Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07469
Subject:
NM_001159603.1
Aligned Length:
1186
Identities:
1174
Gaps:
0

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
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Sbjct    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
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Sbjct   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNTSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  222
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Sbjct  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNSEVNSVLSPRSESGGLGVSMV  222

Query  223  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  296
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Sbjct  223  EYVLSSSPGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDADVKDFS  296

Query  297  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  370
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Sbjct  297  RTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGTQVPVD  370

Query  371  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAG  444
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Sbjct  371  SAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGLAPAAFVPNPYIISAAPPGTDPYTAG  444

Query  445  LAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQN  518
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Sbjct  445  LAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGASQRPLTPNQN  518

Query  519  QQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSS  592
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Sbjct  519  QQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLVAPAPVIISSS  592

Query  593  AAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQSSSLFSQGSA  666
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Sbjct  593  AAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQSSSLFSQGSA  666

Query  667  QPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHSFYNGLSFSSS  740
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Sbjct  667  QPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHSFYSSLSYSSS  740

Query  741  PGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSS  814
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Sbjct  741  PGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSLFSPSSTLFSS  814

Query  815  SRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAERQLVFNEILQA  888
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Sbjct  815  SRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAERQLVFNEILQA  888

Query  889  AYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQNEMVRELDGHVL  962
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Sbjct  889  AYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQNEMVRELDGHVL  962

Query  963  KCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQL  1036
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Sbjct  963  KCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLPILEELHQHTEQL  1036

Query 1037  VQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHS  1110
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Sbjct 1037  VQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLIDEVCTMNDGPHS  1110

Query 1111  ALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNG  1184
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Sbjct 1111  ALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNGVDLGPICGPPNG  1184

Query 1185  II  1186
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Sbjct 1185  II  1186