Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07353
- Subject:
- XM_006526425.2
- Aligned Length:
- 1868
- Identities:
- 1563
- Gaps:
- 175
Alignment
Query 1 ATGGCGGATTTCGAAGATTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTT 74
|.||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ---------------------ATGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAGTTACAAGTGTTACTGGGCTT 53
Query 75 TGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCA 148
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 54 TGCTGGACGGAATAAAAGTGGGCGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGTTGCATTTATTGAAGAGTGGCTGCA 127
Query 149 GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGAT 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||
Sbjct 128 GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATTCGAGAATTATATAGACGCCGATACCCACGGACACTTGAAGGACTTTGTGAT 201
Query 223 TTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGC 296
.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 202 CTTTCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGCTTGGATGGTAGCTCATCACCCGTAGAACCTGACTTGCCTGTGGC 275
Query 297 TGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTC 370
|||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 276 TGGGATCCACTCGTTGCCTTCGACTTCAATTACACCTCATTCACCGTCATCTCCTGTTGGTTCTGTACTGCTGC 349
Query 371 AAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA 444
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 AAGACACTAAGCCCACCTTTGAGATGCAGCAGCCGTCTCCGCCCATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA 423
Query 445 AAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG 518
|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 AAAAACCTGCCTTTCTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG 497
Query 519 ATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTT 592
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 498 GTTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAGCAAGTTAGAGAAATATGTATTTCAAGGGACTTTT 571
Query 593 TGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAA 666
||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 572 TGCCGGGTGGCAGGAGAGACTACACAGTCCAAGTCCAGCTGCGACTTTGCTTGGCAGAGACCAGTTGCCCTCAA 645
Query 667 GAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACC 740
||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 646 GAAGATAACTATCCCAATAGTTTGTGTATAAAAGTCAATGGGAAACTCTTTCCTTTGCCTGGCTATGCGCCACC 719
Query 741 GCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAG 814
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 720 ACCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCCTGAACATTACGTCTTTAGTTAGGTTGTCTTCAG 793
Query 815 CTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTA 888
||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 794 CTGTGCCAAATCAGATTTCTATTTCTTGGGCATCTGAAATTGGAAAGAATTACTCCATGTCTGTGTATCTTGTA 867
Query 889 CGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGC 962
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 868 CGACAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAATCCTGATCATTCCAGAGC 941
Query 963 ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGT 1036
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 942 ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGACCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGTCTTCGAGTGTCCTTGATGT 1015
Query 1037 GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCT 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1016 GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCGTGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGCTTTGATGCT 1089
Query 1111 GCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGA 1184
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1090 GCCCTCTATCTTCAGATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATCTGTCCTGTTTGTGACAAAAAGGCTGCCTATGA 1163
Query 1185 AAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAG 1258
.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1164 GAGTCTGATACTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTGGATGAGATCAAATTCCAGG 1237
Query 1259 AAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATA 1332
|||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||.||
Sbjct 1238 AAGATGGTTCTTGGTGTCCCATGAGACCTAAAAAAGAAGCTATGAAAGTAACCAGCCAGCCCTGTACAAAAGTA 1311
Query 1333 GAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGT 1406
|||||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1312 GAAAGTTCAAGTGTCTTTAGTAAACCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGATGCAAGCAAGAAGAAGATAGATGT 1385
Query 1407 TATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT 1480
|||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 TATTGATCTAACAATAGAGAGCTCTTCTGATGAAGAGGAAGACCCTCCCGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT 1459
Query 1481 CAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACT 1554
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 CAGAAACACAAAGCAGTCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACT 1533
Query 1555 TCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATACGCCAATATCAAG 1628
||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1534 TCAGTTGATCCTGCTGCTATTCCACCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCACACGCCAGTGTCAAG 1607
Query 1629 CATGTCATCAGATTTGCCAGG------------------------AG----AACAAAGAAGAAATG-------A 1667
||||||||||||||||||||| || ..|..||.||.|.|| |
Sbjct 1608 CATGTCATCAGATTTGCCAGGTTTGGATTTTCTTTCCCTTATTCCAGTTGATCCCCAGCAGTACTGTCCTCCTA 1681
Query 1668 TATT----AATA-------------ATGAACTG-AAGCTTGGAACATCT-TC-----------------TGA-- 1703
|.|| .||| .|.|||.| |||| .|.||.||| || |||
Sbjct 1682 TGTTTTTGGATAGTCTCACCTCACCCTTAACAGCAAGC--AGTACGTCTGTCACCACCACCAGCCCCCATGAAA 1753
Query 1704 ----TACT---GT-----------GCAACAG------------------------------------------- 1716
|||| || |||.|||
Sbjct 1754 GCAGTACTCACGTTAGTTCATCCAGCAGCAGGAGTGAGACAGGGGTCATAACCAGCAGTGGGAGGAACATTCCT 1827
Query 1717 ------------------ 1716
Sbjct 1828 GACATCATCTCTTTGGAC 1845