Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07330
- Subject:
- NM_001130190.1
- Aligned Length:
- 1335
- Identities:
- 1163
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT 74
||||.|||...|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1 ATGCTATTATTCTGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCTTGTGCTTGGACGGGAAAGGGTCGGGGGACACTCAAGAT 74
Query 75 GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACAGTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAGTG 148
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||.||.||||..|
Sbjct 75 GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTACTGACAGTGTACACTCTTTTCTCCAAGGTGCACTCTGACCGGAACG 148
Query 149 TATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTAC 222
|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 TGTACCCATCTGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTGTTGGAGAGAGAGTATTTTAAGGGTGAATTTCCACCTTAT 222
Query 223 CCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGG 296
|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||
Sbjct 223 CCAAAGCCTGGGGAGGTTAGTAATGATCCCATAACATTTAACACAAATTTAATGGGCTACCCAGATAGACCTGG 296
Query 297 ATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGG 370
||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGGCTTCGATATATCCAAAGGACCCCGTACAGTGATGGAGTCCTGTATGGGTCTCCAACAGCTGAAAATGTGG 370
Query 371 GGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATT 444
||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 GGAAACCAACTATTATTGAGATAACTGCCTACAATAGACGTACCTTTGAGACTGCAAGGCATAACTTGATAATT 444
Query 445 AATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGA 518
|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445 AATATAATGTCAGCAGAAGAATTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATCAAAAATATGAATGTGGAAGA 518
Query 519 AATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACG 592
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 AATGTTGGCCAGCGAGGTTCTTGGAGACTTTCTCGGGGCTGTAAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTCAACG 592
Query 593 CCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTT 666
|||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 593 CCATAAACATCACGTCAGCCCTGGATAGGGGTGGCAGAGTGCCGCTTCCTATTAATGACATGAAGGAGGGTGTT 666
Query 667 TATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAG 740
|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 667 TATGTCATGGTTGGTGCCGATGTTGCATTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAGTTAAG 740
Query 741 ATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCA 814
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||.|.||.||||||||||
Sbjct 741 ATGCAGTCAAGAAATGGAGCCTGTGATAACATGCGACAAAAAGTTCCGAACTCACTTTCATATCGACTGGTGCA 814
Query 815 AAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCT 888
|.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 815 AGATTTCACTGGTTGACAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTAGTTCGTGGCGAGGGCATTTTGCCC 888
Query 889 GATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACT 962
||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||||.||
Sbjct 889 GACGGCGGGGAGTACAAGCCCCCTTCGGATTCTTTGAAAAGCCGAGACTATTACACGGATTTCCTCGTTACCCT 962
Query 963 GGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCG 1036
|||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 GGCTGTGCCCTCGGCGGTAGCACTGGTGCTTTTCCTAATACTCGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGAG 1036
Query 1037 TGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGTCCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAG 1110
|||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGAAAAGAGAGACATGCAAACCCCAGATATCCAGCTTGTCCATCACAGCTCGATTCAGAAATCTACCAAGGAG 1110
Query 1111 CTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGG 1184
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 CTTCGAGACATGTCCAAAAACAGAGAGATTGCATGGCCCCTGTCTACCCTGCCCGTGTTCCACCCTGTAACTGG 1184
Query 1185 GGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACT 1258
.||..|.||||.|||....||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||..|.||||||||||
Sbjct 1185 AGAGGTTATACCTCCCACGCACACAGACAACTACGACAGCACCAACATGCCGTTGATGCAGGCACAGCAGAACT 1258
Query 1259 TGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAG-GTAAATGGTATCCC-------------------- 1311
|||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||| || ||||.|
Sbjct 1259 TGCCACACCAGACTCAGATCCCTCAACCGCAGACTACAGAGT------TATCTCCTCTATTACTGCTCTCGGGA 1326
Query 1312 --- 1311
Sbjct 1327 ATT 1329