Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07541
• Subject: XM_017003110.2
• Aligned Length: 1767
• Identities: 1468
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGATCTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAACTATGTTTTGAATTTGGTCTGGAGCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTAATGTAAAGGCAGCAGGAGCCTCTGATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGTGTCTGGAAGGATTGGTTCGAGGACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAG  370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAATTGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAG  73

Query  371  CAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACTAAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAG  147

Query  445  AATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  AATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGTTGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTA  221

Query  519  TACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  TACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCAAATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGA  295

Query  593  TGAACATATACAAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  TGAACATATACAAGACTGACAATCACCTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTT  369

Query  667  ATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCTTTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAA  443

Query  741  TACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TACTAGAAATATTTTTATTGAATGCACGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCA  517

Query  815  CCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAATCAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCA  591

Query  889  CATACCTTTCCAGAATTAGCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CATACCTTTCCAGAATTAGCTTACCGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAG  665

Query  963  AGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAAACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATC  739

Query 1037  AGATTGAGATTGAAATCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGATTGAGATTGAAATCCCTCCAACCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATT  813

Query 1111  GCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GCTTATGGATATAACAACATTCAGATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAA  887

Query 1185  GCTCACTGAACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GCTCACTGAACTTCTCCGACATGACATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCC  961

Query 1259  AAGAAGATATTGCTGATAAACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AAGAAGATATTGCTGATAAACTAGGTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACA  1035

Query 1333  GCTGAATTTCAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GCTGAATTTCAGGTGGCACGCACTACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCC  1109

Query 1407  CCTTCCACTGAAACTGTTTGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CCTTCCACTGAAACTGTTTGAAATCTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACT  1183

Query 1481  ACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ACAGACATCTCTGTGCTGTTTATTACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATT  1257

Query 1555  ATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAGGGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  ATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCTGGTGAAGACAAGGGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTT  1331

Query 1629  CTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACG  1702
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGATCTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACG  1405

Query 1703  TTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1406  TTATCACCAAATTTGAGCTGACCATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATGTTGGACCCTTTTTG  1470