  813  TCAGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGATGCTT  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGATGCTT  1036

Query  887  GCACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCACAGAT  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCACAGAT  1110

Query  961  GAAGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCCCAGT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCCCAGT  1184

Query 1035  TGCAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAAAATG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAAAATG  1258

Query 1109  TTCCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAAGTTT  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAAGTTT  1332

Query 1183  GGGGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATAACAA  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATAACAA  1406

Query 1257  CAAATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGTCCAA  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGTCCAA  1480

Query 1331  ATGCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAGCACA  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAGCACA  1554

Query 1405  ATTGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCT  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCT  1628

Query 1479  CCAGGCTGGCTNCTGNGGT  1497
            |||||||||||.|||.|||
Sbjct 1629  CCAGGCTGGCTGCTGAGGT  1647