Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07338
• Subject: XM_017002760.1
• Aligned Length: 1350
• Identities: 1007
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAGATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAAACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGAAGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAGATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTAT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAAAGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  370
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACC  28

Query  371  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  GGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTCCTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGA  102

Query  445  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  ATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGACATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGA  176

Query  519  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  AATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTACAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAAT  250

Query  593  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  TGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGTAGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACA  324

Query  667  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  TCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTTGGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCT  398

Query  741  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  GGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTCACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAA  472

Query  815  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  ATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAGACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTG  546

Query  889  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACTTAGAAAATCAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  CTTAAGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACTTAGAAAATCAGA  620

Query  963  AAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCACTAAGAATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  AAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGATGCACTAAGAATA  694

Query 1037  TAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGGGTTCAAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  TAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCGTGGGTTCAAGAA  768

Query 1111  GAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGGTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGATTGGAAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  GAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGCTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAGTGATTGGAAGGA  842

Query 1185  AGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGATATTTCCGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  AGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTAGATATTTCCGGT  916

Query 1259  ATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAAAAATACAGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  ATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTGAAAAAATACAGT  990

Query 1333  ATTGTAAATCCAAGACTC  1350
            ||||||||||||||||||
Sbjct  991  ATTGTAAATCCAAGACTC  1008