Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07541
- Subject:
- XR_865550.1
- Aligned Length:
- 2004
- Identities:
- 1550
- Gaps:
- 239
Alignment
Query 1 -----------------------------------------------ATGCCGACTGTCAGCGTGAAGCGTGAT 27
|||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1 TCGCTGAGGCCCCGCATGTGGCGCAGGCGCAGTGTCCACGACTCGCCATGCCGACTGTCAGCGTAAAGCGAGAC 74
Query 28 CTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGCACCTACACTGACGAAGAATTTGATGAACTATGTTTTGAATTTGGTCTGGA 101
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTGCTCTTCCAAGCCCTGGGCCGGACCTACACTGATGAAGAGTTTGACGAACTGTGTTTTGAATTTGGTCTGGA 148
Query 102 GCTTGATGAAATTACATCTGAGAAGGAAATAATAAGTAAAGAACAAGGTAATGTAAAGGCAGCA-GGAGCCTCT 174
.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||.|||..|||||| || ||.|||||.
Sbjct 149 ACTTGATGAAATTACTTCTGAAAAGCAAATCATAAGCAAGGAACAAGGTCATGGGAAGGCA-CAGGGGGCCTCA 221
Query 175 GATGTTGTTCTTTACAAAATTGACGTCCCTGCCAATAGATATGATCTCCTGTGTCTGGAAGGATTGGTTCGAGG 248
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.||
Sbjct 222 GATGTTGTGCTTTACAAGATTGACGTCCCTGCCAACAGATACGACCTCCTGTGTCTGGAAGGACTGGCTCGGGG 295
Query 249 ACTTCAGGTCTTCAAAGAAAGGATAAAGGCTCCAGTGTATAAACGGGTAATGCCTGATGGAAAAATCCAGAAAT 322
.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||..|.|||.|.|||||.||..
Sbjct 296 CCTCCAGGTCTTCAAAGAAAGGATCAAAGCTCCGGTATATAAGCGAGTGATGCCCAAGGGAGACATCCAAAAGC 369
Query 323 TGATTATCACAGAAGAGACAGCTAAGATACGTCCTTTTGCGGTAGCAGCAGTTCTCCGTAATATAAAGTTTACT 396
||.|||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 370 TGGTTATCACAGAAGAGACAGCCAAAGTGCGCCCTTTTGCTGTAGCAGCAGTTCTCCGGAATATCAAGTTCACT 443
Query 397 AAAGATCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAATTACATCAGAATATTTGCAGGAAAAGAGCACTGGT 470
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||..||||
Sbjct 444 AAAGACCGATATGACAGCTTCATTGAACTTCAGGAGAAACTACACCAGAATATCTGCAGGAAAAGAGCGTTGGT 517
Query 471 TGCCATTGGTACCCATGATTTGGACACTTTGTCGGGCCCATTTACTTATACTGCAAAGCGTCCTTCAGATATCA 544
|||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 518 TGCTATTGGAACTCACGACTTGGACACTTTATCAGGCCCATTTACTTACACCGCGAAACGTCCTTCAGATATCA 591
Query 545 AATTCAAGCCTCTAAATAAGACCAAGGAGTATACAGCCTGTGAACTGATGAACATATACAAGACTGACAATCAC 618
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 592 AATTCAAGCCTCTGAATAAGACCAAGGAGTATACAGCTTGTGAATTAATGAACATATACAAGACTGACAACCAC 665
Query 619 CTGAAACATTATTTACATATCATTGAAAACAAACCCCTGTATCCAGTTATCTATGATAGCAATGGTGTCGTCCT 692
||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 666 CTTAAACATTATTTACATATCATTGAAAGTAAGCCCCTGTATCCAGTTATCTATGACAGCAATGGTGTGGTCCT 739
Query 693 TTCAATGCCTCCCATCATCAATGGGGATCATTCCAGAATAACAGTAAATACTAGAAATATTTTTATTGAATGCA 766
.||.||||||||.||.||.||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 740 GTCGATGCCTCCGATTATAAATGGGAATCATTCAAAAATAACAGTAAATACTAGGAATATATTTATTGAATGCA 813
Query 767 CGGGAACTGACTTTACTAAGGCAAAAATAGTTCTTGATATTATTGTCACCATGTTCAGTGAATATTGTGAGAAT 840
|.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||
Sbjct 814 CAGGGACTGACTTCACTAAAGCAAAAATCGTGCTTGACATTATTGTCACCATGTTCAGTGAACACTGTGAAAAT 887
Query 841 CAATTTACGGTCGAAGCTGCTGAAGTGGTTTTTCCTAATGGAAAATCACATACCTTTCCA-----------GAA 903
||.|||||.||.|||||.|.||||||.||||.||||||||||||||||..|||||||||| |||
Sbjct 888 CAGTTTACAGTTGAAGCAGTTGAAGTAGTTTCTCCTAATGGAAAATCAAGTACCTTTCCAATACCAAATATGAA 961
Query 904 T-TAG----------------------------------------------------------------CTTAC 912
| ||| |||||
Sbjct 962 TGTAGCCAGACTGGTATCAAACTCACGAGCCTCCTGCTTTAGCCCTCAGTGCTGTGACCCAGGAGCTGCCTTAC 1035
Query 913 CGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGACCTAATTAACAAAAAAGTTGGAATCAGAGAAACTCCAGAAAATCTTGCCAA 986
.||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||.|||||
Sbjct 1036 AGAAAGGAGATGGTGAGAGCTGATTTAATTAACAAGAAAGTTGGAATCAGAGAAACTCCTGCAAATCTCGCCAA 1109
Query 987 ACTTCTGACCAGGATGTATTTAAAATCAGAAGTCATAGGTGATGGGAATCAGATTGAGATTGAAATCCCTCCAA 1060
.||.|||||||||||||.|.|.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct 1110 GCTCCTGACCAGGATGTGTCTGAAGTCAGAAGTCATAGGTGACGGCAATCAGATTGAGGTTGAAATTCCTCCGA 1183
Query 1061 CCAGAGCTGACATTATCCATGCATGTGATATTGTAGAAGATGCAGCTATTGCTTATGGATATAACAACATTCAG 1134
|||||||.||..|.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1184 CCAGAGCAGATGTCATCCATGCATGTGACATTGTGGAGGACGCAGCTATTGCTTATGGCTATAACAACATTCAG 1257
Query 1135 ATGACTCTCCCGAAAACTTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTTAATAAGCTCACTGAACTTCTCCGACATGA 1208
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||.|||.|||
Sbjct 1258 ATGACTCTGCCGAAAACGTACACCATAGCTAATCAATTTCCTCTCAACAAGCTCACCGAGCTCCTCAGACTTGA 1331
Query 1209 CATGGCAGCCGCTGGCTTCACTGAAGCACTTACCTTTGCCCTGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGATAAACTAG 1282
||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1332 CATGGCTGCGGCTGGCTTCACCGAAGCACTGACTTTTGCTCTGTGCTCCCAAGAAGATATTGCTGACAAGCTTG 1405
Query 1283 GTGTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTCCACATAAGTAATCCTAAAACAGCTGAATTTCAGGTGGCACGCACT 1356
|..|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1406 GCCTGGATATCTCTGCAACAAAGGCAGTGCACATAAGTAATCCTAAAACCGCTGAGTTCCAGGTGGCGCGCACT 1479
Query 1357 ACCCTTCTTCCTGGCCTCCTGAAGACCATAGCAGCAAATCGTAAGATGCCCCTTCCACTGAAACTGTTTGAAAT 1430
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1480 ACCCTTCTTCCTGGCCTTCTAAAGACCATTGCAGCAAACCGGAAGATGCCCCTTCCTCTCAAACTGTTTGAAAT 1553
Query 1431 CTCTGACATTGTAATAAAAGATTCTAATACAGATGTAGGTGCAAAAAACTACAGACATCTCTGTGCTGTTTATT 1504
|||||||.|||||.|||||||||||...|.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1554 CTCTGACGTTGTAGTAAAAGATTCTGGCAAAGATGTAGGTGCGAAAAACTACAGGCATCTCTGTGCTGTTTATT 1627
Query 1505 ACAACAAGAATCCTGGGTTTGAGATCATTCATGGGCTGCTGGACAGAATTATGCAGTTGCTCGATGTGCCTCCT 1578
|||||||||.|||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1628 ACAACAAGACTCCCGGGTTTGAGATCATCCATGGCTTGCTGGACAGAATTATGCAGCTGCTCGATGTGCCTCCT 1701
Query 1579 GGTGAAGACAAG-GGGGGATATGTGATCAAAGCATCAGAAGGGCCTGCTTTCTTCCCCGGGCGATGTGCAGAGA 1651
|||||.|| ||| |||||.||..||||||||||.||.|.|||..||||.||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1702 GGTGAGGA-AAGCGGGGGCTACATGATCAAAGCGTCTGCAGGTTCTGCCTTTTTCCCTGGACGGTGTGCTGAGA 1774
Query 1652 TTTTTGCCAGGGGTCAAAGCGTCGGGAAGCTTGGGGTCCTTCATCCTGACGTTATCACCAAATTTGAGCTGACC 1725
|.||||...|.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 TCTTTGTTGGAGGTCAAAGCATTGGGAAGCTAGGCGTCCTTCATCCTGATGTTATCACCAAATTTGAGCTGACC 1848
Query 1726 ATGCCCTGCTCCTCCCTAGAAATCAATATTGGACCCTTTTTG-------------------------------- 1767
||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1849 ATGCCCTGTTCCTCTCTGGAAATCAATATTGAGCCCTTTTTGTGAGGTTGGTCTCTGAGTGTCCCTTTCTGCTC 1922
Query 1768 -------------------------------------------------------------------------- 1767
Sbjct 1923 CTGTGGTGTCCTTCAGCCCTCTTTTACAGCACATATCCATTTGTGCGTTAATGTTTAATAAAGTGAAATGTGCT 1996
Query 1768 ------ 1767
Sbjct 1997 ATCTGA 2002