Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07131
• Subject: XM_006515812.2
• Aligned Length: 1324
• Identities: 1010
• Gaps: 140

Alignment

Query    1  ATGCCTCGTGTAAAAGCAGCTCAAGCTGGAAGACAGAGCTCTGCAAAGAGACATCTTGCAGAACAATTTGCAGT  74
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||...|..||||.|||||.|..||.|||||.||.|||||.|.
Sbjct    1  ATGCCCCGTGTAAAAGCAGCTCAGGCTGGAAGACCCGGACCTGCGAAGAGGCGCCTCGCAGAGCAGTTTGCCGC  74

Query   75  TGGAGAGATAATAACTGACATGGCAAAAAAGGAATGGAAAGTAGGATTACCCATTGGCCAAGGAGGCTTTGGCT  148
            |||||||.|..||||.||||||.|.|..|||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGGAGAGGTCCTAACCGACATGTCTAGGAAGGAGTGGAAACTAGGATTGCCCATTGGCCAAGGTGGCTTTGGCT  148

Query  149  GTATATATCTTGCTGATATGAATTCTTCAGAGTCAGTTGGCAGTGATGCACCTTGTGTTGTAAAAGTGGAACCC  222
            |.||.|||||.||.||.|..||||||||..|..|.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  GCATCTATCTGGCGGACACAAATTCTTCCAAACCGGTTGGCAGTGACGCGCCCTGTGTTGTGAAAGTGGAACCC  222

Query  223  AGTGACAATGGACCTCTTTTTACTGAATTAAAGTTCTACCAACGAGCTGCAAAACCAGAGCAAATTCAGAAATG  296
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGACAATGGACCTCTTTTCACGGAATTAAAGTTCTACCAGAGGGCTGCTAAACCAGAGCAAATTCAGAAATG  296

Query  297  GATTCGTACCCGTAAGCTGAAGTACCTGGGTGTTCCTAAGTATTGGGGGTCTGGTCTACATGACAAAAATGGAA  370
            |||||||||.|.|||..||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  GATTCGTACACATAAATTGAAGTACCTTGGTGTTCCTAAGTATTGGGGATCTGGTCTACATGATAAAAATGGAA  370

Query  371  AAAGTTACAGGTTTATGATAATGGATCGCTTTGGGAGTGACCTTCAGAAAATATATGAAGCAAATGCCAAAAGG  444
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAGTTACAGGTTTATGATAATGGACCGCTTTGGGAGTGACCTTCAGAAAATATATGAAGCAAATGCCAAAAGG  444

Query  445  TTTTCTCGGAAAACTGTCTTGCAGCTAAGCTTAAGAATTCTGGATATTCTGGAATATATTCACGAGCATGAATA  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct  445  TTTTCTCGGAAAACTGTATTGCAGCTAAGCTTAAGAATTCTGGATATCCTGGAGTACATCCATGAGCATGAGTA  518

Query  519  TGTGCATGGAGATATCAAGGCCTCAAATCTTCTTCTGAACTACAAGAATCCTGACCAGGTGTACTTGGTAGATT  592
            .|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||...|||||||.|||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  519  CGTGCACGGGGACATCAAGGCCTCCAACCTGCTCCTGAGTCACAAGAACCCTGACCAGGTATATTTGGTAGACT  592

Query  593  ATGGCCTTGCTTATCGGTACTGCCCAGAAGGAGTTCATAAAGAATACAAAGAAGACCCCAAAAGATGTCACGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  593  ATGGCCTTGCTTATCGGTACTGCCCAGATGGAGTTCATAAAGAGTACAAGGAAGATCCCAAAAGGTGCCATGAC  666

Query  667  GGCACTATTGAATTCACGAGCATCGATGCACACAATGGTGTGGCCCCATCAAGACGTGGTGATTTGGAAATACT  740
            |||||..|.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCACCCTGGAGTTCACCAGCATCGACGCTCACAAAGGCGTGGCCCCATCAAGACGTGGTGATTTGGAAATACT  740

Query  741  TGGTTATTGCATGATCCAATGGCTTACTGGCCATCTTCCTTGGGAGGATAATTTGAAAGATCCTAAATATGTTA  814
            ||||||||||||||||||.|||||.|..|||..||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  741  TGGTTATTGCATGATCCAGTGGCTCAGCGGCTGTCTTCCTTGGGAAGATAACTTGAAAGATCCTAACTACGTTA  814

Query  815  GAGATTCCAAAATTAGATACAGAGAAAATATTGCAAGTTTGATGGACAAATGTTTTCCTGAGAAAAACAAACCA  888
            |.|||||||||||||||||||||||.||..|.|||..|||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  815  GGGATTCCAAAATTAGATACAGAGACAACGTCGCAGCTTTGATGGAGAAATGCTTTCCTGAGAAAAATAAGCCA  888

Query  889  GGTGAAATTGCCAAATACATGGAAACAGTGAAATTACTAGACTACACTGAAAAACCTCTTTATGAAAATTTACG  962
            |||||.||.||.||.||||||||..|.||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||..||||
Sbjct  889  GGTGAGATCGCTAAGTACATGGAGTCTGTGAAACTACTGGAATACACCGAAAAACCTCTCTATCAAAACCTACG  962

Query  963  TGACATTCTTTTGCAAGGACTAAAAGCTATAGGAAGTAAGGATGATGGCAAATTGGACCTCAGTGTTGTGGAGA  1036
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||..|.||||.||||||||
Sbjct  963  TGATATCCTTTTACAAGGACTAAAAGCTATAGGAAGTAAAGACGACGGCAAACTGGATTTTAGTGCTGTGGAGA  1036

Query 1037  ATGGAGGTTTGAAAGCAAAAACAATAACAAAGAAGCGAAAGAAAGAAATTGAAGAAAGCAAGGAACCT----GG  1106
            |.|||.||.||||..|||.|.||....||||||||||.|||||||||...|||||||||..||    |    |.
Sbjct 1037  ACGGAAGTGTGAAGACAAGACCAGCCTCAAAGAAGCGGAAGAAAGAAGCAGAAGAAAGCGCGG----TGTGCGC  1106

Query 1107  TGTTGAAGATACGGAATGGTCAAACACACAG--------------ACAGA----------GGAG---------G  1147
            |||.||.||.|.|||.||.|||.||||||||              |||||          ||||         |
Sbjct 1107  TGTGGAGGACATGGAGTGCTCAGACACACAGGTGCAAGAGGCCGCACAGACCCGAAGTGTGGAGTCCCAAGGAG  1180

Query 1148  CCATAC--------------------------------------------------------------------  1153
            |.||||                                                                    
Sbjct 1181  CAATACATGGAAGCATGTCTCAGCCAGCGGCGGGCTGCAGCAGCTCTGACAGTTCCAGGAGGCAGCAGCATTTG  1254

Query 1154  --------------------------AGACC-----CGTTCAAGAACCAGAAAGAGAGTCCAGAAG  1188
                                      |||||     .|||||.||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1255  GGATTGGAACAAGACATGCTAAGGCTAGACCGTAGGGGTTCACGAACCAGAAAGAAAGCCCAGAAG  1320