Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07330
• Subject: NM_001130191.1
• Aligned Length: 1335
• Identities: 1138
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT  74
            ||||.|||...|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||
Sbjct    1  ATGCTATTATTCTGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCTTGTGCTTGGACGGGAAAGGGTCGGGGGACACTCAAGAT  74

Query   75  GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACAGTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAGTG  148
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||.||.||||..|
Sbjct   75  GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTACTGACAGTGTACACTCTTTTCTCCAAGGTGCACTCTGACCGGAACG  148

Query  149  TATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTAC  222
            |.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  TGTACCCATCTGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTGTTGGAGAGAGAGTATTTTAAGGGTGAATTTCCACCTTAT  222

Query  223  CCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGG  296
            |||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||
Sbjct  223  CCAAAGCCTGGGGAGGTTAGTAATGATCCCATAACATTTAACACAAATTTAATGGGCTACCCAGATAGACCTGG  296

Query  297  ATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGCTTCGATATATCCAAAGGACCCCGTACAGTGATGGAGTCCTGTATGGGTCTCCAACAGCTGAAAATGTGG  370

Query  371  GGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATT  444
            ||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  GGAAACCAACTATTATTGAGATAACTGCCTACAATAGACGTACCTTTGAGACTGCAAGGCATAACTTGATAATT  444

Query  445  AATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGA  518
            |||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  AATATAATGTCAGCAGAAGAATTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATCAAAAATATGAATGTGGAAGA  518

Query  519  AATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACG  592
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  AATGTTGGCCAGCGAGGTTCTTGGAGACTTTCTCGGGGCTGTAAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTCAACG  592

Query  593  CCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTT  666
            |||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct  593  CCATAAACATCACGTCAGCCCTGGATAGGGGTGGCAGAGTGCCGCTTCCTATTAATGACATGAAGGAGGGTGTT  666

Query  667  TATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAG  740
            |||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  667  TATGTCATGGTTGGTGCCGATGTTGCATTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAGTTAAG  740

Query  741  ATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCA  814
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||.|.||.||||||||||
Sbjct  741  ATGCAGTCAAGAAATGGAGCCTGTGATAACATGCGACAAAAAGTTCCGAACTCACTTTCATATCGACTGGTGCA  814

Query  815  AAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCT  888
            |.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct  815  AGATTTCACTGGTTGACAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTAGTTCGTGGCGAGGGCATTTTGCCC  888

Query  889  GATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACT  962
            ||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||||.||
Sbjct  889  GACGGCGGGGAGTACAAGCCCCCTTCGGATTCTTTGAAAAGCCGAGACTATTACACGGATTTCCTCGTTACCCT  962

Query  963  GGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCG  1036
            |||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  963  GGCTGTGCCCTCGGCGGTAGCACTGGTGCTTTTCCTAATACTCGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGG--  1034

Query 1037  TGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGTCCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAG  1110
                                     ||..|||||.||.|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  -------------------------AGTTATCCAGCTTGTCCATCACAGCTCGATTCAGAAATCTACCAAGGAG  1083

Query 1111  CTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGG  1184
            |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1084  CTTCGAGACATGTCCAAAAACAGAGAGATTGCATGGCCCCTGTCTACCCTGCCCGTGTTCCACCCTGTAACTGG  1157

Query 1185  GGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACT  1258
            .||..|.||||.|||....||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||..|.||||||||||
Sbjct 1158  AGAGGTTATACCTCCCACGCACACAGACAACTACGACAGCACCAACATGCCGTTGATGCAGGCACAGCAGAACT  1231

Query 1259  TGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAG-GTAAATGGTATCCC--------------------  1311
            |||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||| ||      ||||.|                    
Sbjct 1232  TGCCACACCAGACTCAGATCCCTCAACCGCAGACTACAGAGT------TATCTCCTCTATTACTGCTCTCGGGA  1299

Query 1312  ---  1311
               
Sbjct 1300  ATT  1302