Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07353
• Subject: NM_001324060.2
• Aligned Length: 1728
• Identities: 1193
• Gaps: 525

Alignment

Query    1  ----ATGGCGG------ATTTCGAAGA--TTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGT  62
                |||..||      |.|.|.||||  ..||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATGCTGGGAAGCAACTACAAAGAACACTGCACAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGT  74

Query   63  ATTACTAGGCTTTGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGA  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTACTAGGCTTTGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGA  148

Query  137  AGAGCGGCTGCAGCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAA  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGCGGCTGCAGCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAA  222

Query  211  GGACTTTCTGATTTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGA  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGACTTTCTGATTTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGA  296

Query  285  CTTGGCCGTGGCTGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTT  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGGCCGTGGCTGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTT  370

Query  359  CTGTGCTGCTTCAAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCT  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTGCTGCTTCAAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCT  444

Query  433  GATGTGCAGTTAAAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAG  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGTGCAGTTAAAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAG  518

Query  507  CAGTATTCAGCGATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATAT  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTATTCAGCGATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATAT  592

Query  581  CCAGGGATTTTTTGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACA  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGGGATTTTTTGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACA  666

Query  655  AGTTGCCCTCAAGAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTTGCCCTCAAGAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGG  740

Query  729  CTATGCACCACCGCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTA  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTATGCACCACCGCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTA  814

Query  803  GGTTATCTTCAGCTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCT  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTATCTTCAGCTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCT  888

Query  877  GTATATCTTGTACGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGA  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTATATCTTGTACGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGA  962

Query  951  TCATTCCAGAGCACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCATTCCAGAGCACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGG  1036

Query 1025  TATCCTTGATGTGCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TATCCTTGATGTGCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAG  1110

Query 1099  TGTTTTGATGCTGCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAA  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTTTTGATGCTGCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAA  1184

Query 1173  AGCTGCCTATGAAAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGA  1246
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct 1185  AGCTGCCTATGAAAGTCTAATATTAGATGGG-------------------------------------------  1215

Query 1247  TCAAATTCCAAGAAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCG  1320
                                                                                      
Sbjct 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215

Query 1321  TGTACAAAAATAGAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAA  1394
                                                                                      
Sbjct 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215

Query 1395  GAAAGTAGATGTTATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAAT  1468
                                                                                      
Sbjct 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215

Query 1469  GCATCTTTATGTCAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTG  1542
                                                                                      
Sbjct 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215

Query 1543  CCCAGTGTGACTTCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATAC  1616
                                                                                      
Sbjct 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215

Query 1617  GCCAATATCAAGCATGTCATCAGATTTGCCAGGAGAACAAAGAAGAAATGATATTAATAATGAACTGAAGCTTG  1690
                                                                                      
Sbjct 1216  --------------------------------------------------------------------------  1215

Query 1691  GAACATCTTCTGATACTGTGCAACAG  1716
                                      
Sbjct 1216  --------------------------  1215