Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07112
• Subject: NM_001261446.2
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1380
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGGAGGTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCCCTCTTG  148
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCCCTCTTG  34

Query  149  GAACTAGATGGGGTCTTGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAAGCAGCT  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  GAACTAGATGGGGTCTCGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAAGCAGCT  108

Query  223  TTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGATTGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  TTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGATTGGGA  182

Query  297  CAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGGAGAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  CAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGGAGAAAA  256

Query  371  AAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAAGGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  AAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAAGGCAAA  330

Query  445  GAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCCTGGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  GAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCCTGGTGA  404

Query  519  CAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTGTTGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  CAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTGTTGGAG  478

Query  593  CATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTTAGGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  CATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTTAGGTCC  552

Query  667  ATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCATCAAGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  ATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCATCAAGTT  626

Query  741  TATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAGTAGCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  TATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAGTAGCTC  700

Query  815  AGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGATGCTTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  AGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGATGCTTGC  774

Query  889  ACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCACAGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  ACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCACAGATGA  848

Query  963  AGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCCCAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  AGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCCCAGTTG  922

Query 1037  CAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAAAATGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  CAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAAAATGTT  996

Query 1111  CCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAAGTTTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  CCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAAGTTTGG  1070

Query 1185  GGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATAACAACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  GGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATAACAACA  1144

Query 1259  AATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGTCCAAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  AATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGTCCAAAT  1218

Query 1333  GCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAGCACAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219  GCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAGCACAAT  1292

Query 1407  TGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293  TGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCTCC  1366

Query 1481  AGGCTGGCTNCTGNGGT  1497
            |||||||||.|||.|||
Sbjct 1367  AGGCTGGCTGCTGAGGT  1383