Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07112
• Subject: NM_182742.3
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1494
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGGAGGTCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACGGCCCTGAAGATCTTCCCAAGTCCTATGACTATGACCTTATCATCATTGGAGGTGGCTCAGGAGGTCT  74

Query   75  GGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCCCTCTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGCTGCTAAGGAGGCAGCCCAATATGGCAAGAAGGTGATGGTCCTGGACTTTGTCACTCCCACCCCTCTTG  148

Query  149  GAACTAGATGGGGTCTTGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAAGCAGCT  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAACTAGATGGGGTCTCGGAGGAACATGTGTGAATGTGGGTTGCATACCTAAAAAACTGATGCATCAAGCAGCT  222

Query  223  TTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGATTGGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGTTAGGACAAGCCCTGCAAGACTCTCGAAATTATGGATGGAAAGTCGAGGAGACAGTTAAGCATGATTGGGA  296

Query  297  CAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGGAGAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAATGATAGAAGCTGTACAGAATCACATTGGCTCTTTGAATTGGGGCTACCGAGTAGCTCTGCGGGAGAAAA  370

Query  371  AAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAAGGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCGTCTATGAGAATGCTTATGGGCAATTTATTGGTCCTCACAGGATTAAGGCAACAAATAATAAAGGCAAA  444

Query  445  GAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCCTGGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAAATTTATTCAGCAGAGAGATTTCTCATTGCCACTGGTGAAAGACCACGTTACTTGGGCATCCCTGGTGA  518

Query  519  CAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTGTTGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAAGAATACTGCATCAGCAGTGATGATCTTTTCTCCTTGCCTTACTGCCCGGGTAAGACCCTGGTTGTTGGAG  592

Query  593  CATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTTAGGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATCCTATGTCGCTTTGGAGTGCGCTGGATTTCTTGCTGGTATTGGTTTAGACGTCACTGTTATGGTTAGGTCC  666

Query  667  ATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCATCAAGTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCTTCTTAGAGGATTTGACCAGGACATGGCCAACAAAATTGGTGAACACATGGAAGAACATGGCATCAAGTT  740

Query  741  TATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAGTAGCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATAAGACAGTTCGTACCAATTAAAGTTGAACAAATTGAAGCAGGGACACCAGGCCGACTCAGAGTAGTAGCTC  814

Query  815  AGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGATGCTTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTCCACCAATAGTGAGGAAATCATTGAAGGAGAATATAATACGGTGATGCTGGCAATAGGAAGAGATGCTTGC  888

Query  889  ACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCACAGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAGAAAAATTGGCTTAGAAACCGTAGGGGTGAAGATAAATGAAAAGACTGGAAAAATACCTGTCACAGATGA  962

Query  963  AGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCCCAGTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAACAGACCAATGTGCCTTACATCTATGCCATTGGCGATATATTGGAGGATAAGGTGGAGCTCACCCCAGTTG  1036

Query 1037  CAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAAAATGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAATCCAGGCAGGAAGATTGCTGGCTCAGAGGCTCTATGCAGGTTCCACTGTCAAGTGTGACTATGAAAATGTT  1110

Query 1111  CCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAAGTTTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAACCACTGTATTTACTCCTTTGGAATATGGTGCTTGTGGCCTTTCTGAGGAGAAAGCTGTGGAGAAGTTTGG  1184

Query 1185  GGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATAACAACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAGAAAATATTGAGGTTTACCATAGTTACTTTTGGCCATTGGAATGGACGATTCCGTCAAGAGATAACAACA  1258

Query 1259  AATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGTCCAAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATGTTATGCAAAAATAATCTGTAATACTAAAGACAATGAACGTGTTGTGGGCTTTCACGTACTGGGTCCAAAT  1332

Query 1333  GCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAGCACAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGGAGAAGTTACACAAGGCTTTGCAGCTGCGCTCAAATGTGGACTGACCAAAAAGCAGCTGGACAGCACAAT  1406

Query 1407  TGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGAATCCACCCTGTCTGTGCAGAGGTATTCACAACATTGTCTGTGACCAAGCGCTCTGGGGCAAGCATCCTCC  1480

Query 1481  AGGCTGGCTNCTGNGGT  1497
            |||||||||.|||.|||
Sbjct 1481  AGGCTGGCTGCTGAGGT  1497