Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07465
• Subject: XM_011245579.2
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1267
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGCACACGCTTGTGTTCTTGAGCACACGGCAGGTGCTGCAGTGCCAGCCAGCTGCCTGCCAGGCCCTGCCCCT  74
            ||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACACACTTGTGTTCCTCAGCACGCGTCAGGTCCTTCAGTGCCAGCCAGCTGCATGCCAGGCCCTGCCCCT  74

Query   75  GCTGCCACGCGAACTCTTCCCCCTGCTGTTCAAGGTGGCCTTCATGGACAAGAAGACAGTGGTACTGCGCGAGT  148
            ||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.|||.
Sbjct   75  GCTGCCCCGGGAACTCTTCCCTCTGCTCTTCAAGGTGGCCTTCATGGACAAAAAGACGCTTGTGCTGCGTGAGC  148

Query  149  TGGTACACACGTGGCCCTTCCCGCTGCTCAGTTTCCAGCAGCTGCTACAGGAGTGTGCCCACTGCAGCCGTGCC  222
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  TGGTGCACACGTGGCCCTTTCCCCTGCTCAGCTTCCAGCAGCTGCTGCAGGAGTGTGCCCACTGCAGTCGAGCC  222

Query  223  CTCCTGCAGGAGCGGCCTAGCACTGAGAGCATGCAGGCTGTTATCCTGGGGCTGACTGCCCGGCTCCACACCTC  296
            ||.|||||||||||||..|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|||| |||
Sbjct  223  CTGCTGCAGGAGCGGCTCAGCACAGAAAGCATGCAGGCTGTGATCCTGGGGCTGACAGCTCGGATTCACA-CTC  295

Query  297  -AGAGCCTGGGGCCAGCACACAGCCCCTCTGCAGGAAGCATGCGCTGCGGGTGCTGGACATGACGGGCCTCTTG  369
             |||..|.|.|||..||||.||||||.|.||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct  296  AAGAAACAGAGGCTGGCACGCAGCCCTTGTGCAGGAAGCATGCATTGCGGGTTCTGGACATGACGGGTCTCCTG  369

Query  370  GATGATGGTGTGGAACAGGATCCTGGCACCATGAGCATGTGGGACTGTACTGCTGCCGTAGCTCGCACATGCAT  443
            ||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..|.||.|||||
Sbjct  370  GATGATGGTGTGGAGCAGGATCCTGAAACCATGAGCATGTGGGACTGTACAGCCGCTGTAGCCAGAACGTGCAT  443

Query  444  TGCCCAGCAGCAGGGTGGGGCCGCAGAGCCTGGGCCAGCCCCCA-TCCCCGTGGAGGTGCGCGTGGACCTGCGG  516
            |||||||||||||||||||.|.||.|||||.||| |.|.|.||| ||||||||||..|.||.||.|||||.|||
Sbjct  444  TGCCCAGCAGCAGGGTGGGACTGCCGAGCCAGGG-CTGTCACCAGTCCCCGTGGAAATCCGAGTAGACCTTCGG  516

Query  517  GTGAACCGGGCCTCCTATGCGTTCCTGCGGGAGGCACTCCGAAGCAGCGTGGGCAGCCCGCTGCGGCTCTGCTG  590
            ||.|||||||||||.||..|.|||||.||.|||||.||||.||||||.||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct  517  GTAAACCGGGCCTCGTACACATTCCTTCGTGAGGCCCTCCAAAGCAGTGTGGCCAGCCCGCTGCGGCTGTGCTG  590

Query  591  CCGGGACCTGCGAGCTGAGGACCTGCCCATGCGCAACACTGTGGCCCTGCTGCAGCTTCTGGATGCAGGCTGCC  664
            ||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|
Sbjct  591  CCGGGACCTGCGGGCTGAGGATCTACCCATGCGTAACACTGTGGCCCTGCTACAGCTTTTAGATGCAGGCTGTC  664

Query  665  TGCGCCGCGTGGACCTGCGCTTCAACAATCTGGGCCTGCGCGGCCTGTCTGTGATCATCCCACACGTGGCCCGC  738
            |||||||..|.||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  665  TGCGCCGGATAGACCTGCGCTTCAATAACCTGGGCTTGCGTGGCCTGTCTGTCATTATCCCACATGTGGCCCGC  738

Query  739  TTCCAGCACCTGGCCAGCCTGCGGCTCCACTATGTGCATGGGGATTCAAGGCAGCCCTCCGTGGATGGCGAGGA  812
            ||.||||||.|.||.||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  739  TTTCAGCACTTAGCTAGCCTGAGGCTGCACTACGTGCATGGGGACTCAAGACAGCCTTCCGTGGACGGGGAGGA  812

Query  813  CAACTTCCGCTACTTCCTTGCCCAGATGGGCCGCTTCACCTGTCTGCGTGAGCTCAGCATGGGCTCCTCTCTCC  886
            ||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  813  CAACTTTCGCTACTTTCTGGCCCAGATGGGCCGGTTTATGTGTCTTCGGGAGCTCAGCATGGGGTCTTCTCTCC  886

Query  887  TTTCAGGGAGGCTGGACCAGCTGCTCAGCACCCTGCAGAGCCCCCTGGAGAGCCTGGAGTTGGCCTTCTGTGCT  960
            |||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.
Sbjct  887  TTTCAGGCAGGCTGGATCAACTGCTCAGCACCCTGCAGAGGCCCCTGGAAAGCCTAGAACTGGCCTTCTGTGCG  960

Query  961  CTGCTGCCTGAGGACCTACGCTTCCTGGCACGGAGCCCACATGCTGCCCACCTCAAGAAGTTGGACCTGAGTGG  1034
            ||..|||||||||||||||||||||||||.|.|||..|.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct  961  CTCTTGCCTGAGGACCTACGCTTCCTGGCTCAGAGTTCTCATGCTGCCCATCTCAAAAAGTTGGATTTGAGTGG  1034

Query 1035  TAACGACCTGTCTGGCAGCCAGCTGGCACCCTTCCAGGGTCTGTTGCAGGCATCAGCAGCCACACTGTTGCATC  1108
            .|||||||||||.||||.||||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|||..||||||||.||||||
Sbjct 1035  CAACGACCTGTCAGGCAACCAGTTGACACCCTTCCAGGGTCTGCTGCAGGCAGTAGCCACCACACTGCTGCATC  1108

Query 1109  TGGAGCTGACTGAGTGTCAGCTCGCAGACACCCAGCTGTTGGCCACACTACCCATCCTGACTCAGTGCGCCAGT  1182
            |.||||||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||.||.||||.|||.||||..||.||||||
Sbjct 1109  TTGAGCTGACTGAGTGCCAGCTTGCTGATGCCCAGCTGTTGGCTACCCTGCCCACCCTCACTCGATGTGCCAGT  1182

Query 1183  CTCCGGTACCTTGGCCTCTATGGCAACCCACTGTCCATGGCGGGCCTCAAGGAGCTGCTGCGGGACTCAGTGGC  1256
            |||||.||||||||.||||||||||||||..||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||||.
Sbjct 1183  CTCCGCTACCTTGGTCTCTATGGCAACCCTTTGTCTATGGCAGGACTTAAAGAACTGCTTCGGGACTCTGTGGT  1256

Query 1257  ACAGGCTGAGCTGCGTACTGTGGTGCACCCCTTCCCTGTGGACTGCTATGAGGG-CTTGCCCTGGCCGCCGCCT  1329
            ||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||.|||||.||.|||
Sbjct 1257  ACAGGCTGAGCTACGTACCGTGGTACACCCCTTCCCTGTGGACTGCTATGAGGGTCTT-CCTTGGCCACCACCT  1329

Query 1330  GCCTCTGTCCTGCTGGAGGCCTCCATCAATGAGGAGAAGTTTGCCCGCGTAGAAGCTGAGTTGCACCAGCTGCT  1403
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1330  GCCTCTGTCCTTCTGGAAGCCTCCATCAATGAGGAGAAGTTTGCCCGGGTGGAAGCTGAGTTACACCAACTGCT  1403

Query 1404  TCTAGCCTCAGGCCGTGCCCATGTGCTCTGGACCACGGACATCTACGGGCGACTGGCTGCGGACTACTTCAGCC  1477
            ..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1404  GTTAGCTTCGGGCCGTGCCCATGTGCTCTGGACCACAGACATCTATGGCCGGCTAGCTGCAGACTATTTTAGCC  1477

Query 1478  TA  1479
            |.
Sbjct 1478  TC  1479