Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07330
- Subject:
- NM_001346713.2
- Aligned Length:
- 1419
- Identities:
- 1309
- Gaps:
- 108
Alignment
Query 1 ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT 74
Query 75 GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACA---------------------------------------- 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACAGCTTTTTTATTAAGCTGTGCTGATGGCATAAATGGAACAG 148
Query 109 --------------------------------------------------------------------GTGTAC 114
||||||
Sbjct 149 TTAACTGGAAGACCAGACAGGCCAACAATTTTATTATCAGCAGAAAAATGGCTGCTGGGATGAAAGATGTGTAC 222
Query 115 AGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAGTGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGA 188
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAATGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGA 296
Query 189 AAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTA 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTA 370
Query 263 ATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGA 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGA 444
Query 337 GTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCG 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCG 518
Query 411 CACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAG 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAG 592
Query 485 CAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCA 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCA 666
Query 559 GTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGT 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGT 740
Query 633 GCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTT 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTT 814
Query 707 TACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAA 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAA 888
Query 781 AAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTA 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTA 962
Query 855 TCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAA 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAA 1036
Query 929 GCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATA 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATA 1110
Query 1003 CTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGT 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGT 1184
Query 1077 CCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCC 1258
Query 1151 TGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGGGGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGC 1224
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGGGGAAATCATACCTCCTTTACACACAGACAACTATGATAGC 1332
Query 1225 ACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGG 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGG 1406
Query 1299 TAAATGGTATCCC 1311
|||||||||||||
Sbjct 1407 TAAATGGTATCCC 1419