Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07162
- Subject:
- XM_011527286.2
- Aligned Length:
- 2191
- Identities:
- 1549
- Gaps:
- 413
Alignment
Query 1 ATGATTTCACCTTCACTTGAACTGCTTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAAAATGACCAC 74
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGACCAC 8
Query 75 ATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG 148
.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||.||
Sbjct 9 GTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCTGGACCTTG 82
Query 149 CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTC 222
||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||.||
Sbjct 83 CCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAATCACTC 156
Query 223 CACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGA 295
|||..||||||||||||||| ||.|.|||| |||||||||||||.||||.|||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 157 CACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGA 229
Query 296 ATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAG 369
|||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||..|.||.|.||||.
Sbjct 230 ATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGTTCAGTCAT 303
Query 370 CAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGG--AACAGCTCTCAGTTCTTC 441
||||..||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||| || |||||||.||||||||.|
Sbjct 304 CAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCAT--GGTAAACAGCTTTCAGTTCTCC 375
Query 442 AAAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCAACAGAAACCTTACCGTTG 515
|||.|||.||||.|.|||||||||.||||.|||.||||||||||||.||||||...||||||||||| |.|..|
Sbjct 376 AAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCTT-CTGAGG 448
Query 516 TAATGA-ATGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAGAAA 588
..|.|| .||||||.|||||.|.||||||||.||.|||.|||||||||||||||||..|||.|||.|||||||.
Sbjct 449 GTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAAGAGAGAAG 522
Query 589 TCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCATAT 662
|||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||||||.||.||
Sbjct 523 TCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGAGTTCACAT 596
Query 663 GGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGA 736
|||.||.|||..||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 597 GGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAATTCATCAGA 670
Query 737 GAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAACGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAGCACTTAAT 810
||.||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||||||...|.|||||||||.||||.||
Sbjct 671 GAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAGGACTTTAT 744
Query 811 GTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATTCATGATTC 884
||||||.|.|||||.||||||||||.|||||||.|||.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 745 GTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTC 818
Query 885 ACAGCTTCAGGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCTTCC 958
.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 819 CCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAAGAGCTTCC 892
Query 959 GTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATACATGTGGC 1032
||..||||.|||..|||||||||||||||||||||||||...||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 893 GTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATACATGTGGT 966
Query 1033 AAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATACAAATGTGA 1106
||||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.||.||||||.|..|||||||||||
Sbjct 967 AAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTACAAATGTGA 1040
Query 1107 GCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGAGAAACCAT 1180
|.|||||||||||.|||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||||
Sbjct 1041 GGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGAGAAGCCAT 1114
Query 1181 ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCCACAGTGGA 1254
|||||||||||||||||||.||||.||||||||||.|||||.||||||..|..|||..||.|||||||||||||
Sbjct 1115 ATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCCACAGTGGA 1188
Query 1255 CAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCATCAGAGATC 1328
.|.|.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.||.||||||.|
Sbjct 1189 GAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCACCAGAGAGC 1262
Query 1329 CCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCTTGAGTTTC 1402
.||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1263 GCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTGACTTTC 1336
Query 1403 ACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCCTGT 1476
|.|||||||||||||..||.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1337 ATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCGTGT 1410
Query 1477 CTTTTGAAACATCAG----------------------------------------------------------- 1491
||||||||.||||||
Sbjct 1411 CTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGATTTACTCA 1484
Query 1492 -------------------------AGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAGA 1540
|||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1485 GAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAAA 1558
Query 1541 GATTTACTCAGAGTACACAACTTCATTCCCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAATGTGAGCAG 1614
||||||||||||.|.||||||||.||||.||||..|.|..|||.|||||||.|||||.||||||||||||..||
Sbjct 1559 GATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAATGTGAAGAG 1632
Query 1615 TGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACAGGGGAGAGCGACCCTATAA 1688
||||.||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.||||.|||||
Sbjct 1633 TGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGACCTTATAA 1706
Query 1689 TTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGAGAAA 1762
||||||.||||||||.|||||||||.||.||||.|||.||.|||||||.|||.||||||||||..|||..||||
Sbjct 1707 TTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGGTGATGAAA 1780
Query 1763 AGCCATTGAAATCTG--GAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGTAAG---TC 1831
|||||||.||||.|| ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||..|||||| || ||
Sbjct 1781 AGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAG--AGGGTTC 1852
Query 1832 TATGTGGGAGAAAAGCCATA------------------------------------------------------ 1851
....|||| |||||||||||
Sbjct 1853 ACACTGGG-GAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAACCCA 1925
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 1926 TCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTCATGCC 1999
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2000 TTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGG 2073
Query 1852 --------------------------------------------- 1851
Sbjct 2074 CGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA 2118