Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07402
Subject:
NM_004249.4
Aligned Length:
675
Identities:
624
Gaps:
27

Alignment

Query   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGTCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74
           |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74

Query  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTCT  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTCT  148

Query 149  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222

Query 223  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  296

Query 297  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  370

Query 371  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  444

Query 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  518

Query 519  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGGGTGGTGAAGGCAGATA  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|.||.|.||||||.|
Sbjct 519  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGCGTATTGTCAGGGCAGAAA  592

Query 593  TTGTAAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACCCTCCTAGAAGCTCT------------ATGTGT  654
           |.||.||.|   |||.||||       .|||.|     ||.|..|.||..|.||||            ||.|||
Sbjct 593  TAGTGAAGT---ACCCGGAA-------GAAGAA-----AATCAACATACCACCTCTACTCAGAGTAGAATCTGT  651

Query 655  GCAGTTCAG  663
           .||||.|||
Sbjct 652  TCAGTACAG  660