Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07541
- Subject:
- NM_001278075.1
- Aligned Length:
- 1769
- Identities:
- 1546
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGA 74
|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGCCGACTGTCAGCGTAAAGCGAGACCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGGACCTACACTGATGAAGAGTTTGA 74
Query 75 TGAACTATGTTTTGAATTTGGTCTGGAGCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAG 148
.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 75 CGAACTGTGTTTTGAATTTGGTCTGGAACTTGATGAAATTACTTCTGAAAAGCAAATCATAAGCAAGGAACAAG 148
Query 149 GTAATGTAAAGGCAGCA-GGAGCCTCTGATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCT 221
||.|||..|||||| || ||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 149 GTCATGGGAAGGCA-CAGGGGGCCTCAGATGTTGTGCTTTACAAGATTGACGTCCCTGCCAACAGATACGACCT 221
Query 222 CCTGTGTCTGGAAGGATTGGTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGG 295
||||||||||||||||.|||.|||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 222 CCTGTGTCTGGAAGGACTGGCTCGGGGCCTCCAGGTCTTCAAAGAAAGGATCAAAGCTCCGGTATATAAGCGAG 295
Query 296 TAATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCA 369
|.|||||..|.|||.|.|||||.||..||.|||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||
Sbjct 296 TGATGCCCAAGGGAGACATCCAAAAGCTGGTTATCACAGAAGAGACAGCCAAAGTGCGCCCTTTTGCTGTAGCA 369
Query 370 GCAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCA 443
|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 370 GCAGTTCTCCGGAATATCAAGTTCACTAAAGACCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAACTACACCA 443
Query 444 GAATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTT 517
||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 444 GAATATCTGCAGGAAAAGAGCGTTGGTTGCTATTGGAACTCACGACTTGGACACTTTATCAGGCCCATTTACTT 517
Query 518 ATACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTG 591
|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.
Sbjct 518 ACACCGCGAAACGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTGAATAAGACCAAGGAGTATACAGCTTGTGAATTA 591
Query 592 ATGAACATATACAAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGT 665
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||||||
Sbjct 592 ATGAACATATACAAGACTGACAACCACCTTAAACATTATTTACATATCATTGAAAGTAAGCCCCTGTATCCAGT 665
Query 666 TATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAA 739
|||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||.|||||||.|.|||||||||||
Sbjct 666 TATCTATGACAGCAATGGTGTGGTCCTGTCGATGCCTCCGATTATAAATGGGAATCATTCAAAAATAACAGTAA 739
Query 740 ATACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTC 813
|||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 740 ATACTAGGAATATATTTATTGAATGCACAGGGACTGACTTCACTAAAGCAAAAATCGTGCTTGACATTATTGTC 813
Query 814 ACCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATC 887
|||||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 814 ACCATGTTCAGTGAACACTGTGAAAATCAGTTTACAGTTGAAGCAGTTGAAGTAGTTTCTCCTAATGGAAAATC 887
Query 888 ACATACCTTTCCAGAATTAGCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCA 961
|..||||||||||||..|..|||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 888 AAGTACCTTTCCAGAGCTGCCTTACAGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGATTTAATTAACAAGAAAGTTGGAATCA 961
Query 962 GAGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAAT 1035
||||||||||.|.||||||.|||||.||.|||||||||||||.|.|.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 962 GAGAAACTCCTGCAAATCTCGCCAAGCTCCTGACCAGGATGTGTCTGAAGTCAGAAGTCATAGGTGACGGCAAT 1035
Query 1036 CAGATTGAGATTGAAATCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTAT 1109
|||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 1036 CAGATTGAGGTTGAAATTCCTCCGACCAGAGCAGATGTCATCCATGCATGTGACATTGTGGAGGACGCAGCTAT 1109
Query 1110 TGCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATA 1183
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1110 TGCTTATGGCTATAACAACATTCAGATGACTCTGCCGAAAACGTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTCAACA 1183
Query 1184 AGCTCACTGAACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCC 1257
|||||||.||.||.|||.|||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1184 AGCTCACCGAGCTCCTCAGACTTGACATGGCTGCGGCTGGCTTCACCGAAGCACTGACTTTTGCTCTGTGCTCC 1257
Query 1258 CAAGAAGATATTGCTGATAAACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAAC 1331
|||||||||||||||||.||.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CAAGAAGATATTGCTGACAAGCTTGGCCTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTGCACATAAGTAATCCTAAAAC 1331
Query 1332 AGCTGAATTTCAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGC 1405
.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1332 CGCTGAGTTCCAGGTGGCGCGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTTCTAAAGACCATTGCAGCAAACCGGAAGATGC 1405
Query 1406 CCCTTCCACTGAAACTGTTTGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAAC 1479
|||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||...|.||||||||||||.||||||
Sbjct 1406 CCCTTCCTCTCAAACTGTTTGAAATCTCTGACGTTGTAGTAAAAGATTCTGGCAAAGATGTAGGTGCGAAAAAC 1479
Query 1480 TACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAAT 1553
|||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 1480 TACAGGCATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGACTCCCGGGTTTGAGATCATCCATGGCTTGCTGGACAGAAT 1553
Query 1554 TATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAG-GGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCT 1626
|||||||.||||||||||||||||||||||.|| ||| |||||.||..||||||||||.||.|.|||..||||.
Sbjct 1554 TATGCAGCTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAGGA-AAGCGGGGGCTACATGATCAAAGCGTCTGCAGGTTCTGCC 1626
Query 1627 TTCTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGA 1700
||.|||||.||.||.|||||.|||||.||||...|.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1627 TTTTTCCCTGGACGGTGTGCTGAGATCTTTGTTGGAGGTCAAAGCATTGGGAAGCTAGGCGTCCTTCATCCTGA 1700
Query 1701 CGTTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG 1767
.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1701 TGTTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGTTCCTCTCTGGAAATCAATATTGAGCCCTTTTTG 1767