Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07497
- Subject:
- XM_017011542.2
- Aligned Length:
- 3233
- Identities:
- 3104
- Gaps:
- 109
Alignment
Query 1 ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCTGCTGCTGGTGACAATTGCAGGTTGTGCCCGTAAGCAGTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCTGCTGCTGGTGACAATTGCAGGTTGTGCCCGTAAGCAGTG 74
Query 75 CAGCGAGGGGAGGACATATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGGGTGTCTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGCGAGGGGAGGACATATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGGGTGTCTC 148
Query 149 ACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCTGTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTGGTTCGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCTGTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTGGTTCGAG 222
Query 223 GGCCGCTGCTACCTGGTGAGCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCAGGTCTTA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCCGCTGCTACCTGGTGAGCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCAGGTCTTA 296
Query 297 TCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCTGGACTATGGGGACATGATGCTGAACAGGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCTGGACTATGGGGACATGATGCTGAACAGGG 370
Query 371 GCTCCCCCTCGGGGATCTGGGGGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGCCCTTTCTAGGCAAAGATTGG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTCCCCCTCGGGGATCTGGGGGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGACCTTTCTAGGCAAAGATTGG 444
Query 445 GGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGAGAAGGACCTCTTGCAACCCAGTGGCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGAGAAGGACCTCTTGCAACCCAGTGGCAA 518
Query 519 GCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCGAGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTCAACTCCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCGAGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTCAACTCCT 592
Query 593 CTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGAGCTCCATTACCTGAATGAGTCGGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGAGCTCCATTACCTGAATGAGTCGGCT 666
Query 667 TCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTGAGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAGGAGAGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTGAGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAGGAGAGGT 740
Query 741 GTTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTCTGGAAAAGAGGTTCTAATGCCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTCTGGAAAAGAGGTTCTAATGCCTT 814
Query 815 CCCATAGTCTTCCTCCGGCAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCACAGTCACC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCATAGTCTTCCTCCGGCAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCACAGTCACC 888
Query 889 CCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGCAGCCCCCTCTGAGTCCACCCCATCTGAGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGCAGCCCCCTCTGAGTCCACCCCATCTGAGCT 962
Query 963 ACCCATATCTCCTACCACTGCTCCCAGGACAGTGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGATAACCTAATTATAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACCCATATCTCCTACCACTGCTCCCAGGACAGTGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGATAACCTAATTATAA 1036
Query 1037 CTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGTTGCGCCAGCGCCACCTGTAGAAACAACCTACAACTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGTTGCGCCAGCGCCACCTGTAGAAACAACCTACAACTAT 1110
Query 1111 GAATGGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGACACAAGCAAACTCTTAACCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAATGGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGACACAAGCAAACTCTTAACCT 1184
Query 1185 CTCTCAATTGTCCGTCGGACTTTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAAGGATTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCTCAATTGTCCGTCGGACTTTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAAGGATTTG 1258
Query 1259 TCAATGTCACTGTTAAGCCTGCCAGAAGAGTCAACCTGCCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACTGCAAGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCAATGTCACTGTTAAGCCTGCCAGAAGAGTCAACCTGCCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACTGCAAGAG 1332
Query 1333 CTCACTTTGCCTTTGACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCAAAGTACAGATGATACTGAAATAGTGAGTTATCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCACTTTGCCTTTGACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCAAAGTACAGATGATACTGAAATAGTGAGTTATCA 1406
Query 1407 TTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAAGAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTGTCTAACC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAAGAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTGTCTAACC 1480
Query 1481 TTGATCCTGGTAACTATAGTTTCAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACGGAGCCACTAACTCTACAACTGCAGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTGATCCTGGTAACTATAGTTTCAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACGGAGCCACTAACTCTACAACTGCAGCC 1554
Query 1555 CTAATAGTGAACAATGCTGTGGACTACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTTTGCCCCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTAATAGTGAACAATGCTGTGGACTACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTTTGCCCCA 1628
Query 1629 AAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTGTCCTCTATGAGTGGTCCCTGGGTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTGTCCTCTATGAGTGGTCCCTGGGTC 1702
Query 1703 CTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTCATGCAGGGAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAATGCAGGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTCATGCAGGGAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAATGCAGGAA 1776
Query 1777 GGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGCAACAGTCTACTGCTGTGGTGACTGTGATTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGCAACAGTCTACTGCTGTGGTGACTGTGATTGT 1850
Query 1851 CCAGCCTGAAAACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTTCCCAGTGGAAAGTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCAGCCTGAAAACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTTCCCAGTGGAAAGTG 1924
Query 1925 CTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACGGCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAGAGGCCCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACGGCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAGAGGCCCC 1998
Query 1999 AGTGCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCTCCAGGTGGGGACCTACCACTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGTGCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCTCCAGGTGGGGACCTACCACTT 2072
Query 2073 CCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGACTGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAGGAAAATA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGACTGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAGGAAAATA 2146
Query 2147 ATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCTTCCCAATAATTCCATTACTTTGGATGGT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCTTCCCAATAATTCCATTACTTTGGATGGT 2220
Query 2221 TCAAGGTCTACTGATGACCAAAGAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAGCTGGAGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TCAAGGTCTACTGATGACCAAAGAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAGCTGGAGA 2294
Query 2295 TGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCTTACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACTTTCCACT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCTTACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACTTTCCACT 2368
Query 2369 TGCGAGTCACCGACAGTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGACCCTAGGAAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGCGAGTCACCGACAGTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGACCCTAGGAAG 2442
Query 2443 AGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGGTGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCCTTGTGAG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGGTGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCCTTGTGAG 2516
Query 2517 GCAGCTGGCTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGGGCCCACTCGGATCTCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCAGCTGGCTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGGGCCCACTCGGATCTCA 2590
Query 2591 GCACCGTGATTGTGTTTTATGTACAGAACAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGCCCGAAAT 2664
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GCACCGTGATTGTGTTTTATGTACAGAGCAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGCCCGAAAT 2664
Query 2665 CTGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTCTTGAGGGTTGATACAGCAGGTTG 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTCTTGAGGGTTGATACAGCAGGTTG 2738
Query 2739 CCTTCTGAAGTGTTCTGGCCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTATGGATGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCTTCTGAAGTGTTCTGGCCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTATGGATGG 2812
Query 2813 AGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGTGAGTGGAGTATATTCTATGTGACAGTGTTG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGTGAGTGGAGTATATTCTATGTGACAGTGTTG 2886
Query 2887 GCTTTTACTCTTATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAAGACAAAAAAGGAC 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GCTTTTACTCTTATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAAGACAAAAAAGGAC 2960
Query 2961 TAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACCATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTGAGGCCCA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACCATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTGAGGCCCA 3034
Query 3035 AATATGGTATCAAGCACCGAAGCACAG---AGCACAACTCCAGCCTGATGGTATCCGAG---TCTGAGTTTGAC 3102
||||| ||||.|.|| ||.|| ||.||| .||| ||||
Sbjct 3035 AATAT-------------GAAGAAGAGATTAGGAC--CTGCAG------------AGAGACATCTG-------- 3073
Query 3103 AGTG-AC-CAGGACACAATCTTCAGCCGAGAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCC 3174
|.| || |||| |||| |||.||||||...|.||||..|| || ||.|||.|...||
Sbjct 3074 -GGGCACGCAGG-CACA----------GAGGAAAGATCATGGGAGGACAT-----GG----CAAGAAGGCGGCC 3126
Query 3175 ATC---------AGAAATGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA 3216
||| |||
Sbjct 3127 ATCTACAAGCCAAGA------------------------------------ 3141