Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07373
- Subject:
- XM_011538992.2
- Aligned Length:
- 1512
- Identities:
- 1433
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGCCACCAGTGCCAAGTGCCCCACCTGTGCATCCACCTCCAGATGGAGGATGGGGTTGGATTGTGGTTGGAGC 74
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCACCAATGCCAAGTGCCCCACCTGTGCATCCACCTCCAGATGGAGGATGGGGTTGGATTGTGGTTGGAGC 74
Query 75 AGCTTTTATCTCCATTGGATTTTCCTATGCATTCCCCAAAGCTGTCACCGTATTCTTCAAAGAAATTCAGCAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCTTTTATCTCCATTGGATTTTCCTATGCATTCCCCAAAGCTGTCACCGTATTCTTCAAAGAAATTCAGCAAA 148
Query 149 TATTCCACACTACCTACAGTGAAATAGCATGGATTTCATCCATTATGCTGGCTGTTATGTACGCAGG------- 215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TATTCCACACTACCTACAGTGAAATAGCATGGATTTCATCCATTATGCTGGCTGTTATGTACGCAGGAGGTAGA 222
Query 216 -----------------------------------------------------------------------AGG 218
|||
Sbjct 223 ATATTTGAAAGCTTTTTGATCTTCACATCCTTGAGGATTCAGTGCAGCTTTACTCAATCAGGATCATGCCTAGG 296
Query 219 TCCTGTAAGTAGTGTTTTGGTGAATAAATACGGCAGCCGGCCGGTGGTGATAGCAGGAGGCTTATTATGCTGTC 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCTGTAAGTAGTGTTTTGGTGAATAAATACGGCAGCCGGCCGGTGGTGATAGCAGGAGGCTTATTATGCTGTC 370
Query 293 TTGGAATGGTGTTGGCCTCCTTTAGTAGCAGCGTGGTACAGCTGTACCTCACTATGGGATTCATTACAGGTTTA 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGGAATGGTGTTGGCCTCCTTTAGTAGCAGCGTGGTACAGCTGTACCTCACTATGGGATTCATTACAGGTTTA 444
Query 367 GGTTTAGCCTTCAACCTGCAACCCGCCTTAACCATAATTGGCAAATACTTCTATAGGAAGCGACCCATGGCAAA 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTTTAGCCTTCAACCTGCAACCCGCCTTAACCATAATTGGCAAATACTTCTATAGGAAGCGACCCATGGCAAA 518
Query 441 TGGATTGGCCATGGCAGGAAGTCCTGTTTTCTTAAGTTCATTGGCTCCTTTCAATCAGTACCTTTTTAATACTT 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGATTGGCCATGGCAGGAAGTCCTGTTTTCTTAAGTTCATTGGCTCCTTTCAATCAGTACCTTTTTAATACTT 592
Query 515 TTGGCTGGAAAGGAAGCTTCCTGATTTTGGGAAGTCTACTTTTGAATGCCTGTGTGGCTGGTTCCCTCATGAGA 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGGCTGGAAAGGAAGCTTCCTGATTTTGGGAAGTCTACTTTTGAATGCCTGTGTGGCTGGTTCCCTCATGAGA 666
Query 589 CCCCTTGGACCCAATCAAACCACTTCTAAGTCTAAAAATAAGACTGGCAAAACAGAAGATGATTCAAGCCCAAA 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCCTTGGACCCAATCAAACCACTTCTAAGTCTAAAAATAAGACTGGCAAAACAGAAGATGATTCAAGCCCAAA 740
Query 663 GAAAATCAAAACGAAGAAATCAACTTGGGAAAAAGTTAATAAGTATTTAGATTTCTCCCTTTTTAAGCATAGAG 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAAATCAAAACGAAGAAATCAACTTGGGAAAAAGTTAATAAGTATTTAGATTTCTCCCTTTTTAAGCATAGAG 814
Query 737 GATTTCTGATATATCTGTCTGGAAATGTCATTATGTTCCTAGGTTTTTTTGCCCCCATTATATTCTTGGCTCCA 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATTTCTGATATATCTGTCTGGAAATGTCATTATGTTCCTAGGTTTTTTTGCCCCCATTATATTCTTGGCTCCA 888
Query 811 TATGCTAAAGACCAAGGAATTGATGAGTACTCGGCAGCTTTTCTGCTATCTGTTATGGCTTTCGTTGATATGTT 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATGCTAAAGACCAAGGAATTGATGAGTACTCGGCAGCTTTTCTGCTATCTGTTATGGCTTTCGTTGATATGTT 962
Query 885 TGCTAGGCCTTCTGTAGGATTAATTGCAAACTCCAAATATATTCGACCTCGAATTCAGTACTTCTTCAGTTTTG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCTAGGCCTTCTGTAGGATTAATTGCAAACTCCAAATATATTCGACCTCGAATTCAGTACTTCTTCAGTTTTG 1036
Query 959 CAATCATGTTCAATGGAGTGTGTCACCTCTTGTGCCCACTGGCACAGGACTACACAAGCCTGGTATTATATGCT 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAATCATGTTCAATGGAGTGTGTCACCTCTTGTGCCCACTGGCACAGGACTACACAAGCCTGGTATTATATGCT 1110
Query 1033 GTATTTTTTGGCCTTGGATTTGGGAGTGTTAGCAGTGTTCTCTTTGAAACTCTCATGGACCTCGTGGGTGCACC 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTATTTTTTGGCCTTGGATTTGGGAGTGTTAGCAGTGTTCTCTTTGAAACTCTCATGGACCTCGTGGGTGCACC 1184
Query 1107 AAGATTTTCCAGTGCCGTCGGACTTGTCACAATTGTGGAGTGTGGCCCAGTTCTTCTTGGCCCTCCTCTTGCAG 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGATTTTCCAGTGCCGTCGGACTTGTCACAATTGTGGAGTGTGGCCCAGTTCTTCTTGGCCCTCCTCTTGCAG 1258
Query 1181 GTAAATTGGTGGATTTAACTGGAGAATATAAATACATGTACATGTCCTGTGGGGCTATTGTGGTAGCAGCAAGC 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTAAATTGGTGGATTTAACTGGAGAATATAAATACATGTACATGTCCTGTGGGGCTATTGTGGTAGCAGCAAGC 1332
Query 1255 GTGTGGCTGCTCATTGGCAATGCTATCAACTATAGATTGCTTGCAAAGGAAAGGAAGGAGGAAAATGCAAGGCA 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGTGGCTGCTCATTGGCAATGCTATCAACTATAGATTGCTTGCAAAGGAAAGGAAGGAGGAAAATGCAAGGCA 1406
Query 1329 GAAGACCAGAGAATCTGAACCCTTGAGCAAATCTAAACATTCGGAAGATGTTAACGTCAAAGTTTCAAATGCAC 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAAGACCAGAGAATCTGAACCCTTGAGCAAATCTAAACATTCGGAAGATGTTAACGTCAAAGTTTCAAATGCAC 1480
Query 1403 AGAGTGTAACCTCAGAAAGAGAAACTAACATT 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAGTGTAACCTCAGAAAGAGAAACTAACATT 1512