Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07568
- Subject:
- NM_001321532.2
- Aligned Length:
- 1092
- Identities:
- 909
- Gaps:
- 181
Alignment
Query 1 MMDSPKIGNGLPVIGPGTDIGISSLHMVGYLGKNFDSAKVPSDEYCPACREKGKLKALKTYRISFQESIFLCED 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 LQCIYPLGSKSLNNLISPDLEECHTPHKPQKRKSLESSYKDSLLLANSKKTRNYIAIDGGKVLNSKHNGEVYDE 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TSSNLPDSSGQQNPIRTADSLERNEILEADTVDMATTKDPATVDVSGTGRPSPQNEGCTSKLEMPLESKCTSFP 222
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Sbjct 1 ---------------------------------MATTKDPATVDVSGTGRPSPQNEGCTSKLEMPLESKCTSFP 41
Query 223 QALCVQWKNAYALCWLDCILSALVHSEELKNTVTGLCSKEESIFWRLLTKYNQANTLLYTSQLSGVKDGDCKKL 296
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Sbjct 42 QALCVQWKNAYALCWLDCILSALVHSEELKNTVTGLCSKEESIFWRLLTKYNQANTLLYTSQLSGVKDGDCKKL 115
Query 297 TSEIFAEIETCLNEVRDEIFISLQPQLRCTLGDMESPVFAFPLLLKLETHIEKLFLYSFSWDFECSQCGHQYQN 370
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Sbjct 116 TSEIFAEIETCLNEVRDEIFISLQPQLRCTLGDMESPVFAFPLLLKLETHIEKLFLYSFSWDFECSQCGHQYQN 189
Query 371 RHMKSLVTFTNVIPEWHPLNAAHFGPCNNCNSKSQIRKMVLEKVSPIFMLHFVEGLPQNDLQHYAFHFEGCLYQ 444
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Sbjct 190 RHMKSLVTFTNVIPEWHPLNAAHFGPCNNCNSKSQIRKMVLEKVSPIFMLHFVEGLPQNDLQHYAFHFEGCLYQ 263
Query 445 ITSVIQYRANNHFITWILDADGSWLECDDLKGPCSERHKKFEVPASEIHIVIWERKISQVTDKEAACLPLKKTN 518
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Sbjct 264 ITSVIQYRANNHFITWILDADGSWLECDDLKGPCSERHKKFEVPASEIHIVIWERKISQVTDKEAACLPLKKTN 337
Query 519 DQHALSNEKPVSSTSCSVGDAASAETASVTHPKDISVAPRTLSQDTAVTHGDHLLSGPKGLVDNILPLTLEETI 592
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Sbjct 338 DQHALSNEKPVSLTSCSVGDAASAETASVTHPKDISVAPRTLSQDTAVTHGDHLLSGPKGLVDNILPLTLEETI 411
Query 593 QKTASVSQLNSEAFLLENKPVAENTGILKTNTLLSQESLMASSVSAPCNEKLIQDQFVDISFPSQVVNTNMQSV 666
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Sbjct 412 QKTASVSQLNSEAFLLENKPVAENTGILKTNTLLSQESLMASSVSAPCNEKLIQDQFVDISFPSQVVNTNMQSV 485
Query 667 QLNTEDTVNTKSVNNTDATGLIQGVKSVEIEKDAQLKQFLTPKTEQLKPERVTSQVSNLKKKETTADSQTTTSK 740
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Sbjct 486 QLNTEDTVNTKSVNNTDATGLIQGVKSVEIEKDAQLKQFLTPKTEQLKPERVTSQVSNLKKKETTADSQTTTSK 559
Query 741 SLQNQSLKENQKKPFVGSWVKGLISRGASFMPLCVSAHNRNTITDLQPSVKGVNNFGGFKTKGINQKASHVSKK 814
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Sbjct 560 SLQNQSLKENQKKPFVGSWVKGLISRGASFMPLCVSAHNRNTITDLQPSVKGVNNFGGFKTKGINQKASHVSKK 633
Query 815 ARKSASKPPPISKPPAGPPSSNGTAAHPHAHAASEVLEKSGSTSCGAQLNHSSYGNGISSANHEDLVEGQIHKL 888
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Sbjct 634 ARKSASKPPPISKPPAGPPSSNGTAAHPHAHAASEVLEKSGSTSCGAQLNHSSYGNGISSANHEDLVEGQIHKL 707
Query 889 RLKLRKKLKAEKKKLAALMSSPQSRTVRSENLEQVPQDGSPNDCESIEDLLNELPYPIDIANESACTTVPGVSL 962
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Sbjct 708 RLKLRKKLKAEKKKLAALMSSPQSRTVRSENLEQVPQDGSPNDCESIEDLLNELPYPIDIASESACTTVPGVSL 781
Query 963 YSSQTHEEILAELLSPTPVSTELSENGEGDFRYLGMGDSHIPPPVPSEFNDVSQNTHLRQDHNYCSPTKKNPCE 1036
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Sbjct 782 YSSQTHEEILAELLSPTPVSTELSENGEGDFRYLGMGDSHIPPPVPSEFNDVSQNTHLRQDHNYCSPTKKNPCE 855
Query 1037 VQPDSLTNNACVRTLNLESPMKTDIFDEFFSSSALNALANDTLDLPHFDEYLFENY 1092
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Sbjct 856 VQPDSLTNNACVRTLNLESPMKTDIFDEFFSSSALNALANDTLDLPHFDEYLFENY 911