Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07480
• Subject: NM_001100166.2
• Aligned Length: 1902
• Identities: 1662
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGGACAACGCCGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGCAAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAACGCCGTTGACGGACTGGACAAAGCTTCTATAGCAAACTCAGATGGCCCCACAGCAGGTTCCCAAAC  74

Query   75  ACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTAAAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCTCCCTTCAAAAGAAAGGGGAAACTATCCACCATTGGTAAAATCTTTAAGCCTTGGAAATGGAGGAAAAAGA  148

Query  149  AGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAAAGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGACCAGCGACAAATTTAGAGAAACCTCGGCAGTATTAGAAAGGAAGATATCCACACGACAAAGTAGAGAGGAG  222

Query  223  CTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGATGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGATAAGAAGGGGAGTGCTTAAGGAATTGCCTGATCAAGATGGAGATGTAACAGTTAACTTTGAAAATTCAAA  296

Query  297  CGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGGAAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGGCACATGATACCCATCGGAGAGGAATCTACCCGAGAGGAAAATGTAGTAAAGTCTGAAGAAGGTAATGGCT  370

Query  371  CTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAAGATAAGAAAGAGAACACTGAAAACCACTCTGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct  371  CTGTATCTGAAAAAACACCACCTCTGGAGGAACAGGCAGAAGATAAGAAA------------------------  420

Query  445  ACACCGGCAGCTCCTGCTCTACCTCCTTCTGCTCCTCCTAAGCCTAGACCCAAACCTAAACCCAAAAAATCACC  518
                                                                                      
Sbjct  421  --------------------------------------------------------------------------  420

Query  519  TGTGCCTCCGAAAGGGGCCACTGCTGGGGCCAGCCACAAAGGTGATGAAGTGCCTCCCATTAAAAAAAATATCA  592
                                                                                      
Sbjct  421  --------------------------------------------------------------------------  420

Query  593  AGGCTCCTGGTAAGCAGGCCCCCGTCCCTCCACCCAAGCCAGCAAGCCGAAACACGACCCGAGAGGCTGCTGGC  666
                                                                                ||||||
Sbjct  421  --------------------------------------------------------------------GCTGGC  426

Query  667  TCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGCTTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  427  TCCTCTCATTCAAAAAAAACAACTGGCTCTAAAGCATCAGCTTCGCCATCCACTTCATCCACCTCATCTCGTCC  500

Query  741  CAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAGTGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  CAAAGCTTCAAAGGAGACAGTTTCTAGCAAAGCAGGGACAGTGGGGACCACCAAGGGCAAGAGAAAAACTGACA  574

Query  815  AGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACTTCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  AGCAGCCAATAACTTCTCACCTGTCCTCAGACACAACAACTTCTGGCACATCCGACCTGAAAGGAGAGCCTGCA  648

Query  889  GAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCCTGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  GAGACCAGAGTGGAGAGTTTCAAACTCGAACAGACTGTCCCTGGAGCTGAGGAGCAGAACACAGGCAAATTCAA  722

Query  963  GTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTCCTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  GTCCATGGTCCCTCCACCCCCTGTGGCTCCAGCACCTTCTCCTCTGGCCCCCCCTCTCCCTCTTGAGGATCAGT  796

Query 1037  GCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTTGGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  797  GCATTACTGCCTCAGACACTCCAGTTGTCCTCGTCAGCGTTGGAGCTGACCTGCCCGTCTCTGCCTTAGACCCA  870

Query 1111  AGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCACTCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  AGTCAGCTTCTTTGGGCTGAAGAGCCGACGAACAGAACCACTCTCTACTCAGGCACTGGCTTAAGTGTTAACAG  944

Query 1185  AGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGAAGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  AGAAAATGCAAAATGTTTCACAACCAAAGAGGAGCTGGGGAAGACAGTGCCTCAGCTACTGACTCCTGGGCTGA  1018

Query 1259  TGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAAGGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019  TGGGCGAATCTTCAGAATCCTTTAGTGCCTCAGAAGATGAAGGCCACAGGGAATACCAAGCCAATGACTCTGAC  1092

Query 1333  TCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGACGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  TCGGACGGGCCTATCTTGTACACCGATGATGAGGACGAAGACGAAGATGAGGATGGCAGTGGAGAAAGTGCTTT  1166

Query 1407  GGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAACTTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167  GGCAAGTAAAATACGCCGGAGGGATACTCTTGCTATCAAACTTGGCAACAGACCATCTAAGAAAGAACTAGAGG  1240

Query 1481  ACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAGGAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241  ACAAAAACATCTTGCAGCGTACATCTGAAGAAGAGAGGCAGGAAATCCGACAACAAATTGGAACCAAGTTAGTC  1314

Query 1555  AGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCAAAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  AGGAGGCTGAGCCAGAGGCCCACAACTGAAGAATTAGAGCAAAGAAACATCCTAAAACAAAAGAATGAAGAAGA  1388

Query 1629  GGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCAGAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389  GGAACAAGAAGCAAAAATGGAACTTAAACGCAGACTCAGCAGAAAGCTCAGCCTGAGACCCACAGTGGCAGAGC  1462

Query 1703  TACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAAGTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463  TACAAGCTCGAAGGATCCTGCGATTTAACGAGTATGTAGAAGTCACGGATTCTCCTGACTATGACCGCCGAGCA  1536

Query 1777  GACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGCAATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537  GACAAGCCCTGGGCCAGGTTAACACCTGCAGACAAGGCAGCAATAAGGAAAGAACTAAATGAATTTAAAAGCAC  1610

Query 1851  AGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGTTTCATCGTCCA  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611  AGAAATGGAAGTTCATGAAGAGAGTCGACAGTTTACAAGGTTTCATCGTCCA  1662