Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07509
• Subject: NM_001242925.1
• Aligned Length: 2127
• Identities: 1891
• Gaps: 234

Alignment

Query    1  ATGAAGAGGTGCAGATCGGACGAGCTGCAGCAACAACAGGGCGAGGAGGATGGAGCTGGGCTGGAAGATGCCGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTCCCACCTGCCGGGCGCGGACCTCCGGCCTGGGGAGACCACGGGTGCTAACTCTGCTGGCGGGCCAACTTCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGCCGGCGCTGCCGCGGCGCCCAACCCAGGTCCCCGAAGCAAGCCTCCTGATTTAAAGAAAATCCAGCAGCTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCAGAGGGCTCCATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA  296
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------ATGTTTGGCCACGGTCTGAAGCACCTGTTCCACAGCCGCCGTCGGTCTCGGGAAAGGGAGCA  62

Query  297  CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  CCAGACGTCTCAGGATTCCCAGCAGCATCAGCAGCAGCAGGGTATGTCCGACCATGACTCCCCAGATGAGAAGG  136

Query  371  AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  AGCGCTCTCCGGAGATGCATCGCGTCTCCTACGCCATGTCCCTGCACGACCTGCCCGCCCGGCCCACCGCCTTC  210

Query  445  AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  211  AACCGCGTGCTGCAGCAGATCCGCTCCCGGCCCTCCATCAAGCGGGGCGCCAGCCTGCACAGCAGCAGTGGGGG  284

Query  519  CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  CGGCAGCAGCGGGAGCAGCAGCCGGCGCACCAAGAGTAGCTCCCTGGAGCCCCAGCGTGGCAGCCCTCACCTGC  358

Query  593  TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  TGCGCAAGGCCCCCCAGGACAGCAGCCTGGCCGCCATCCTGCACCAGCACCAGTGCCGTCCCCGCTCTTCCTCC  432

Query  667  ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  ACCACCGACACTGCTCTGCTGCTGGCCGACGGCAGCAACGTGTACCTCCTGGCTGAGGAGGCCGAAGGCATCGG  506

Query  741  GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCCGCCGGCCATGGTGACACCGACGGCCCCATCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  GGACAAGGTCGATAAGGGAGACCTGGTGGCCCTGAGCCTCCCCGCCGGCCATGGTGACACCGACGGCCCCATCA  580

Query  815  GCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAGAAGATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  GCCTGGACGTGCCCGATGGGGCACCGGACCCCCAGCGGACCAAGGCCGCCATTGACCACCTGCACCAGAAGATC  654

Query  889  CTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCGGAGTATCTGAAACTGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  655  CTGAAGATCACCGAGCAGATCAAGATTGAGCAGGAGGCTCGCGACGACAATGTGGCAGAGTATCTGAAACTGGC  728

Query  963  CAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAGCCCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  CAACAACGCGGACAAGCAGCAGGTGTCACGCATCAAGCAAGTGTTCGAGAAGAAGAACCAGAAGTCAGCCCAGA  802

Query 1037  CCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGGCCCTCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  803  CCATCGCCCAGCTGCACAAGAAGCTGGAGCACTACCGCCGGCGCCTGAAGGAGATTGAGCAGAACGGGCCCTCG  876

Query 1111  CGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGCAGGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  CGGCAGCCCAAGGACGTGCTGCGGGACATGCAGCAGGGGCTGAAGGACGTGGGCGCCAACGTGCGCGCAGGCAT  950

Query 1185  CAGCGGCTTTGGGGGTGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCCACACCG  1258
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  CAGCGGCTTTGGGGGCGGCGTGGTGGAGGGCGTCAAGGGCAGCCTCTCTGGCCTCTCACAGGCCACCCACACCG  1024

Query 1259  CCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATCGCCCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  CCGTGGTGTCCAAGCCCCGGGAGTTTGCCAGCCTCATCCGCAACAAGTTTGGCAGTGCTGACAACATCGCCCAC  1098

Query 1333  CTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACTCGTCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  CTGAAGGACCCCCTGGAAGATGGGCCCCCTGAGGAGGCAGCCCGGGCACTGAGCGGCAGTGCCACACTCGTCTC  1172

Query 1407  CAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCAACTCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173  CAGCCCCAAGTATGGCAGCGATGATGAGTGCTCCAGCGCCAGCGCCAGCTCAGCCGGGGCAGGCAGCAACTCTG  1246

Query 1481  GGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTGGATGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247  GGGCTGGGCCTGGTGGGGCGCTGGGGAGCCCTAAGTCCAATGCACTGTATGGTGCTCCTGGAAACCTGGATGCT  1320

Query 1555  CTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAAGACTCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321  CTGCTGGAAGAGCTACGGGAGATCAAGGAGGGACAGTCTCACCTGGAGGACTCCATGGAAGACCTGAAGACTCA  1394

Query 1629  GCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGGAGGAGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395  GCTGCAGAGGGACTACACCTACATGACCCAGTGCCTGCAGGAGGAGCGCTACAGGTACGAGCGGCTGGAGGAGC  1468

Query 1703  AGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATGGAGGAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469  AGCTCAACGACCTGACTGAGCTTCATCAGAACGAGATGACGAACCTGAAGCAGGAGCTGGCCAGCATGGAGGAG  1542

Query 1777  AAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATCCAGGAGGCCGTGGAGTCCTGCCTGACCCGGGTCAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543  AAGGTGGCCTACCAGTCCTATGAGAGGGCACGGGACATCCAGGAGGCCGTGGAGTCCTGCCTGACCCGGGTCAC  1616

Query 1851  CAAGCTGGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAGGTGGTACAGCTGGAGGGCGTGGAGAATGCCAACGCGCGGGCGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617  CAAGCTGGAGCTGCAGCAGCAACAGCAGCAGGTGGTACAGCTGGAGGGCGTGGAGAATGCCAACGCGCGGGCGC  1690

Query 1925  TGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCGCTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTCGTGTCCACCATCGCCAAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  TGCTGGGCAAGTTCATCAACGTGATCCTGGCGCTCATGGCCGTGCTGCTGGTGTTCGTGTCCACCATCGCCAAC  1764

Query 1999  TTCATCACGCCCCTCATGAAGACACGCCTGCGCATCACCAGCACCACCCTCCTGGTCCTCGTCCTGTTCCTCCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  TTCATCACGCCCCTCATGAAGACACGCCTGCGCATCACCAGCACCACCCTCCTGGTCCTCGTCCTGTTCCTCCT  1838

Query 2073  CTGGAAGCACTGGGACTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCACGTGTTGCTGCCCAGC  2127
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Sbjct 1839  CTGGAAGCACTGGGACTCCCTCACCTACCTCCTGGAGCACGTGTTGCTGCCCAGC  1893