Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07314
- Subject:
- XM_030246641.1
- Aligned Length:
- 3033
- Identities:
- 2181
- Gaps:
- 528
Alignment
Query 1 ATGCCGGACCAGATCTCCGTGTCGGAATTCGTGGCCGAGACCCATGAGGACTACAAGGCGCCCACGGCCTCCAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTCACCACCCGCACGGCGCAGTGCCGGAACACTGTGGCGGCCATCGAGGAGGCTTTGGACGTGGACCGGATGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTCTTTACAAAATGAAGAAATCCGTGAAAGCAATCAACAGCTCTGGGCTGGCTCACGTGGAAAATGAAGAGCAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACACCCAGGCTCTGGAGAAGTTTGGCGGCAACCGTGTATGCAGAGATGACCCAGATTTAGGAAGTGCGTTCCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GAAGTTCTCAGTGTTTACAAAGGAGTTGACAGCACTTTTCAAAAACCTGATTCAGAATATGAACAACATAATCT 370
|||||||||||.||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------ATGAACAACATCATCT 16
Query 371 CCTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAGGGGGACCTGAAAGGAGTGAAAGGGGATCTGAAAAAGCCTTTTGATAAA 444
|.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 17 CGTTCCCTTTGGACAGTTTGCTGAAAGGAGATCTGAAAGGAGTAAAAGGGGATCTGAAAAAGCCCTTTGATAAA 90
Query 445 GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAGATAGAAAAGGAGAAAAAGGAACACGCCAAGCTCCATGGGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 91 GCTTGGAAGGACTATGAAACAAAAATAACCAAAATAGAAAAGGAGAAAAAGGAGCATGCCAAGCTCCACGGGAT 164
Query 519 GATTCGGACTGAAATAAGCGGAGCGGAAATTGCCGAAGAGATGGAAAAGGAGAGGCGCTTCTTCCAGCTACAGA 592
||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 165 GATTCGTACTGAAATAAGCGGGGCTGAGATTGCAGAGGAGATGGAGAAGGAAAGACGGTTCTTCCAGCTGCAGA 238
Query 593 TGTGCGAGTATCTGCTGAAGGTCAACGAAATCAAGATTAAAAAGGGAGTAGATTTACTTCAGAATCTGATCAAA 666
||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 239 TGTGTGAGTACCTGCTGAAGGTCAATGAAATCAAGGTGAAAAAGGGAGTGGATTTGCTTCAGAATCTGATCAAG 312
Query 667 TACTTTCATGCCCAATGCAATTTTTTTCAGGATGGACTCAAAGCCGTGGAAAGCCTCAAACCTTCCATTGAAAC 740
||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 313 TACTTTCACGCCCAGTGCAATTTTTTCCAGGATGGATTGAAAGCAGTAGAAAGCCTCAAGCCTTCCATCGAGAC 386
Query 741 GCTGTCTACGGATCTTCACACGATCAAACAGGCCCAGGATGAAGAAAGAAGGCAGTTGATACAGCTTCGAGATA 814
|||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|..|.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct 387 GCTCTCCACGGACCTCCACACCATCAAACAGGCCCAGGATGAGGAACGGCGACAGCTGATACAACTTCGAGATA 460
Query 815 TTTTGAAATCCGCATTGCAGGTTGAACAGAAAGAG---------GACTCCCAAATTCGTCAGAGCACAGCTTAT 879
|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||| |||||.|||.||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 461 TTTTGAAGTCAGCATTGCAGGTGGAACAGAAAGAGTCTAGGAGAGACTCACAACTTCGCCAAAGTACAGCCTAC 534
Query 880 AGCTTACATCAGCCTCAGGGAAACAAGGAACATGGGACCGAGCGGAACGGCAGCCTCTACAAGAAGAGTGACGG 953
|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||.|.|||||||||||||||.||.||
Sbjct 535 AGCTTACATCAACCTCAGGGAAACAAGGAGCATGGAACAGAGAGGAACGGGAACCTCTACAAGAAGAGCGATGG 608
Query 954 GATCCGAAAAGTGTGGCAGAAAAGGAAATGTTCAGTTAAAAATGGTTTTCTGACCATATCCCATGGTACCGCTA 1027
||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 609 GATCCGGAAAGTGTGGCAGAAGAGGAAGTGTTCCGTTAAAAATGGCTTCCTCACCATCTCCCACGGCACTGCCA 682
Query 1028 ACCGGCCTCCTGCAAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAACCCTGAGGAGAAGAAGTGCTTTGAC 1101
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 683 ACCGGCCACCTGCCAAGCTCAACCTGCTAACCTGCCAGGTGAAGACCAATCCTGAGGAGAAGAAGTGTTTCGAC 756
Query 1102 CTTATTTCACATGACAGAACTTACCACTTTCAAGCTGAAGATGAACAGGAATGTCAAATATGGATGTCTGTGCT 1175
||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 757 CTCATATCACATGACAGGACGTACCACTTCCAAGCGGAAGACGAACAAGAATGTCAGATATGGATGTCTGTACT 830
Query 1176 GCAAAATAGCAAAGAAGAAGCTTTAAACAATGCATTTAAGGGGGATGACAATACTGGAGAAAATAACATCGTCC 1249
|||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 GCAGAACAGCAAGGAAGAAGCTCTGAACAACGCCTTTAAGGGTGATGACAACACTGGAGAAAATAACATCGTCC 904
Query 1250 AAGAACTGACAAAGGAGATCATCTCAGAAGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTCTGCTGTGACTGTGGGGCG 1323
||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 905 AAGAGCTGACCAAGGAGATCATCTCGGAGGTGCAGAGGATGACGGGCAATGACGTGTGCTGCGACTGTGGGGCA 978
Query 1324 CCAGATCCTACATGGCTTTCCACCAACCTGGGCATCCTGACCTGCATCGAGTGTTCCGGAATCCACCGAGAGCT 1397
||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 979 CCAGATCCGACGTGGCTCTCTACCAACCTGGGCATCCTGACTTGCATCGAGTGCTCTGGGATCCACCGGGAGCT 1052
Query 1398 GGGGGTTCATTATTCCAGGATGCAGTCCCTGACCTTAGATGTACTGGGAACATCTGAGCTGCTGCTCGCCAAGA 1471
||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1053 GGGGGTTCATTACTCCAGGATGCAGTCCCTGACATTAGATGTATTGGGAACGTCTGAGCTTCTGCTTGCCAAGA 1126
Query 1472 ATATTGGGAATGCAGGCTTTAATGAGATCATGGAATGTTGCCTACCAGCTGAGGACTCAGTCAAACCCAACCCA 1545
||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||..||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1127 ATATCGGGAATGCAGGCTTTAATGAAATTATGGAGTGTTGCCTACCGTCTGAGGACCCAGTCAAGCCCAACCCA 1200
Query 1546 GGCAGCGACATGAATGCAAGAAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATCGAGAGGAGATACGCAAGGAAGAAGCA 1619
|||||.|||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||
Sbjct 1201 GGCAGTGACATGATTGCAAGGAAGGACTACATCACAGCCAAGTACATGGAGAGGAGATATGCACGGAAAAAGCA 1274
Query 1620 CGCGGATAACGCGGCGAAGCTTCACAGTCTTTGCGAGGCCGTCAAAACGAGAGATATTTTTGGATTGCTCCAAG 1693
.||.||.|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1275 TGCCGACACCGCGGCGAAGCTCCACAGCCTTTGCGAGGCCGTCAAGACCAGAGACATTTTTGGGTTACTCCAAG 1348
Query 1694 CTTATGCTGATGGTGTGGATCTTACGGAAAAAATCCCACTGGCCAACGGACATGAGCCGGATGAAACGGCCCTC 1767
|||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1349 CTTATGCTGATGGTGTGGACCTGACAGAGAAAATCCCACTGGCCAATGGGCATGAGCCAGATGAGACAGCCCTC 1422
Query 1768 CACCTTGCAGTCAGATCCGTGGATCGAACCTCTCTTCACATTGTAGACTTTTTAGTTCAGAACAGTGGGAACCT 1841
||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||..|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1423 CATCTTGCAGTCAGATCTGTGGACCGGACTTCCCTTCACATTGTAGACTTCCTGGTCCAGAACAGTGGGAACCT 1496
Query 1842 GGATAAACAGACAGGGAAAGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACCGACAATGCCGAGTGCCTCAAGT 1915
|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.
Sbjct 1497 GGATAAACAGACAGGCAAGGGCAGCACAGCCCTGCACTACTGCTGCCTGACAGACAATGCTGAGTGCCTCAAGC 1570
Query 1916 TGCTCCTGCGGGGGAAGGCCTCCATCGAGATAGCAAACGAGTCAGGAGAGACTCCGCTGGACATTGCCAAGCGC 1989
|.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.
Sbjct 1571 TCCTCCTGCGGGGAAAAGCCTCCATTGAGATAGCCAATGAGTCAGGAGAGACCCCGTTGGACATTGCTAAGCGG 1644
Query 1990 CTCAAGCACGAGCACTGTGAGGAGCTGCTGACCCAAGCCTTATCTGGAAGATTTAATTCTCACGTTCACGTTGA 2063
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1645 CTCAAGCACGAACACTGTGAGGAACTGCTCACTCAGGCCTTGTCGGGGCGGTTTAACTCCCATGTTCACGTCGA 1718
Query 2064 ATATGAATGGCGACTACTCCACGAAGACCTGGATGAAAGTGATGACGACATGGATGAGAAATTGCAGCCCAGTC 2137
.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..||||.|||||..|.|||||.||||
Sbjct 1719 GTATGAATGGCGGCTGCTGCACGAGGACCTGGATGAGAGCGACGACGATGTGGACGAGAAGCTACAGCCTAGTC 1792
Query 2138 CCAACCGGCGGGAAGACCGGCCCATCAGCTTCTACCAGCTGGGCTCCAACCAGCTTCAGTCTAACGCTGTATCT 2211
|||||||.|||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.||||.||||.|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1793 CCAACCGACGGGAGGACCGGCCTGTTAGCTTCTACCAGCTGGGGTCCAGCCAGTTTCAGTCCAATGCTGTGTCT 1866
Query 2212 TTGGCCAGAGATGCTGCAAACCTTGCCAAGGACAAGCAGA-GGGCTTTCATGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA 2284
||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||| ||||||| ..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 TTGGCCAGAGATACTGCAAACCTCACCAAGGACAAGCAGAGGGGCTTT-GGGCCCAGCATCTTGCAGAATGAGA 1939
Query 2285 CTTACGGAGCCCTCCTGAGTGGCAGCCCACCTCCCGCCCAGCCTGCAGCCCCCAGCACCACCAGCGCCCCCCCG 2358
|.||.||||||.||||||||||||||||.||..||.|||||.|...|.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1940 CCTATGGAGCCATCCTGAGTGGCAGCCCGCCCTCCTCCCAGTCAATACCCCCCAGCACCACCAGCGCACCCCCG 2013
Query 2359 CTTCCTCCACGGAATGTTGGCAAAG------------------------------------------------- 2383
||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2014 CTCCCACCTCGGAATGTTGGCAAAGTTCAGACAGCCACCTCAGCTAACACCCTGTGGAAGACAAACTCTGTAGG 2087
Query 2384 -------------------------------------------------------------------------- 2383
Sbjct 2088 TGTGGACGGTATCAGCAGGCAGCGATCTTCGTCAGATCTGCCAGCTGTCCACCCACCGCTGCCCCCTCTTCGAG 2161
Query 2384 ------------ATCCCCTGACCCCCACGCCGCCCCCACCCGTTGCCAAGACGCCCAGC-GTAA---TGGAAGC 2441
|||||||||||.||||.||.|||||.||.||.||.|||| ||.| |.|| |.|||||
Sbjct 2162 TGACATCTACCAATCCCCTGACCACCACACCACCCCCTCCTGTGGCTAAGA----CATCAGGAACTCTAGAAGC 2231
Query 2442 CTTGAGCCAGCCGAGCAAG-CCTGCCCCGCCTGGGATCTCACAGATCAGGCCCCCACCTCTGCCCCCACAGCCG 2514
|.|||.||||||||||||| ||| |||..|||||||.||||||||.||.||||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 2232 CATGAACCAGCCGAGCAAGTCCT-CCCAACCTGGGACCTCACAGAGCAAGCCCCCGCCCCTGCCACCTCAGCCA 2304
Query 2515 CCCAGCCGCCTCCCGCAGAAGAAGCCTGCGCCGGGGGCTGACAAGTCCACCCCACTGACCAACAAAGGCCAACC 2588
|||||||||||.||.||||||||.||.||..|.|||.||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2305 CCCAGCCGCCTGCCTCAGAAGAAACCAGCTTCCGGGACTGACAAGCCAACCCCGCTGACCAACAAAGGACAGCC 2378
Query 2589 GAGAGGACCTGTGGATCTCTCTGCAACGGAAGCTCTGGGTCCTCTGTCCAATGCTATGGTCCTGCAGCCCCCTG 2662
|||||||||| ||||||..|||||||||||||||.||.||||.||||||||||||.|
Sbjct 2379 GAGAGGACCT------------------GAAGCTTCGGGTCCTCTGTCCAACGCCATGGCCCTGCAGCCCCCAG 2434
Query 2663 CACCCATGCCTAGGAAGTCGCAGGCAACCAAGTTGAAGCCTAAGCGGGTGAAAGCGCTCTATAACTGTGTGGCT 2736
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2435 CACCCATGCCTAGGAAGTCACAGGCGACCAAGTCAAAGCCCAAGCGAGTGAAAGCACTCTACAACTGCGTGGCT 2508
Query 2737 GACAACCCCGATGAGCTCACCTTCTCCGAGGGGGATGTGATCATCGTGGACGGGGAGGAGGACCAGGAGTGGTG 2810
||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2509 GACAACCCAGACGAGCTGACTTTCTCTGAGGGCGACGTGATCATTGTGGATGGGGAAGAGGATCAGGAGTGGTG 2582
Query 2811 GATTGGCCACATTGATGGAGATCCTGGTCGCAAAGGCGCATTCCCGGTGTCATTTGTGCACTTTATCGCTGAC 2883
|||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 2583 GATCGGCCACATCGATGGAGAGCCCAGCCGCAAAGGAGCGTTTCCCGTATCGTTTGTGCACTTTATTGCTGAC 2655