Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07340
- Subject:
- NM_183078.3
- Aligned Length:
- 1472
- Identities:
- 1309
- Gaps:
- 145
Alignment
Query 1 ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT 74
Query 75 GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC 148
Query 149 TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG 222
Query 223 ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC 296
Query 297 CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG 370
Query 371 TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG 444
Query 445 GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA 518
Query 519 ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA 592
Query 593 CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT 666
Query 667 GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA 740
Query 741 GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA 814
Query 815 ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG 888
Query 889 TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA 962
Query 963 ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG 1036
Query 1037 AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA 1110
Query 1111 GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA 1184
Query 1185 TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAG---------------------- 1236
Query 1259 ACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGA-ATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCC------CATTTGTCGGAA 1325
|||.|| ||.|.| |.|||||..| |||.| ||||| |||
Sbjct 1237 ----------------------CAAAGAGATTGTT----CTGAAGACCG--TGCTCTAAGGGCATTT----GAA 1278
Query 1326 GGACATTAAGT-CCAAAACATACTCTTTGGTTCTG-GACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCT-GAG-- 1394
.||| | ||| |||..|| || || .|.|||||| ||| |||
Sbjct 1279 AGAC------TGCCA-------------GGTAGTGCGA-----GC----CTGAGATGG-------TCTGGAGGA 1317
Query 1395 --CTC---AGAAGTGAAAGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC 1455
||| ||..||| ||..|| .||.||
Sbjct 1318 TTCTCTCTAGCCGTG-----ACTCCG--CTGCTC-------------------------------- 1344