Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07510
Subject:
NM_001302448.1
Aligned Length:
812
Identities:
745
Gaps:
8

Alignment

Query   1  MPLSSPNAAATASDMDKNSGSNSSSASSGSSKGQQPPRSASAGPAGESKPKSDGKNSSGSKRYNRKRELSYPKN  74
           ||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct   1  MPQSSPSAAATASDMDKNSGSNSSSASSGSSKGQQPPRSASAGPAGESKPKSDGKNSNGSKRYNRKREPSYPKN  74

Query  75  ESFNNQSRRSSSQKSKTFNKMPPQRGGGSSKLFSSSFNGGRRDEVAEAQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTF  148
           |.|.||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ENFSNQSRRSNSQKSKTFNKMPPQRGGGSSKPFSSSSNGGRRDEVAEAQRAEFSPAQFSGPKKINLNHLLNFTF  148

Query 149  EPRGQTGHFEGSGHGSWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSEDQDYTAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEV  222
           |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  EPRGQAGHFEGSGHGGWGKRNKWGHKPFNKELFLQANCQFVVSEDQDYAAHFADPDTLVNWDFVEQVRICSHEV  222

Query 223  PSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESHQYVVGDTITMQL  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 223  PSCPICLYPPTAAKITRCGHIFCWACILHYLSLSEKTWSKCPICYSSVHKKDLKSVVATESRQYAVGDTITMQL  296

Query 297  MKREKGVLVALPKSKWMNVDHPIHLGDEQHSQYSKFLLASKEQVLHRVVLEEKVALEQQLAEEKHTPESCFIEA  370
           ||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 297  MKREKGVLVALPKSKWVNVDHPINLGDEQLSQYSKLLLASKEQVLHRVVLEEKGALEQQLAEEKHTPESCFIEA  370

Query 371  AIQELKTREEALSGLAGSRREVTGVVAALEQLVLMAPLAKESVFQPRK-GVLEYLSAFDEETTEVCSLDTPSRP  443
           ||||.|.|||||||.||...||||||||||.||||||||.||.||||| ||||||||||.|...|||||.|. |
Sbjct 371  AIQEVKIREEALSGVAGGGGEVTGVVAALEHLVLMAPLATESAFQPRKQGVLEYLSAFDDEAAQVCSLDPPG-P  443

Query 444  LALPLVEEEEAVSEPEPEGLPEACDDLELADDNLKEGTICTESSQQEPITKSGFTRLSSSPCYYFYQAEDGQHM  517
           ||||||||||||||      ||||.|.|.|||.|.|||...|.||.|||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 444  LALPLVEEEEAVSE------PEACEDAEVADDSLGEGTVGPEMSQEEPITKPGFTQLSSSPCYYFYQAEDGQHM  511

Query 518  FLHPVNVRCLVREYGSLERSPEKISATVVEIAGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLE  591
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512  FLHPVNVRCLVREYGSLEQSPEKISATVVEIAGYSMSEDVRQRHRYLSHLPLTCEFSICELALQPPVVSKETLE  585

Query 592  MFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEIEENKKQGKYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTCSSDSALGPTSTEGHG  665
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 586  MFSDDIEKRKRQRQKKAREERRRERRIEMEENKRQGRYPEVHIPLENLQQFPAFNSYTCPSDSALGPTSTEGHG  659

Query 666  ALSISPLSRSPGSHADFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEEDSPFPSFAQMLRVGKAKADVWPKTAPKKDENSLV  739
           |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 660  ALSLSPLSRSPGSHADFLLTPLSPTASQGSPSFCVGSLEDDSPFLSFAQMLRVGKAKADGWPKTAPKKDDNSLV  733

Query 740  PPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATSDPLSEEKGGKKRKKQKQKLLFSTSVVHTK  811
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||.|||||||||||||||
Sbjct 734  PPAPVDSDGESDNSDRVPVPSFQNSFSQAIEAAFMKLDTPATSDPLSEDRGGKKRKRQKQKLLFSTSVVHTK  805