Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07465
- Subject:
- XM_017316558.1
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1267
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGCACACGCTTGTGTTCTTGAGCACACGGCAGGTGCTGCAGTGCCAGCCAGCTGCCTGCCAGGCCCTGCCCCT 74
||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCACACACTTGTGTTCCTCAGCACGCGTCAGGTCCTTCAGTGCCAGCCAGCTGCATGCCAGGCCCTGCCCCT 74
Query 75 GCTGCCACGCGAACTCTTCCCCCTGCTGTTCAAGGTGGCCTTCATGGACAAGAAGACAGTGGTACTGCGCGAGT 148
||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.|||.
Sbjct 75 GCTGCCCCGGGAACTCTTCCCTCTGCTCTTCAAGGTGGCCTTCATGGACAAAAAGACGCTTGTGCTGCGTGAGC 148
Query 149 TGGTACACACGTGGCCCTTCCCGCTGCTCAGTTTCCAGCAGCTGCTACAGGAGTGTGCCCACTGCAGCCGTGCC 222
||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 TGGTGCACACGTGGCCCTTTCCCCTGCTCAGCTTCCAGCAGCTGCTGCAGGAGTGTGCCCACTGCAGTCGAGCC 222
Query 223 CTCCTGCAGGAGCGGCCTAGCACTGAGAGCATGCAGGCTGTTATCCTGGGGCTGACTGCCCGGCTCCACACCTC 296
||.|||||||||||||..|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|||| |||
Sbjct 223 CTGCTGCAGGAGCGGCTCAGCACAGAAAGCATGCAGGCTGTGATCCTGGGGCTGACAGCTCGGATTCACA-CTC 295
Query 297 -AGAGCCTGGGGCCAGCACACAGCCCCTCTGCAGGAAGCATGCGCTGCGGGTGCTGGACATGACGGGCCTCTTG 369
|||..|.|.|||..||||.||||||.|.||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct 296 AAGAAACAGAGGCTGGCACGCAGCCCTTGTGCAGGAAGCATGCATTGCGGGTTCTGGACATGACGGGTCTCCTG 369
Query 370 GATGATGGTGTGGAACAGGATCCTGGCACCATGAGCATGTGGGACTGTACTGCTGCCGTAGCTCGCACATGCAT 443
||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||..|.||.|||||
Sbjct 370 GATGATGGTGTGGAGCAGGATCCTGAAACCATGAGCATGTGGGACTGTACAGCCGCTGTAGCCAGAACGTGCAT 443
Query 444 TGCCCAGCAGCAGGGTGGGGCCGCAGAGCCTGGGCCAGCCCCCA-TCCCCGTGGAGGTGCGCGTGGACCTGCGG 516
|||||||||||||||||||.|.||.|||||.||| |.|.|.||| ||||||||||..|.||.||.|||||.|||
Sbjct 444 TGCCCAGCAGCAGGGTGGGACTGCCGAGCCAGGG-CTGTCACCAGTCCCCGTGGAAATCCGAGTAGACCTTCGG 516
Query 517 GTGAACCGGGCCTCCTATGCGTTCCTGCGGGAGGCACTCCGAAGCAGCGTGGGCAGCCCGCTGCGGCTCTGCTG 590
||.|||||||||||.||..|.|||||.||.|||||.||||.||||||.||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 517 GTAAACCGGGCCTCGTACACATTCCTTCGTGAGGCCCTCCAAAGCAGTGTGGCCAGCCCGCTGCGGCTGTGCTG 590
Query 591 CCGGGACCTGCGAGCTGAGGACCTGCCCATGCGCAACACTGTGGCCCTGCTGCAGCTTCTGGATGCAGGCTGCC 664
||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 591 CCGGGACCTGCGGGCTGAGGATCTACCCATGCGTAACACTGTGGCCCTGCTACAGCTTTTAGATGCAGGCTGTC 664
Query 665 TGCGCCGCGTGGACCTGCGCTTCAACAATCTGGGCCTGCGCGGCCTGTCTGTGATCATCCCACACGTGGCCCGC 738
|||||||..|.||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 665 TGCGCCGGATAGACCTGCGCTTCAATAACCTGGGCTTGCGTGGCCTGTCTGTCATTATCCCACATGTGGCCCGC 738
Query 739 TTCCAGCACCTGGCCAGCCTGCGGCTCCACTATGTGCATGGGGATTCAAGGCAGCCCTCCGTGGATGGCGAGGA 812
||.||||||.|.||.||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 739 TTTCAGCACTTAGCTAGCCTGAGGCTGCACTACGTGCATGGGGACTCAAGACAGCCTTCCGTGGACGGGGAGGA 812
Query 813 CAACTTCCGCTACTTCCTTGCCCAGATGGGCCGCTTCACCTGTCTGCGTGAGCTCAGCATGGGCTCCTCTCTCC 886
||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|..|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 813 CAACTTTCGCTACTTTCTGGCCCAGATGGGCCGGTTTATGTGTCTTCGGGAGCTCAGCATGGGGTCTTCTCTCC 886
Query 887 TTTCAGGGAGGCTGGACCAGCTGCTCAGCACCCTGCAGAGCCCCCTGGAGAGCCTGGAGTTGGCCTTCTGTGCT 960
|||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.
Sbjct 887 TTTCAGGCAGGCTGGATCAACTGCTCAGCACCCTGCAGAGGCCCCTGGAAAGCCTAGAACTGGCCTTCTGTGCG 960
Query 961 CTGCTGCCTGAGGACCTACGCTTCCTGGCACGGAGCCCACATGCTGCCCACCTCAAGAAGTTGGACCTGAGTGG 1034
||..|||||||||||||||||||||||||.|.|||..|.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct 961 CTCTTGCCTGAGGACCTACGCTTCCTGGCTCAGAGTTCTCATGCTGCCCATCTCAAAAAGTTGGATTTGAGTGG 1034
Query 1035 TAACGACCTGTCTGGCAGCCAGCTGGCACCCTTCCAGGGTCTGTTGCAGGCATCAGCAGCCACACTGTTGCATC 1108
.|||||||||||.||||.||||.||.|||||||||||||||||.||||||||..|||..||||||||.||||||
Sbjct 1035 CAACGACCTGTCAGGCAACCAGTTGACACCCTTCCAGGGTCTGCTGCAGGCAGTAGCCACCACACTGCTGCATC 1108
Query 1109 TGGAGCTGACTGAGTGTCAGCTCGCAGACACCCAGCTGTTGGCCACACTACCCATCCTGACTCAGTGCGCCAGT 1182
|.||||||||||||||.|||||.||.||..|||||||||||||.||.||.||||.|||.||||..||.||||||
Sbjct 1109 TTGAGCTGACTGAGTGCCAGCTTGCTGATGCCCAGCTGTTGGCTACCCTGCCCACCCTCACTCGATGTGCCAGT 1182
Query 1183 CTCCGGTACCTTGGCCTCTATGGCAACCCACTGTCCATGGCGGGCCTCAAGGAGCTGCTGCGGGACTCAGTGGC 1256
|||||.||||||||.||||||||||||||..||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||||.
Sbjct 1183 CTCCGCTACCTTGGTCTCTATGGCAACCCTTTGTCTATGGCAGGACTTAAAGAACTGCTTCGGGACTCTGTGGT 1256
Query 1257 ACAGGCTGAGCTGCGTACTGTGGTGCACCCCTTCCCTGTGGACTGCTATGAGGG-CTTGCCCTGGCCGCCGCCT 1329
||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||.|||||.||.|||
Sbjct 1257 ACAGGCTGAGCTACGTACCGTGGTACACCCCTTCCCTGTGGACTGCTATGAGGGTCTT-CCTTGGCCACCACCT 1329
Query 1330 GCCTCTGTCCTGCTGGAGGCCTCCATCAATGAGGAGAAGTTTGCCCGCGTAGAAGCTGAGTTGCACCAGCTGCT 1403
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1330 GCCTCTGTCCTTCTGGAAGCCTCCATCAATGAGGAGAAGTTTGCCCGGGTGGAAGCTGAGTTACACCAACTGCT 1403
Query 1404 TCTAGCCTCAGGCCGTGCCCATGTGCTCTGGACCACGGACATCTACGGGCGACTGGCTGCGGACTACTTCAGCC 1477
..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 1404 GTTAGCTTCGGGCCGTGCCCATGTGCTCTGGACCACAGACATCTATGGCCGGCTAGCTGCAGACTATTTTAGCC 1477
Query 1478 TA 1479
|.
Sbjct 1478 TC 1479