Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07304
Subject:
NM_003842.5
Aligned Length:
1320
Identities:
1318
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGAACAACGGGGACAGAACGCCCCGGCCGCTTCGGGGGCCCGGAAAAGGCACGGCCCAGGACCCAGGGAGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAACAACGGGGACAGAACGCCCCGGCCGCTTCGGGGGCCCGGAAAAGGCACGGCCCAGGACCCAGGGAGGC  74

Query   75  GCGGGGAGCCAGGCCTGGGCTCCGGGTCCCCAAGACCCTTGTGCTCGTTGTCGCCGCGGTCCTGCTGTTGGTCT  148
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGGGGAGCCAGGCCTGGGCCCCGGGTCCCCAAGACCCTTGTGCTCGTTGTCGCCGCGGTCCTGCTGTTGGTCT  148

Query  149  CAGCTGAGTCTGCTCTGATCACCCAACAAGACCTAGCTCCCCAGCAGAGAGCGGCCCCACAACAAAAGAGGTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCTGAGTCTGCTCTGATCACCCAACAAGACCTAGCTCCCCAGCAGAGAGCGGCCCCACAACAAAAGAGGTCC  222

Query  223  AGCCCCTCAGAGGGATTGTGTCCACCTGGACACCATATCTCAGAAGACGGTAGAGATTGCATCTCCTGCAAATA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCCCTCAGAGGGATTGTGTCCACCTGGACACCATATCTCAGAAGACGGTAGAGATTGCATCTCCTGCAAATA  296

Query  297  TGGACAGGACTATAGCACTCACTGGAATGACCTCCTTTTCTGCTTGCGCTGCACCAGGTGTGATTCAGGTGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGACAGGACTATAGCACTCACTGGAATGACCTCCTTTTCTGCTTGCGCTGCACCAGGTGTGATTCAGGTGAAG  370

Query  371  TGGAGCTAAGTCCCTGCACCACGACCAGAAACACAGTGTGTCAGTGCGAAGAAGGCACCTTCCGGGAAGAAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAGCTAAGTCCCTGCACCACGACCAGAAACACAGTGTGTCAGTGCGAAGAAGGCACCTTCCGGGAAGAAGAT  444

Query  445  TCTCCTGAGATGTGCCGGAAGTGCCGCACAGGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCGGTGATTGTACACCCTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTCCTGAGATGTGCCGGAAGTGCCGCACAGGGTGTCCCAGAGGGATGGTCAAGGTCGGTGATTGTACACCCTG  518

Query  519  GAGTGACATCGAATGTGTCCACAAAGAATCAGGTACAAAGCACAGTGGGGAAGCCCCAGCTGTGGAGGAGACGG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGTGACATCGAATGTGTCCACAAAGAATCAGGTACAAAGCACAGTGGGGAAGTCCCAGCTGTGGAGGAGACGG  592

Query  593  TGACCTCCAGCCCAGGGACTCCTGCCTCTCCCTGTTCTCTCTCAGGCATCATCATAGGAGTCACAGTTGCAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACCTCCAGCCCAGGGACTCCTGCCTCTCCCTGTTCTCTCTCAGGCATCATCATAGGAGTCACAGTTGCAGCC  666

Query  667  GTAGTCTTGATTGTGGCTGTGTTTGTTTGCAAGTCTTTACTGTGGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGAAAGGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTAGTCTTGATTGTGGCTGTGTTTGTTTGCAAGTCTTTACTGTGGAAGAAAGTCCTTCCTTACCTGAAAGGCAT  740

Query  741  CTGCTCAGGTGGTGGTGGGGACCCTGAGCGTGTGGACAGAAGCTCACAACGACCTGGGGCTGAGGACAATGTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGCTCAGGTGGTGGTGGGGACCCTGAGCGTGTGGACAGAAGCTCACAACGACCTGGGGCTGAGGACAATGTCC  814

Query  815  TCAATGAGATCGTGAGTATCTTGCAGCCCACCCAGGTCCCTGAGCAGGAAATGGAAGTCCAGGAGCCAGCAGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAATGAGATCGTGAGTATCTTGCAGCCCACCCAGGTCCCTGAGCAGGAAATGGAAGTCCAGGAGCCAGCAGAG  888

Query  889  CCAACAGGTGTCAACATGTTGTCCCCCGGGGAGTCAGAGCATCTGCTGGAACCGGCAGAAGCTGAAAGGTCTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAACAGGTGTCAACATGTTGTCCCCCGGGGAGTCAGAGCATCTGCTGGAACCGGCAGAAGCTGAAAGGTCTCA  962

Query  963  GAGGAGGAGGCTGCTGGTTCCAGCAAATGAAGGTGATCCCACTGAGACTCTGAGACAGTGCTTCGATGACTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGGAGGAGGCTGCTGGTTCCAGCAAATGAAGGTGATCCCACTGAGACTCTGAGACAGTGCTTCGATGACTTTG  1036

Query 1037  CAGACTTGGTGCCCTTTGACTCCTGGGAGCCGCTCATGAGGAAGTTGGGCCTCATGGACAATGAGATAAAGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGACTTGGTGCCCTTTGACTCCTGGGAGCCGCTCATGAGGAAGTTGGGCCTCATGGACAATGAGATAAAGGTG  1110

Query 1111  GCTAAAGCTGAGGCAGCGGGCCACAGGGACACCTTGTACACGATGCTGATAAAGTGGGTCAACAAAACCGGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTAAAGCTGAGGCAGCGGGCCACAGGGACACCTTGTACACGATGCTGATAAAGTGGGTCAACAAAACCGGGCG  1184

Query 1185  AGATGCCTCTGTCCACACCCTGCTGGATGCCTTGGAGACGCTGGGAGAGAGACTTGCCAAGCAGAAGATTGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATGCCTCTGTCCACACCCTGCTGGATGCCTTGGAGACGCTGGGAGAGAGACTTGCCAAGCAGAAGATTGAGG  1258

Query 1259  ACCACTTGTTGAGCTCTGGAAAGTTCATGTATCTAGAAGGTAATGCAGACTCTGCCATGTCC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCACTTGTTGAGCTCTGGAAAGTTCATGTATCTAGAAGGTAATGCAGACTCTGCCATGTCC  1320