Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07330
- Subject:
- XM_006505021.3
- Aligned Length:
- 1443
- Identities:
- 1163
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ATGCAATTGCCCCGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCCTGTGCTTGGACGGGACAGGGTCGGGGGACACGCAGGAT 74
||||.|||...|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1 ATGCTATTATTCTGGTGGTGGGAGCTGGGAGACCCTTGTGCTTGGACGGGAAAGGGTCGGGGGACACTCAAGAT 74
Query 75 GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTGCTGACA---------------------------------------- 108
|||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 75 GAGCCCCGCGACCACTGGCACATTCTTACTGACAGCTTTTTTATTAAGCTGTGCCGATGGCATAAATGGAACAG 148
Query 109 --------------------------------------------------------------------GTGTAC 114
||||||
Sbjct 149 TTAACTGGAAGACCAAACAAGCCAGCAGTTTTAGTATCAGCAGGAAACTGGCTGCTGGGAAGAAAGATGTGTAC 222
Query 115 AGTATTTTCTCCAAGGTACACTCCGATCGGAGTGTATACCCATCAGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTTTTGGA 188
|.|.|||||||||||||.|||||.||.||||..||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 223 ACTCTTTTCTCCAAGGTGCACTCTGACCGGAACGTGTACCCATCTGCAGGTGTCCTCTTTGTTCATGTGTTGGA 296
Query 189 AAGAGAATATTTTAAGGGGGAATTTCCACCTTACCCAAAACCTGGCGAGATTAGTAATGATCCCATAACATTTA 262
.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGAGAGTATTTTAAGGGTGAATTTCCACCTTATCCAAAGCCTGGGGAGGTTAGTAATGATCCCATAACATTTA 370
Query 263 ATACAAATTTAATGGGTTACCCAGACCGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACACCATATAGTGATGGA 336
|.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 371 ACACAAATTTAATGGGCTACCCAGATAGACCTGGATGGCTTCGATATATCCAAAGGACCCCGTACAGTGATGGA 444
Query 337 GTCCTATATGGGTCCCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAGCCAACAATCATTGAGATAACTGCCTACAACAGGCG 410
|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 445 GTCCTGTATGGGTCTCCAACAGCTGAAAATGTGGGGAAACCAACTATTATTGAGATAACTGCCTACAATAGACG 518
Query 411 CACCTTTGAGACTGCAAGGCATAATTTGATAATTAATATAATGTCTGCAGAAGACTTCCCGTTGCCATATCAAG 484
.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 TACCTTTGAGACTGCAAGGCATAACTTGATAATTAATATAATGTCAGCAGAAGAATTCCCGTTGCCATATCAAG 592
Query 485 CAGAATTCTTCATTAAGAATATGAATGTAGAAGAAATGTTGGCCAGTGAGGTTCTTGGAGACTTTCTTGGCGCA 558
|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 593 CAGAATTCTTCATCAAAAATATGAATGTGGAAGAAATGTTGGCCAGCGAGGTTCTTGGAGACTTTCTCGGGGCT 666
Query 559 GTGAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTGAACGCCATAAACATCACATCGGCCCTAGACAGGGGTGGCAGGGT 632
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 667 GTAAAAAATGTGTGGCAGCCAGAGCGCCTCAACGCCATAAACATCACGTCAGCCCTGGATAGGGGTGGCAGAGT 740
Query 633 GCCACTTCCCATTAATGACCTGAAGGAGGGCGTTTATGTCATGGTTGGTGCAGATGTCCCGTTTTCTTCTTGTT 706
|||.|||||.|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||
Sbjct 741 GCCGCTTCCTATTAATGACATGAAGGAGGGTGTTTATGTCATGGTTGGTGCCGATGTTGCATTTTCTTCTTGTT 814
Query 707 TACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAATTGAGATGTAGTCAAGAAATGGAGCCTGTAATAACATGTGATAAA 780
||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 815 TACGAGAAGTTGAAAATCCACAGAATCAGTTAAGATGCAGTCAAGAAATGGAGCCTGTGATAACATGCGACAAA 888
Query 781 AAATTTCGTACTCAATTTTACATTGACTGGTGCAAAATTTCATTGGTTGATAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTA 854
||.||.||.|||||.|||.|.||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGTTCCGAACTCACTTTCATATCGACTGGTGCAAGATTTCACTGGTTGACAAAACAAAGCAAGTGTCCACCTA 962
Query 855 TCAGGAAGTGATTCGTGGAGAGGGGATTTTACCTGATGGTGGAGAATACAAACCCCCTTCTGATTCTTTGAAAA 928
|||||||||..|||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 TCAGGAAGTAGTTCGTGGCGAGGGCATTTTGCCCGACGGCGGGGAGTACAAGCCCCCTTCGGATTCTTTGAAAA 1036
Query 929 GCAGAGACTATTACACGGATTTCCTAATTACACTGGCTGTGCCCTCGGCAGTGGCACTGGTCCTTTTTCTAATA 1002
||.||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1037 GCCGAGACTATTACACGGATTTCCTCGTTACCCTGGCTGTGCCCTCGGCGGTAGCACTGGTGCTTTTCCTAATA 1110
Query 1003 CTTGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGCGTGGAAAAGAGAAACATGCAAACACCAGACATCCAACTGGT 1076
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1111 CTCGCTTATATCATGTGCTGCCGACGGGAAGGAGTGGAAAAGAGAGACATGCAAACCCCAGATATCCAGCTTGT 1184
Query 1077 CCATCACAGTGCTATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAGAATAGAGAGATAGCATGGCCCC 1150
|||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 CCATCACAGCTCGATTCAGAAATCTACCAAGGAGCTTCGAGACATGTCCAAAAACAGAGAGATTGCATGGCCCC 1258
Query 1151 TGTCAACGCTTCCTGTGTTCCACCCTGTGACTGGGGAAATCATACATCCTTTACACACAGACAACTATGATAGC 1224
||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||..|.||||.|||....||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259 TGTCTACCCTGCCCGTGTTCCACCCTGTAACTGGAGAGGTTATACCTCCCACGCACACAGACAACTACGACAGC 1332
Query 1225 ACAAACATGCCATTGATGCAAACGCAGCAGAACTTGCCACATCAGACTCAGATTCCCCAACAGCAGACTACAG- 1297
||.||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||
Sbjct 1333 ACCAACATGCCGTTGATGCAGGCACAGCAGAACTTGCCACACCAGACTCAGATCCCTCAACCGCAGACTACAGA 1406
Query 1298 GTAAATGGTATCCC----------------------- 1311
|| ||||.|
Sbjct 1407 GT------TATCTCCTCTATTACTGCTCTCGGGAATT 1437