Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07185
- Subject:
- XM_006501057.1
- Aligned Length:
- 1275
- Identities:
- 1033
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 ATGCAAGTCTCCATA-----GCCTGCACAGA------------------------GCACAATT----TGAAGAG 41
||||| |||..||| |||||..|||| ||.|||.| ||||
Sbjct 1 ATGCA--TCTTTATAAACCTGCCTGTGCAGACATGCCCAGTCCAAAGCTGGGTCTGCCCAAATCCAGTGAA--- 69
Query 42 TCGG------AATGGTGAGGACCG-----ACTT----CTGAGCAAG---CA--------GAGCTCCACCGCCC- 88
||.| |||| ||| |||| ||||.|||| || |||| |..|.|.||
Sbjct 70 TCAGCCCTAAAATG-------CCGGCGGCACTTAGCACTGACCAAGACTCAGCCTCAGGGAGC-CTGCTGGCCT 135
Query 89 ------CCAATGTGGTAAAC-GCAGCCCGGGCCAAATTCCGCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCCTGGGGAC 155
|||| |||| ||| .|||...|| |||| ||||||.||.
Sbjct 136 GTTAGACCAA-GTGG--AACTACAGAATGG---AAAT---------------------------GCCTGGAGAA 176
Query 156 GTT--CACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACC---GCAAAGCAGACTGGCATGAAATATAGGAA 224
||| .||||.|| |||....||||..|.||.||..||||| |||| ||||.||||||..|||.|||||
Sbjct 177 GTTTCTACGCGTC--CATGGAGTTTCATTGAAGGAAACCACCAAGGCAA---AGACAGGCATGGCATACAGGAA 245
Query 225 TCTTGGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTCAG 298
||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 246 TCTTGGGAAATCAGGACTCAGAGTTTCATGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATCTCAG 319
Query 299 ATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTAT 372
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||
Sbjct 320 ATGAGGTTGCTGAACGGCTGATGACAATTGCCTACGAAAGTGGAGTTAATCTCTTCGACACAGCTGAGGTCTAT 393
Query 373 GCTGCTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTCAT 446
||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 394 GCTGCTGGGAAGGCTGAGGTGATTCTGGGAAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGCTTGGTCAT 467
Query 447 AACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAGGAT 520
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.
Sbjct 468 CACAACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAGACAGAAAGGGGACTGTCAAGAAAGCACATCATTGAAGGAC 541
Query 521 TGAAGGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAACACT 594
||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 542 TGAAAGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAACTGGAATACGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGCCCAGACAGCAACACT 615
Query 595 CCCATGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAG 668
||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 616 CCCATGGAAGAAATCGTTCGAGCCATGACGCACGTGATCAACCAAGGCATGGCCATGTACTGGGGCACCTCGAG 689
Query 669 ATGGAGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGAAC 742
.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 690 GTGGAGCGCGATGGAGATCATGGAAGCCTACTCTGTCGCACGGCAGTTCAACATGATCCCGCCTGTCTGTGAGC 763
Query 743 AAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTGTT 816
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 764 AAGCTGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAGGTGGAGGTCCAGCTGCCGGAGCTCTACCATAAAATAGGAGTT 837
Query 817 GGCGCAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTC 890
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 838 GGTGCAATGACATGGTCTCCACTTGCTTGTGGAATTATTTCAGGAAAATATGGAAATGGGGTGCCAGAAAGTTC 911
Query 891 CAGGGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAACA 964
.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 TAGAGCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAGGAAAGAATCGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAACA 985
Query 965 AGCTAAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCCTG 1038
||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 986 AGCTGAAAGACCTCTCTCCAATCGCTGAGCGCCTGGGGTGCACGCTACCTCAGCTGGCTGTGGCGTGGTGCCTG 1059
Query 1039 AGAAACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCCAT 1112
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 AGAAATGAGGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCGGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCCAT 1133
Query 1113 TCAGGTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAGCA 1186
||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 TCAGGTCCTCCCTAAGATGACATCTCACGTGGTGAACGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAGCA 1207
Query 1187 AGAAGGACTATAGATCA 1203
|.|||||||||||||||
Sbjct 1208 AAAAGGACTATAGATCA 1224