Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07338
- Subject:
- XM_005273343.4
- Aligned Length:
- 1359
- Identities:
- 920
- Gaps:
- 435
Alignment
Query 1 ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG 74
Query 75 TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT 148
Query 149 TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA 222
Query 223 GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT 296
Query 297 TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC 370
Query 371 GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA 444
Query 445 ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA 518
Query 519 AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT 592
Query 593 TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA 666
Query 667 TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT 740
Query 741 GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA 814
Query 815 ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG 888
Query 889 CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCT-CATAAATTGATGTTGGAATTCCA------TACATT--ACTTAG 953
|||||| ||||| ||.|| ||||.|| ||||.| |||.||
Sbjct 889 CTTAAG-------------------CATCTACAGAA-----------AATTTCAATAATGTACAGTACACTGAG 932
Query 954 AAAATCAGAAAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCA 1027
|
Sbjct 933 A------------------------------------------------------------------------- 933
Query 1028 CTAAGAATATAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGG 1101
Sbjct 934 -------------------------------------------------------------------------- 933
Query 1102 GTTCAAGAAGAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGGTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGA 1175
Sbjct 934 -------------------------------------------------------------------------- 933
Query 1176 TTGGAAGGAAGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGAT 1249
Sbjct 934 -------------------------------------------------------------------------- 933
Query 1250 ATTTCCGGTATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAA 1323
Sbjct 934 -------------------------------------------------------------------------- 933
Query 1324 AAATACAGTATTGTAAATCCAAGACTC 1350
Sbjct 934 --------------------------- 933