Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07353
• Subject: XM_006526423.2
• Aligned Length: 1868
• Identities: 1583
• Gaps: 154

Alignment

Query    1  ATGGCGGATTTCGAAGATTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTT  74
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGATTTCGAGGAGTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAGTTACAAGTGTTACTGGGCTT  74

Query   75  TGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCA  148
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  TGCTGGACGGAATAAAAGTGGGCGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGTTGCATTTATTGAAGAGTGGCTGCA  148

Query  149  GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||
Sbjct  149  GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATTCGAGAATTATATAGACGCCGATACCCACGGACACTTGAAGGACTTTGTGAT  222

Query  223  TTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGC  296
            .|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||
Sbjct  223  CTTTCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGCTTGGATGGTAGCTCATCACCCGTAGAACCTGACTTGCCTGTGGC  296

Query  297  TGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTC  370
            |||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  297  TGGGATCCACTCGTTGCCTTCGACTTCAATTACACCTCATTCACCGTCATCTCCTGTTGGTTCTGTACTGCTGC  370

Query  371  AAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGACACTAAGCCCACCTTTGAGATGCAGCAGCCGTCTCCGCCCATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA  444

Query  445  AAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG  518
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAAACCTGCCTTTCTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG  518

Query  519  ATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTT  592
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  519  GTTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAGCAAGTTAGAGAAATATGTATTTCAAGGGACTTTT  592

Query  593  TGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAA  666
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  TGCCGGGTGGCAGGAGAGACTACACAGTCCAAGTCCAGCTGCGACTTTGCTTGGCAGAGACCAGTTGCCCTCAA  666

Query  667  GAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACC  740
            ||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GAAGATAACTATCCCAATAGTTTGTGTATAAAAGTCAATGGGAAACTCTTTCCTTTGCCTGGCTATGCGCCACC  740

Query  741  GCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAG  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  ACCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCCTGAACATTACGTCTTTAGTTAGGTTGTCTTCAG  814

Query  815  CTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTA  888
            ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  815  CTGTGCCAAATCAGATTTCTATTTCTTGGGCATCTGAAATTGGAAAGAATTACTCCATGTCTGTGTATCTTGTA  888

Query  889  CGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGC  962
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CGACAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAATCCTGATCATTCCAGAGC  962

Query  963  ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGT  1036
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  963  ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGACCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGTCTTCGAGTGTCCTTGATGT  1036

Query 1037  GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCGTGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGCTTTGATGCT  1110

Query 1111  GCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGA  1184
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GCCCTCTATCTTCAGATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATCTGTCCTGTTTGTGACAAAAAGGCTGCCTATGA  1184

Query 1185  AAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAG  1258
            .|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GAGTCTGATACTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTGGATGAGATCAAATTCCAGG  1258

Query 1259  AAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATA  1332
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||.||
Sbjct 1259  AAGATGGTTCTTGGTGTCCCATGAGACCTAAAAAAGAAGCTATGAAAGTAACCAGCCAGCCCTGTACAAAAGTA  1332

Query 1333  GAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGT  1406
            |||||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1333  GAAAGTTCAAGTGTCTTTAGTAAACCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGATGCAAGCAAGAAGAAGATAGATGT  1406

Query 1407  TATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT  1480
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATTGATCTAACAATAGAGAGCTCTTCTGATGAAGAGGAAGACCCTCCCGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT  1480

Query 1481  CAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACT  1554
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGAAACACAAAGCAGTCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACT  1554

Query 1555  TCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATACGCCAATATCAAG  1628
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1555  TCAGTTGATCCTGCTGCTATTCCACCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCACACGCCAGTGTCAAG  1628

Query 1629  CATGTCATCAGATTTGCCAGG------------------------AG----AACAAAGAAGAAATG-------A  1667
            |||||||||||||||||||||                        ||    ..|..||.||.|.||       |
Sbjct 1629  CATGTCATCAGATTTGCCAGGTTTGGATTTTCTTTCCCTTATTCCAGTTGATCCCCAGCAGTACTGTCCTCCTA  1702

Query 1668  TATT----AATA-------------ATGAACTG-AAGCTTGGAACATCT-TC-----------------TGA--  1703
            |.||    .|||             .|.|||.| ||||  .|.||.||| ||                 |||  
Sbjct 1703  TGTTTTTGGATAGTCTCACCTCACCCTTAACAGCAAGC--AGTACGTCTGTCACCACCACCAGCCCCCATGAAA  1774

Query 1704  ----TACT---GT-----------GCAACAG-------------------------------------------  1716
                ||||   ||           |||.|||                                           
Sbjct 1775  GCAGTACTCACGTTAGTTCATCCAGCAGCAGGAGTGAGACAGGGGTCATAACCAGCAGTGGGAGGAACATTCCT  1848

Query 1717  ------------------  1716
                              
Sbjct 1849  GACATCATCTCTTTGGAC  1866