Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07330
• Subject: NM_001362807.2
• Aligned Length: 1319
• Identities: 1184
• Gaps: 130

Alignment

Query    1  ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACA--------GTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGA  140
                          .||||       |||||..|        ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------ATGGC-------TGCTGGGATGAAAGATGTGTACAGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGA  53

Query  141  TCGGAGTGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTC  214
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  TCGGAATGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGAAAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTC  127

Query  215  CACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGAC  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  CACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTAATACAAATTTAATGGGTTACCCAGAC  201

Query  289  CGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGA  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGAGTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGA  275

Query  363  AAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATT  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  AAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCGCACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATT  349

Query  437  TGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAAT  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  TGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAGCAGAATTCTTCATTAAGAATATGAAT  423

Query  511  GTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCG  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  GTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCAGTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCG  497

Query  585  CCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGG  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  CCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGTGCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGG  571

Query  659  AGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAAT  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  AGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTTTACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAAT  645

Query  733  CAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTGA  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  CAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAAAAATTTCGTACTCAATTTTACATTGA  719

Query  807  CTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGA  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTATCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGA  793

Query  881  TTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATTTCCTA  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  TTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAAGCAGAGACTATTACACGGATTTCCTA  867

Query  955  ATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACG  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  ATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATACTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACG  941

Query 1029  GGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGTCCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTA  1102
            |||||||||                           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GGAAGGCGT---------------------------CATCCAACTGGTCCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTA  988

Query 1103  CCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  CCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCCTGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCT  1062

Query 1177  GTGACTGGGGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAAACATGCCATTGATGCAAACGCA  1250
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  GTGACTGGGGAAATCATACCTCCTTTACACACAGACAACTATGATAGCACAAACATGCCATTGATGCAAACGCA  1136

Query 1251  GCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGGTAAATGGTATCCC  1311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  GCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAGGTAAATGGTATCCC  1197