Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07503
• Subject: XM_011540426.1
• Aligned Length: 2106
• Identities: 1789
• Gaps: 291

Alignment

Query    1  ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT  74

Query   75  GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG  148

Query  149  TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT  222

Query  223  GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG  296

Query  297  GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC  370

Query  371  CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC  444

Query  445  CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA  518

Query  519  AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG  592

Query  593  ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG  666

Query  667  AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA  740

Query  741  GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC  814

Query  815  TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT  888

Query  889  TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAACGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA  962

Query  963  GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGGCGGATATTGAGTGTCGACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGACCAGT  1036

Query 1037  GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGAGGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCTGAGACACAGACT  1110

Query 1111  TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTCAAAGCGGATGGG  1184

Query 1185  GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCATGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTCCAGTTTCTTTATA  1258

Query 1259  CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCCTCGAGATGTTCGAT  1332

Query 1333  TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACGAAAGCCTTTCACGT  1406

Query 1407  AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATTTAAATTGGACGATG  1480

Query 1481  GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGTTCGGGGGGTCATTT  1554

Query 1555  GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTATCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCAGTATTGGATTATCT  1628

Query 1629  CTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGCAAACAGATTTTGCC  1702

Query 1703  TGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCACGAGTGGCGTGGGC  1776
            |||||||||||||||||||||||||...|  |.|.|||..|.||.||    ||||.|           ||..||
Sbjct 1703  TGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGATTTG--TTCAGTTGGGAAGCTG----AAGCAG-----------GTCTGC  1759

Query 1777  ATTGACGGAGAAGTGCTCT-------CTTACT-TGGAATT----------GGCTCAGTTTCACAATGCCCACCA  1832
            ||   .|||.|..||..||       |||.|| |||||||          |.||||  |||||  |...|||||
Sbjct 1760  AT---AGGATATATGAACTTAAATGCCTTTCTCTGGAATTCAGATCTTCAGCCTCA--TTCAC--TTTACACCA  1826

Query 1833  GTTGGCCGCCTGGTGTTTGCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCA  1906
            |         .||.||                                                          
Sbjct 1827  G---------AGGAGT----------------------------------------------------------  1833

Query 1907  AATCAAAATCTGCAGACAACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAA  1980
                                                                                      
Sbjct 1834  --------------------------------------------------------------------------  1833

Query 1981  GATCACTACCAGCGTGTGAAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAA  2054
                                                                                      
Sbjct 1834  --------------------------------------------------------------------------  1833

Query 2055  GTGGTGCTTCTGGAATTCATCTCCAGCAGTGGCC  2088
                                              
Sbjct 1834  ----------------------------------  1833