Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07469
• Subject: XM_011250359.2
• Aligned Length: 1198
• Identities: 945
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  MSVACVLKRKAVLWQDSFSPHLKHHPQEPANPNMPVVLTSGTGSQAQPQPAANQALAAGTHSSPVPGSIGVAGR  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  SQDDAMVDYFFQRQHGEQLGGGGSGGGGYNNSKHRWPTGDNIHAEHQVRSMDELNHDFQALALEGRAMGEQLLP  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GKKFWETDESSKDGPKGIFLGDQWRDSAWGTSDHSVSQPIMVQRRPGQSFHVNS---EVNSVLSPRSESGGLGV  219
                                                  ...|...|..|..|.|   ..|.......|      
Sbjct    1  --------------------------------------MLVVGTKPSSSCQVKSFGKQMNPAKMDQKE------  30

Query  220  SMVEYVLSSS--PGDSCLRKGGFGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDAD  291
              ...|....  ||..      .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  --YSWVINGETVPGEH------QGPRDADSDENDKGEKKNKGTFDGDKLGDLKEEGDVMDKTNGLPVQNGIDAD  96

Query  292  VKDFSRTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGT  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  VKDFSRTPGNCQNSANEVDLLGPNQNGSEGLAQLTSTNGAKPVEDFSNMESQSVPLDPMEHVGMEPLQFDYSGT  170

Query  366  QVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHI-----GLAPAAFVPNPYIISAA  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||
Sbjct  171  QVPVDSAAATVGLFDYNSQQQLFQRPNALAVQQLTAAQQQQYALAAAHQPHIGMFPAGLAPAAFVPNPYIISAA  244

Query  435  PPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSANQQTTPQAQQGQQQVLRGGA  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||
Sbjct  245  PPGTDPYTAGLAAAATLGPAVVPHQYYGVTPWGVYPASLFQQQAAAAAAATNSATQQSAPQAQQGQQQVLRGGA  318

Query  509  SQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLV  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  SQRPLTPNQNQQGQQTDPLVAAAAVNSALAFGQGLAAGMPGYPVLAPAAYYDQTGALVVNAGARNGLGAPVRLV  392

Query  583  APAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPNNNLASSSFYGNNSLNSNSQ  656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  393  APAPVIISSSAAQAAVAAAAASANGAAGGLAGTTNGPFRPLGTQQPQPQPQQQPSNNLASSSFYGNNSLSSNSQ  466

Query  657  SSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLTPIGHS  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  467  SSSLFSQGSAQPANTSLGFGSSSSLGATLGSALGGFGTAVANSNTGSGSRRDSLTGSSDLYKRTSSSLAPIGHS  540

Query  731  FYNGLSFSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSL  804
            ||..||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  FYSSLSYSSSPGPVGMPLPSQGPGHSQTPPPSLSSHGSSSSLNLGGLTNGSGRYISAAPGAEAKYRSASSASSL  614

Query  805  FSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATPAER  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  615  FSPSSTLFSSSRLRYGMSDVMPSGRSRLLEDFRNNRYPNLQLREIAGHIMEFSQDQHGSRFIQLKLERATAAER  688

Query  879  QLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSLEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQ--  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  689  QLVFNEILQAAYQLMVDVFGNYVIQKFFEFGSHEQKLALAERIRGHVLSLALQMYGCRVIQKALEFIPSDQQVI  762

Query  951  NEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLP  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  NEMVRELDGHVLKCVKDQNGNHVVQKCIECVQPQSLQFIIDAFKGQVFALSTHPYGCRVIQRILEHCLPDQTLP  836

Query 1025  ILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLI  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837  ILEELHQHTEQLVQDQYGNYVIQHVLEHGRPEDKSKIVAEIRGNVLVLSQHKFASNVVEKCVTHASRTERAVLI  910

Query 1099  DEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNG  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911  DEVCTMNDGPHSALYTMMKDQYANYVVQKMIDVAEPGQRKIVMHKIRPHIATLRKYTYGKHILAKLEKYYMKNG  984

Query 1173  VDLGPICGPPNGII  1186
            ||||||||||||||
Sbjct  985  VDLGPICGPPNGII  998