Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07353
Subject:
NM_001164168.1
Aligned Length:
621
Identities:
535
Gaps:
56

Alignment

Query   1  MADFEDLRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIRELYRRRYPRTLEGLSD  74
                  .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   1  -------MNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIRELYRRRYPRTLEGLCD  67

Query  75  LSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGSVLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQL  148
           |||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  68  LSTIKSSVFSLDGSSSPVEPDLPVAGIHSLPSTSITPHSPSSPVGSVLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQL  141

Query 149  KNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFIFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQ  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142  KNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFIFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQ  215

Query 223  EDNYPNSLCIKVNGKLFPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLV  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216  EDNYPNSLCIKVNGKLFPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLV  289

Query 297  RQLTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAVTCTHLQCFDA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290  RQLTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAVTCTHLQCFDA  363

Query 371  ALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQEDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKI  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 364  ALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQEDGSWCPMRPKKEAMKVTSQPCTKV  437

Query 445  ESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDEEEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVT  518
           |||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438  ESSSVFSKPCSVTVASDASKKKIDVIDLTIESSSDEEEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVT  511

Query 519  SVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTPISSMSSDLPG---------------EQRRNDINNELKLGTSSDTVQQ-----  572
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||               ..........|.....|.|...     
Sbjct 512  SVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTPVSSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSPHESS  585

Query 573  -----------------------------  572
                                        
Sbjct 586  THVSSSSSRSETGVITSSGRNIPDIISLD  614