Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07503
- Subject:
- NM_001350908.2
- Aligned Length:
- 2088
- Identities:
- 1727
- Gaps:
- 360
Alignment
Query 1 ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC 370
||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------ATGTGGTATC 10
Query 371 CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC 84
Query 445 CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA 158
Query 519 AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 159 AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG 232
Query 593 ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233 ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG 306
Query 667 AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA 380
Query 741 GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381 GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC 454
Query 815 TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455 TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT 528
Query 889 TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAACGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA 602
Query 963 GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT 676
Query 1037 GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT 750
Query 1111 TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 751 TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG 824
Query 1185 GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 825 GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA 898
Query 1259 CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT 972
Query 1333 TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 973 TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT 1046
Query 1407 AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047 AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG 1120
Query 1481 GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121 GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT 1194
Query 1555 GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTATCT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTATCT 1268
Query 1629 CTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269 CTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCC 1342
Query 1703 TGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343 TGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGC 1416
Query 1777 ATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGGCCGCCTGGTGTTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 ATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTGGCCGCCTGGTGTTT 1490
Query 1851 GCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGACA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 GCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATCAAAATCTGCAGACA 1564
Query 1925 ACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATCACTACCAGCGTGTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565 ACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATCACTACCAGCGTGTG 1638
Query 1999 AAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAATTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639 AAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGGTGCTTCTGGAATTC 1712
Query 2073 ATCTCCAGCAGTGGCC 2088
||||||||||||||||
Sbjct 1713 ATCTCCAGCAGTGGCC 1728