Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07185
Subject:
NM_001308217.1
Aligned Length:
425
Identities:
320
Gaps:
59

Alignment

Query   1  ----------MQVSIACTEHNLKSRN-------GEDRL------LSKQSSTAPNVVNAARAKFRTVAIIAR-SL  50
                     .|.|    |.|.|.|.       |.|..      ..|.||..|......||  |..|.... ..
Sbjct   1  MLAARTGAAGSQIS----EENTKLRRQSGFSVAGKDKSPKKASENAKDSSLSPSGESQLRA--RQLALLREVEM  68

Query  51  GTFTPQHHISLKESTAKQTGMKYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQISDEVAERLMTIAYESGVNLFDTAEVY  124
           .........|....|...|||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  69  NWYLKLCDLSSEHTTVCTTGMPHRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQISDEVAERLMTIAYESGVNLFDTAEVY  142

Query 125  AAGKAEVILGSIIKKKGWRRSSLVITTKLYWGGKAETERGLSRKHIIEGLKGSLQRLQLEYVDVVFANRPDSNT  198
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 143  AAGKAEVILGSIIKKKGWRRSSLVITTKLYWGGKAETERGLSRKHII---------------------------  189

Query 199  PMEEIVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSAMEIMEAYSVARQFNMIPPVCEQAEYHLFQREKVEVQLPELYHKIGV  272
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190  --EEIVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSAMEIMEAYSVARQFNMIPPVCEQAEYHLFQREKVEVQLPELYHKIGV  261

Query 273  GAMTWSPLACGIISGKYGNGVPESSRASLKCYQWLKERIVSEEGRKQQNKLKDLSPIAERLGCTLPQLAVAWCL  346
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262  GAMTWSPLACGIISGKYGNGVPESSRASLKCYQWLKERIVSEEGRKQQNKLKDLSPIAERLGCTLPQLAVAWCL  335

Query 347  RNEGVSSVLLGSSTPEQLIENLGAIQVLPKMTSHVVNEIDNILRNKPYSKKDYRS  401
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336  RNEGVSSVLLGSSTPEQLIENLGAIQVLPKMTSHVVNEIDNILRNKPYSKKDYRS  390