Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07503
Subject:
NM_001252637.1
Aligned Length:
696
Identities:
618
Gaps:
1

Alignment

Query   1  MDADMDYERPNVETIKCVVVGDNAVGKTRLICARACNTTLTQYQLLATHVPTVWAIDQYRVCQEVLERSRDVVD  74
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MDSDMDYERPNVETIKCVVVGDNAVGKTRLICARACNTTLTQYQLLATHVPTVWAIDQYRVCQEVLERSRDVVD  74

Query  75  EVSVSLRLWDTFGDHHKDRRFAYGRSDVVVLCFSIANPNSLNHVKSMWYPEIKHFCPRTPVILVGCQLDLRYAD  148
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  75  EVSISLRLWDTFGDHHKDRRFAYGRSDVVVLCFSIANPNSLNHVKTMWYQEIKHFCPRTPVVLVGCQLDLRYAD  148

Query 149  LEAVNRARRPLARPIKRGDILPPEKGREVAKELGLPYYETSVFDQFGIKDVFDNAIRAALISRRHLQFWKSHLK  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LEAVNRARRPLARPIKRGDILPPEKGREVAKELGIPYYETSVFDQFGIKDVFDNAIRAALISRRHLQFWKSHLK  222

Query 223  KVQKPLLQAPFLPPKAPPPVIKIPECPSMGTNEAACLLDNPLCADVLFILQDQEHIFAHRIYLATSSSKFYDLF  296
           ||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 223  KVQKPLLQAPFLPPKAPPPVIKVPECPSAGTSDAACLLDNPLCADVLFVLHDEEHIFAHRIYLATSSSKFYDLF  296

Query 297  LMECEESPNGSEGACEKEKQSRDFQGRILSVDPEEEREEGPPRIPQADQWKSSNKSLVEALGLEAEGAVPETQT  370
           ||||||||....||.| |...||||||..|....||..|||.|.||||...||...|.|.|.|..|....|...
Sbjct 297  LMECEESPCWGGGAGE-EVPCRDFQGRTQSLGSAEEGKEGPQRTPQADPGASSGQDLPESLALQMEASGSEGHA  369

Query 371  LTGWSKGFIGMHREMQVNPISKRMGPMTVVRMDASVQPGPFRTLLQFLYTGQLDEKEKDLVGLAQIAEVLEMFD  444
           |.||||||..||||..|||||||.||.||||.|.|.|.|||||||.|||.||||||||||.||||.||||||||
Sbjct 370  LSGWSKGFVSMHREVRVNPISKRVGPVTVVRLDPSMQSGPFRTLLRFLYSGQLDEKEKDLLGLAQMAEVLEMFD  443

Query 445  LRMMVENIMNKEAFMNQEITKAFHVRKANRIKECLSKGTFSDVTFKLDDGAISAHKPLLICSCEWMAAMFGGSF  518
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  LRMMVENIMNKEAFMNQEITKAFHVRKANRIKECLSKGTFSDVTFTLDDGAISAHKPLLICSCEWMAAMFGGSF  517

Query 519  VESANSEVYLPNINKISMQAVLDYLYTKQLSPNLDLDPLELIALANRFCLPHLVALAEQHAVQELTKAATSGVG  592
           |||||.||.||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||.
Sbjct 518  VESANREVHLPNINKMSMQAVLEYLYTKQLSPNLDLDPLELIALANRFCLTHLVALVEQHAVQELTKAAVSGVS  591

Query 593  IDGEVLSYLELAQFHNAHQLAAWCLHHICTNYNSVCSKFRKEIKSKSADNQEYFERHRWPPVWYLKEEDHYQRV  666
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  IDGEVLSYLELAQFHNANQLAAWCLHHICTNYNSVCSKFRKEIKSKSADNQEYFERHRWPPVWYLKEEDHYQRV  665

Query 667  KREREKEDIALNKHRSRRKWCFWNSSPAVA  696
           ||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 666  KREREKEDLALNKHHSRRKWCFWHSSPAVA  695