Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07510
- Subject:
- XM_017020283.2
- Aligned Length:
- 2477
- Identities:
- 2153
- Gaps:
- 319
Alignment
Query 1 ATGCCGCTGAGCTCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCTCCGACATGGACAAGAACAGCGGCTCCAACAGCTCCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGCTGAGCTCCCCCAACGCCGCCGCCACCGCCTCCGACATGGACAAGAACAGCGGCTCCAACAGCTCCTC 74
Query 75 CGCCTCTTCGGGCAGCAGCAAAGGGCAACAGCCGCCCCGCTCCGCCTCGGCGGGGCCAGCCGGCGAGTCTAAAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGCCTCTTCGGGCAGCAGCAAAGGGCAACAGCCGCCCCGCTCCGCCTCGGCGGGGCCAGCCGGCGAGTCTAAAC 148
Query 149 CCAAGAGCGATGGAAAGAACTCCAGTGGATCCAAGCGTTATAATCGCAAACGTGAACTTTCCTACCCCAAAAAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCAAGAGCGATGGAAAGAACTCCAGTGGATCCAAGCGTTATAATCGCAAACGTGAACTTTCCTACCCCAAAAAT 222
Query 223 GAAAGTTTTAACAACCAGTCCCGTCGCTCCAGTTCACAGAAAAGCAAGACTTTTAACAAGATGCCTCCTCAAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAGTTTTAACAACCAGTCCCGTCGCTCCAGTTCACAGAAAAGCAAGACTTTTAACAAGATGCCTCCTCAAAG 296
Query 297 GGGCGGCGGCAGCAGCAAACTCTTTAGCTCTTCTTTTAATGGTGGAAGACGAGATGAGGTAGCAGAGGCTCAAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGCGGCGGCAGCAGCAAACTCTTTAGCTCTTCTTTTAATGGTGGAAGACGAGATGAGGTAGCAGAGGCTCAAC 370
Query 371 GGGCAGAGTTTAGCCCTGCCCAGTTCTCTGGTCCTAAGAAGATCAACCTGAACCACTTGTTGAATTTCACTTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGCAGAGTTTAGCCCTGCCCAGTTCTCTGGTCCTAAGAAGATCAACCTGAACCACTTGTTGAATTTCACTTTT 444
Query 445 GAACCCCGTGGCCAGACGGGTCACTTTGAAGGCAGTGGACATGGTAGCTGGGGAAAGAGGAACAAGTGGGGACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAACCCCGTGGCCAGACGGGTCACTTTGAAGGCAGTGGACATGGTAGCTGGGGAAAGAGGAACAAGTGGGGACA 518
Query 519 TAAGCCTTTTAACAAGGAACTCTTTTTACAGGCCAACTGCCAATTTGTGGTGTCTGAAGACCAAGACTACACAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAAGCCTTTTAACAAGGAACTCTTTTTACAGGCCAACTGCCAATTTGTGGTGTCTGAAGACCAAGACTACACAG 592
Query 593 CTCATTTTGCTGATCCTGATACATTAGTTAACTGGGACTTTGTGGAACAAGTGCGCATTTGTAGCCATGAAGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCATTTTGCTGATCCTGATACATTAGTTAACTGGGACTTTGTGGAACAAGTGCGCATTTGTAGCCATGAAGTG 666
Query 667 CCATCTTGCCCAATATGCCTCTATCCACCTACTGCAGCCAAGATAACCCGTTGTGGACACATCTTCTGCTGGGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCATCTTGCCCAATATGCCTCTATCCACCTACTGCAGCCAAGATAACCCGTTGTGGACACATCTTCTGCTGGGC 740
Query 741 ATGCATCCTGCACTATCTTTCACTGAGTGAGAAGACGTGGAGTAAATGTCCCATCTGTTACAGTTCTGTGCATA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGCATCCTGCACTATCTTTCACTGAGTGAGAAGACGTGGAGTAAATGTCCCATCTGTTACAGTTCTGTGCATA 814
Query 815 AGAAGGATCTCAAGAGTGTTGTTGCCACAGAGTCACATCAGTATGTTGTTGGTGATACCATTACGATGCAGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAAGGATCTCAAGAGTGTTGTTGCCACAGAGTCACATCAGTATGTTGTTGGTGATACCATTACGATGCAGCTG 888
Query 889 ATGAAGAGGGAGAAAGGGGTGTTGGTGGCTTTGCCCAAATCCAAATGGATGAATGTAGACCATCCCATTCATCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGAAGAGGGAGAAAGGGGTGTTGGTGGCTTTGCCCAAATCCAAATGGATGAATGTAGACCATCCCATTCATCT 962
Query 963 AGGAGATGAACAGCACAGCCAGTACTCCAAGTTTCTGCTGGCCTCTAAGGAGCAGGTGCTGCACCGGGTAGTTC 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGAGATGAACAGCACAGCCAGTACTCCAAGTTGCTGCTGGCCTCTAAGGAGCAGGTGCTGCACCGGGTAGTTC 1036
Query 1037 TGGAGGAGAAAGTAGCACTAGAGCAGCAGCTGGCAGAGGAGAAGCACACTCCCGAGTCCTGCTTTATTGAGGCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGAGGAGAAAGTAGCACTAGAGCAGCAGCTGGCAGAGGAGAAGCACACTCCCGAGTCCTGCTTTATTGAGGCA 1110
Query 1111 GCTATCCAGGAGCTCAAGACTCGGGAAGAGGCTCTGTCGGGATTGGCCGGAAGCAGAAGGGAGGTCACTGGTGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTATCCAGGAGCTCAAGACTCGGGAAGAGGCTCTGTCGGGATTGGCCGGAAGCAGAAGGGAGGTCACTGGTGT 1184
Query 1185 TGTGGCTGCTCTGGAACAACTGGTGCTGATGGCTCCCTTGGCGAAGGAGTCTGTTTTTCAACCCAGGA------ 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGTGGCTGCTCTGGAACAACTGGTGCTGATGGCTCCCTTGGCGAAGGAGTCTGTTTTTCAACCCAGGAAGAGTT 1258
Query 1253 ---------AGGGTGTGCTGGAGTATCTGTCTGCCTTCGATGAAGAAACCACGGAAGTTTGTTCTCTGGACACT 1317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCTGCAACAGGGTGTGCTGGAGTATCTGTCTGCCTTCGATGAAGAAACCACGGAAGTTTGTTCTCTGGACACT 1332
Query 1318 CCTTCTAGACCTCTTGCTCTCCCTCTGGTAGAAGAGGAGGAAGCAGTGTCTGAACCAGAGCCTGAGGGGTTGCC 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTTCTAGACCTCTTGCTCTCCCTCTGGTAGAAGAGGAGGAAGCAGTGTCTGAACCAGAGCCTGAGGGGTTGCC 1406
Query 1392 AGAGGCCTGTGATGACTTGGAGTTAGCAGATGACAATCTTAAAGAGGGGACCATTTGCACTGAGTCCAGCCAGC 1465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGAGGCCTGTGATGACTTGGAGTTAGCAGATGACAATCTTAAAGAGGGGACCATTTGCACTGAGTCCAGCCAGC 1480
Query 1466 AGGAACCCATCACCAAGTCAGGCTTCACACGCCTCAGCAGCTCTCCTTGTTACTACTTTTACCAAGCGGAAGAT 1539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGAACCCATCACCAAGTCAGGCTTCACACGCCTCAGCAGCTCTCCTTGTTACTACTTTTACCAAGCGGAAGAT 1554
Query 1540 GGACAGCATATGTTCCTGCACCCTGTGAATGTGCGCTGCCTCGTGCGGGAGTACGGCAGCCTGGAGAGGAGCCC 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGACAGCATATGTTCCTGCACCCTGTGAATGTGCGCTGCCTCGTGCGGGAGTACGGCAGCCTGGAGAGGAGCCC 1628
Query 1614 CGAGAAGATCTCAGCAACTGTGGTGGAGATTGCTGGCTACTCCATGTCTGAGGATGTTCGACAGCGTCACAGAT 1687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGAGAAGATCTCAGCAACTGTGGTGGAGATTGCTGGCTACTCCATGTCTGAGGATGTTCGACAGCGTCACAGAT 1702
Query 1688 ATCTCTCTCACTTGCCACTCACCTGTGAGTTCAGCATCTGTGAACTGGCTTTGCAACCTCCTGTGGTCTCTAAG 1761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATCTCTCTCACTTGCCACTCACCTGTGAGTTCAGCATCTGTGAACTGGCTTTGCAACCTCCTGTGGTCTCTAAG 1776
Query 1762 GAAACCCTAGAGATGTTCTCAGATGACATTGAGAAGAGGAAACGTCAGCGCCAAAAGAAGGCTCGGGAGGAACG 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAAACCCTAGAGATGTTCTCAGATGACATTGAGAAGAGGAAACGTCAGCGCCAAAAGAAGGCTCGGGAGGAACG 1850
Query 1836 CCGCCGAGAGCGCAGGATTGAGATAGAGGAGAACAAGAAACAGGGCAAGTACCCAGAAGTCCACATTCCCCTCG 1909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCGCCGAGAGCGCAGGATTGAGATAGAGGAGAACAAGAAACAGGGCAAGTACCCAGAAGTCCACATTCCCCTCG 1924
Query 1910 AGAATCTACAGCAGTTTCCTGCCTTCAATTCTTATACCTGCTCCTCTGATTCTGCTTTGGGTCCCACCAGCACC 1983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGAATCTACAGCAGTTTCCTGCCTTCAATTCTTATACCTGCTCCTCTGATTCTGCTTTGGGTCCCACCAGCACC 1998
Query 1984 GAGGGCCATGGGGCCCTCTCCATTTCTCCTCTCAGCAGAAGTCCAGGTTCCCATG------------------- 2038
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGGGCCATGGGGCCCTCTCCATTTCTCCTCTCAGCAGAAGTCCAGGTTCCCATGCAGGTCTCTGGTTCCCTTT 2072
Query 2039 CAGACTTTCTGCTGACCCCTCTGTCACCCACTGCCAGTCAGGGCAGTCCCTCATTCTGCGTTGGGAGTCTGGAA 2112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAGACTTTCTGCTGACCCCTCTGTCACCCACTGCCAGTCAGGGCAGTCCCTCATTCTGCGTTGGGAGTCTGGAA 2146
Query 2113 GAAGACTCTCCCTTCCCTTCCTTTGCCCAG--AT--------GCTGAGGGTTGGAAAAGCAAAAGCAGATGTGT 2176
|||||||||||||||||||||||||||||| || .||| .|||||||..
Sbjct 2147 GAAGACTCTCCCTTCCCTTCCTTTGCCCAGGAATTTTACTGGCCTG-TGGTTGGATC----------------- 2202
Query 2177 GGCCCAAAACTGCTCCAAAGAAAGATGAGAACAGCTTAGTTCCTCCTGCCCCTGTGGACAGCGACGGGGAGAGT 2250
Sbjct 2203 -------------------------------------------------------------------------- 2202
Query 2251 GATAATTCAGACCGTGTTCCTGTGCCCAGTTTTCAAAATTCCTTCAGCCAAGCTATTGAAGCAGCCTTCATGAA 2324
Sbjct 2203 -------------------------------------------------------------------------- 2202
Query 2325 ACTGGACACACCAGCTACTTCAGATCCCCTCTCTGAAGAGAAAGGAGGAAAGAAAAGAAAAAAACAGAAACAGA 2398
Sbjct 2203 -------------------------------------------------------------------------- 2202
Query 2399 AGCTCCTGTTCAGCACCTCAGTCGTCCACACCAAG 2433
Sbjct 2203 ----------------------------------- 2202