Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07480
• Subject: NM_001100164.2
• Aligned Length: 1935
• Identities: 1899
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATG--------------GACAACGC-------------------CGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGC  41
            |||              |.|.||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCAGACCTCGGTGTCCACGCTGTCCCCGCAGCCCGGCAGCGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGC  74

Query   42  AAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAACACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTA  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAACACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTA  148

Query  116  AAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAA  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGAAGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAA  222

Query  190  AGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAGCTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGA  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAGCTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGA  296

Query  264  TGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAACGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGG  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAACGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGG  370

Query  338  AAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCTCTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAA  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCTCTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAA  444

Query  412  GATAAGAAAGAGAACACTGAAAACCACTCTGAAACACCGGCAGCTCCTGCTCTACCTCCTTCTGCTCCTCCTAA  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATAAGAAAGAGAACACTGAAAACCACTCTGAAACACCGGCAGCTCCTGCTCTACCTCCTTCTGCTCCTCCTAA  518

Query  486  GCCTAGACCCAAACCTAAACCCAAAAAATCACCTGTGCCTCCGAAAGGGGCCACTGCTGGGGCCAGCCACAAAG  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCTAGACCCAAACCTAAACCCAAAAAATCACCTGTGCCTCCGAAAGGGGCCACTGCTGGGGCCAGCCACAAAG  592

Query  560  GTGATGAAGTGCCTCCCATTAAAAAAAATATCAAGGCTCCTGGTAAGCAGGCCCCCGTCCCTCCACCCAAGCCA  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGATGAAGTGCCTCCCATTAAAAAAAATACCAAGGCTCCTGGTAAGCAGGCCCCCGTCCCTCCACCCAAGCCA  666

Query  634  GCAAGCCGAAACACGACCCGAGAGGCTGCTGGCTCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGC  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAGCCGAAACACGACCCGAGAGGCTGCTGGCTCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGC  740

Query  708  TTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCCCAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAG  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCCCAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAG  814

Query  782  TGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACAAGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACT  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACAAGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACT  888

Query  856  TCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCAGAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCC  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCAGAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCC  962

Query  930  TGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAAGTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTC  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAAGTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTC  1036

Query 1004  CTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGTGCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTT  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGTGCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTT  1110

Query 1078  GGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCAAGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCAC  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCAAGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCAC  1184

Query 1152  TCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAGAGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAGAGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGA  1258

Query 1226  AGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGATGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAA  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGATGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAA  1332

Query 1300  GGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGACTCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGA  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGACTCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGA  1406

Query 1374  CGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTTGGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAAC  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTTGGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAAC  1480

Query 1448  TTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGGACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAG  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGGACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAG  1554

Query 1522  GAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTCAGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCA  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTCAGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCA  1628

Query 1596  AAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGAGGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCA  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGAGGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCA  1702

Query 1670  GAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGCTACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAA  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGCTACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAA  1776

Query 1744  GTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCAGACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGC  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCAGACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGC  1850

Query 1818  AATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCACAGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGT  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCACAGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGT  1924

Query 1892  TTCATCGTCCA  1902
            |||||||||||
Sbjct 1925  TTCATCGTCCA  1935