Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07465
• Subject: XM_017014005.2
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1362
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ATGCACACGCTTGTGTTCTTGAGCACACGGCAGGTGCTGCAGTGCCAGCCAGCTGCCTGCCAGGCCCTGCCCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGCCACGCGAACTCTTCCCCCTGCTGTTCAAGGTGGCCTTCATGGACAAGAAGACAGTGGTACTGCGCGAGT  148
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGGACAAGAAGACAGTGGTACTGCGCGAGT  31

Query  149  TGGTACACACGTGGCCCTTCCCGCTGCTCAGTTTCCAGCAGCTGCTACAGGAGTGTGCCCACTGCAGCCGTGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  TGGTACACACGTGGCCCTTCCCGCTGCTCAGTTTCCAGCAGCTGCTACAGGAGTGTGCCCACTGCAGCCGTGCC  105

Query  223  CTCCTGCAGGAGCGGCCTAGCACTGAGAGCATGCAGGCTGTTATCCTGGGGCTGACTGCCCGGCTCCACACCTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  CTCCTGCAGGAGCGGCCTAGCACTGAGAGCATGCAGGCTGTTATCCTGGGGCTGACTGCCCGGCTCCACACCTC  179

Query  297  AGAGCCTGGGGCCAGCACACAGCCCCTCTGCAGGAAGCATGCGCTGCGGGTGCTGGACATGACGGGCCTCTTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  AGAGCCTGGGGCCAGCACACAGCCCCTCTGCAGGAAGCATGCGCTGCGGGTGCTGGACATGACGGGCCTCTTGG  253

Query  371  ATGATGGTGTGGAACAGGATCCTGGCACCATGAGCATGTGGGACTGTACTGCTGCCGTAGCTCGCACATGCATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  ATGATGGTGTGGAACAGGATCCTGGCACCATGAGCATGTGGGACTGTACTGCTGCCGTAGCTCGCACATGCATT  327

Query  445  GCCCAGCAGCAGGGTGGGGCCGCAGAGCCTGGGCCAGCCCCCATCCCCGTGGAGGTGCGCGTGGACCTGCGGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  GCCCAGCAGCAGGGTGGGGCCGCAGAGCCTGGGCCAGCCCCCATCCCCGTGGAGGTGCGCGTGGACCTGCGGGT  401

Query  519  GAACCGGGCCTCCTATGCGTTCCTGCGGGAGGCACTCCGAAGCAGCGTGGGCAGCCCGCTGCGGCTCTGCTGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  GAACCGGGCCTCCTATGCGTTCCTGCGGGAGGCACTCCGAAGCAGCGTGGGCAGCCCGCTGCGGCTCTGCTGCC  475

Query  593  GGGACCTGCGAGCTGAGGACCTGCCCATGCGCAACACTGTGGCCCTGCTGCAGCTTCTGGATGCAGGCTGCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  GGGACCTGCGAGCTGAGGACCTGCCCATGCGCAACACTGTGGCCCTGCTGCAGCTTCTGGATGCAGGCTGCCTG  549

Query  667  CGCCGCGTGGACCTGCGCTTCAACAATCTGGGCCTGCGCGGCCTGTCTGTGATCATCCCACACGTGGCCCGCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  CGCCGCGTGGACCTGCGCTTCAACAATCTGGGCCTGCGCGGCCTGTCTGTGATCATCCCACACGTGGCCCGCTT  623

Query  741  CCAGCACCTGGCCAGCCTGCGGCTCCACTATGTGCATGGGGATTCAAGGCAGCCCTCCGTGGATGGCGAGGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  CCAGCACCTGGCCAGCCTGCGGCTCCACTATGTGCATGGGGATTCAAGGCAGCCCTCCGTGGATGGCGAGGACA  697

Query  815  ACTTCCGCTACTTCCTTGCCCAGATGGGCCGCTTCACCTGTCTGCGTGAGCTCAGCATGGGCTCCTCTCTCCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  ACTTCCGCTACTTCCTTGCCCAGATGGGCCGCTTCACCTGTCTGCGTGAGCTCAGCATGGGCTCCTCTCTCCTT  771

Query  889  TCAGGGAGGCTGGACCAGCTGCTCAGCACCCTGCAGAGCCCCCTGGAGAGCCTGGAGTTGGCCTTCTGTGCTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  TCAGGGAGGCTGGACCAGCTGCTCAGCACCCTGCAGAGCCCCCTGGAGAGCCTGGAGTTGGCCTTCTGTGCTCT  845

Query  963  GCTGCCTGAGGACCTACGCTTCCTGGCACGGAGCCCACATGCTGCCCACCTCAAGAAGTTGGACCTGAGTGGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  GCTGCCTGAGGACCTACGCTTCCTGGCACGGAGCCCACATGCTGCCCACCTCAAGAAGTTGGACCTGAGTGGTA  919

Query 1037  ACGACCTGTCTGGCAGCCAGCTGGCACCCTTCCAGGGTCTGTTGCAGGCATCAGCAGCCACACTGTTGCATCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  ACGACCTGTCTGGCAGCCAGCTGGCACCCTTCCAGGGTCTGTTGCAGGCATCAGCAGCCACACTGTTGCATCTG  993

Query 1111  GAGCTGACTGAGTGTCAGCTCGCAGACACCCAGCTGTTGGCCACACTACCCATCCTGACTCAGTGCGCCAGTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  GAGCTGACTGAGTGTCAGCTCGCAGACACCCAGCTGTTGGCCACACTACCCATCCTGACTCAGTGCGCCAGTCT  1067

Query 1185  CCGGTACCTTGGCCTCTATGGCAACCCACTGTCCATGGCGGGCCTCAAGGAGCTGCTGCGGGACTCAGTGGCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  CCGGTACCTTGGCCTCTATGGCAACCCACTGTCCATGGCGGGCCTCAAGGAGCTGCTGCGGGACTCAGTGGCAC  1141

Query 1259  AGGCTGAGCTGCGTACTGTGGTGCACCCCTTCCCTGTGGACTGCTATGAGGGCTTGCCCTGGCCGCCGCCTGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  AGGCTGAGCTGCGTACTGTGGTGCACCCCTTCCCTGTGGACTGCTATGAGGGCTTGCCCTGGCCGCCGCCTGCC  1215

Query 1333  TCTGTCCTGCTGGAGGCCTCCATCAATGAGGAGAAGTTTGCCCGCGTAGAAGCTGAGTTGCACCAGCTGCTTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  TCTGTCCTGCTGGAGGCCTCCATCAATGAGGAGAAGTTTGCCCGCGTAGAAGCTGAGTTGCACCAGCTGCTTCT  1289

Query 1407  AGCCTCAGGCCGTGCCCATGTGCTCTGGACCACGGACATCTACGGGCGACTGGCTGCGGACTACTTCAGCCTA  1479
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  AGCCTCAGGCCGTGCCCATGTGCTCTGGACCACGGACATCTACGGGCGACTGGCTGCGGACTACTTCAGCCTA  1362