Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07353
- Subject:
- NM_001324058.2
- Aligned Length:
- 1717
- Identities:
- 1515
- Gaps:
- 197
Alignment
Query 1 ATGGCGGATTTCGAAGATTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTT 74
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGATTTCGAAGAGTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTT 74
Query 75 TGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCA 148
Query 149 GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGAT 222
Query 223 TTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGC 296
Query 297 TGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTC 370
Query 371 AAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA 444
Query 445 AAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG 518
Query 519 ATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTT 592
Query 593 TGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAA 666
Query 667 GAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACC 740
Query 741 GCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAG 814
Query 815 CTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTA 888
Query 889 CGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGC 962
Query 963 ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGT 1036
Query 1037 GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCT 1110
Query 1111 GCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGA 1184
Query 1185 AAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAG 1258
Query 1259 AAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATA 1332
Query 1333 GAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGT 1406
Query 1407 TATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT 1480
Query 1481 CAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGTT-CTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGAC 1553
|||||||||||||||||||||||||||||.|| .|.||.||
Sbjct 1481 CAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGTTTGTTAATTTA--------------------------------- 1521
Query 1554 TTCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATACGCCAATATCAA 1627
Sbjct 1522 -------------------------------------------------------------------------- 1521
Query 1628 GCATGTCATCAGATTTGCCAGGAGAACAAAGAAGAAATGATATTAATAATGAACTGAAGCTTGGAACATCTTCT 1701
Sbjct 1522 -------------------------------------------------------------------------- 1521
Query 1702 GATACTGTGCAACAG 1716
Sbjct 1522 --------------- 1521