Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07353
- Subject:
- XM_006722572.3
- Aligned Length:
- 2016
- Identities:
- 1674
- Gaps:
- 336
Alignment
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGCG 6
||||.|
Sbjct 1 ATGCTGGGAAGCAACTACAAAGAACACTGCACAGTGGCTGTACCATTTTACATCCCTACCAGCAATGTATGGAG 74
Query 7 -GA-----TTTCGAAG------------------------------------ATTTGAG-------GAATATGG 31
|| ||||..|| ||||.|| ||||||||
Sbjct 75 TGATCCAGTTTCTCAGCATCCTCGCCAGCATTTGGTGTTATCAGTGTTTTTCATTTTAGCCATTCTGAATATGG 148
Query 32 TTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTTTGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCAT 105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTTTGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCAT 222
Query 106 GACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCAGCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATT 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCAGCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATT 296
Query 180 GTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGATTTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTT 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGATTTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTT 370
Query 254 TGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGCTGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTT 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGCTGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTT 444
Query 328 ACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTCAAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCA 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTCAAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCA 518
Query 402 GCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTAAAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATG 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTAAAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATG 592
Query 476 TTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCGATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTG 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCGATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTG 666
Query 550 ACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTTTGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCA 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTTTGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCA 740
Query 624 AGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAAGAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAA 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAAGAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAA 814
Query 698 AAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACCGCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCT 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACCGCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCT 888
Query 772 GGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAGCTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGC 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAGCTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGC 962
Query 846 ATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTACGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGA 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTACGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGA 1036
Query 920 GATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGCACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCT 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGCACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCT 1110
Query 994 GATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGTGCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCC 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGTGCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCC 1184
Query 1068 ATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCTGCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGC 1141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCTGCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGC 1258
Query 1142 CCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGAAAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAA 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGAAAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAA 1332
Query 1216 ATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAGAAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAA 1289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAGAAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAA 1406
Query 1290 GAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATAGAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTT 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATAGAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTT 1480
Query 1364 CAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGTTATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGAC 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGTTATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGAC 1554
Query 1438 GAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGTCAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGT 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGTCAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGT 1628
Query 1512 TCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACTTCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCAT 1585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACTTCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCAT 1702
Query 1586 TAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATACGCCAATATCAAGCATGTCATCAGATTTGCCAGGAGAACAAAGA 1659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATACGCCAATATCAAGCATGTCATCAGATTTGCCAGG---------- 1766
Query 1660 AGAAAT---GATATTAATAATGAACTGAAGCTTGGAACATC-----TTC----TGA-------TACTGTGC--- 1711
| |||.|| ||| || ||| ||| ||||||.|
Sbjct 1767 -----TTTGGATTTT---------------CTT------TCCCTTATTCCAGTTGATCCCCAGTACTGTCCTCC 1814
Query 1712 ------------------------------AACAG--------------------------------------- 1716
|||||
Sbjct 1815 TATGTTTTTGGATAGTCTCACCTCACCCTTAACAGCAAGCAGTACGTCTGTCACCACCACCAGCTCCCATGAAA 1888
Query 1717 -------------------------------------------------------------------------- 1716
Sbjct 1889 GCAGTACTCATGTTAGTTCATCCAGCAGCAGGAGTGAGACAGGGGTCATAACCAGCAGTGGAAGTAACATTCCT 1962
Query 1717 ------------------ 1716
Sbjct 1963 GACATCATCTCATTGGAC 1980