Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07568
• Subject: NM_005800.5
• Aligned Length: 3276
• Identities: 3273
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGATGGATTCTCCGAAGATTGGAAATGGTTTGCCAGTGATTGGACCAGGGACTGATATAGGGATATCTTCACT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGATTCTCCGAAGATTGGAAATGGTTTGCCAGTGATTGGACCAGGGACTGATATAGGGATATCTTCACT  74

Query   75  CCACATGGTGGGGTATTTGGGAAAAAATTTTGATTCAGCTAAAGTTCCATCAGATGAGTATTGCCCTGCTTGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCACATGGTGGGGTATTTGGGAAAAAATTTTGATTCAGCTAAAGTTCCATCAGATGAGTATTGCCCTGCTTGTA  148

Query  149  GAGAGAAGGGAAAGTTAAAAGCCTTAAAGACTTACCGAATTAGTTTTCAAGAATCTATCTTTTTGTGTGAGGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGAGAAGGGAAAGTTAAAAGCCTTAAAGACTTACCGAATTAGTTTTCAAGAATCTATCTTTTTGTGTGAGGAT  222

Query  223  CTGCAGTGCATCTATCCTTTGGGCTCTAAATCACTTAATAACCTAATTTCTCCTGATTTGGAAGAATGTCACAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCAGTGCATCTATCCTTTGGGCTCTAAATCACTTAATAACCTAATTTCTCCTGATTTGGAAGAATGTCACAC  296

Query  297  TCCACATAAGCCTCAGAAAAGGAAGAGCTTAGAAAGCAGCTATAAGGATTCACTTCTTTTAGCAAATTCCAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCACATAAGCCTCAGAAAAGGAAGAGCTTAGAAAGCAGCTATAAGGATTCACTTCTTTTAGCAAATTCCAAAA  370

Query  371  AGACTAGAAATTATATTGCTATTGACGGTGGAAAAGTTTTGAACAGCAAACATAATGGAGAAGTATATGACGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACTAGAAATTATATTGCTATTGACGGTGGAAAAGTTTTGAACAGCAAACATAATGGAGAAGTATATGACGAA  444

Query  445  ACCTCGTCAAACTTACCTGATAGTAGTGGTCAACAGAATCCAATTAGGACAGCTGATTCCTTGGAGCGGAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCTCGTCAAACTTACCTGATAGTAGTGGTCAACAGAATCCAATTAGGACAGCTGATTCCTTGGAGCGGAATGA  518

Query  519  GATTTTGGAAGCTGATACTGTTGACATGGCTACTACAAAAGATCCTGCTACAGTTGATGTCTCTGGAACTGGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTTTGGAAGCTGATACTGTTGACATGGCTACTACAAAAGATCCTGCTACAGTTGATGTCTCTGGAACTGGCA  592

Query  593  GACCTTCCCCTCAAAATGAAGGATGTACATCTAAGCTGGAAATGCCACTGGAGAGCAAATGTACATCATTTCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACCTTCCCCTCAAAATGAAGGATGTACATCTAAACTGGAAATGCCACTGGAGAGCAAATGTACATCATTTCCC  666

Query  667  CAGGCTTTATGTGTCCAGTGGAAAAATGCTTATGCTCTCTGTTGGTTAGACTGTATCCTGTCAGCTTTGGTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGCTTTATGTGTCCAGTGGAAAAATGCTTATGCTCTCTGTTGGTTAGACTGTATCCTGTCAGCTTTGGTGCA  740

Query  741  CTCGGAAGAGTTAAAGAACACCGTGACTGGACTGTGCTCGAAGGAGGAATCTATATTCTGGCGGTTGCTTACAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCGGAAGAGTTAAAGAACACCGTGACTGGACTGTGCTCGAAGGAGGAATCTATATTCTGGCGGTTGCTTACAA  814

Query  815  AATATAATCAAGCAAATACACTTCTATATACCAGTCAATTGAGTGGTGTTAAAGATGGAGATTGTAAAAAACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATATAATCAAGCAAATACACTTCTATATACCAGTCAATTGAGTGGTGTTAAAGATGGAGATTGTAAAAAACTT  888

Query  889  ACCTCAGAAATATTTGCAGAGATAGAGACCTGTCTGAATGAAGTTAGAGATGAAATTTTTATTAGCCTTCAGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCTCAGAAATATTTGCAGAGATAGAGACCTGTCTGAATGAAGTTAGAGATGAAATTTTTATTAGCCTTCAGCC  962

Query  963  CCAGCTTAGATGCACATTAGGTGATATGGAAAGCCCTGTGTTTGCATTTCCCCTGCTCTTAAAACTAGAAACCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGCTTAGATGCACATTAGGTGATATGGAAAGCCCTGTGTTTGCATTTCCCCTGCTCTTAAAACTAGAAACCC  1036

Query 1037  ACATTGAAAAGCTCTTCCTATATTCTTTTTCTTGGGACTTTGAATGTTCGCAGTGTGGACACCAATATCAAAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATTGAAAAGCTCTTCCTATATTCTTTTTCTTGGGACTTTGAATGTTCGCAGTGTGGACACCAATATCAAAAC  1110

Query 1111  AGGCATATGAAGAGTCTGGTCACCTTTACAAATGTCATCCCTGAGTGGCACCCACTTAATGCTGCCCATTTTGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGCATATGAAGAGTCTGGTCACCTTTACAAATGTCATCCCTGAGTGGCACCCACTTAATGCTGCCCATTTTGG  1184

Query 1185  TCCATGTAACAATTGCAACAGTAAATCACAAATAAGAAAAATGGTATTAGAAAAAGTATCTCCCATATTCATGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCATGTAACAATTGCAACAGTAAATCACAAATAAGAAAAATGGTATTAGAAAAAGTATCTCCCATATTCATGT  1258

Query 1259  TGCACTTTGTAGAAGGCTTACCACAGAATGACTTGCAGCACTATGCATTTCATTTTGAAGGCTGTCTTTATCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCACTTTGTAGAAGGCTTACCACAGAATGACTTGCAGCACTATGCATTTCATTTTGAAGGCTGTCTTTATCAG  1332

Query 1333  ATAACTTCTGTAATTCAGTATCGAGCAAATAATCATTTTATAACATGGATTTTAGATGCTGATGGAAGTTGGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATAACTTCTGTAATTCAGTATCGAGCAAATAATCATTTTATAACATGGATTTTAGATGCTGATGGAAGTTGGCT  1406

Query 1407  GGAATGTGATGACTTAAAAGGCCCATGTTCTGAAAGGCACAAGAAATTTGAAGTTCCTGCTTCAGAGATACATA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAATGTGATGACTTAAAAGGCCCATGTTCTGAAAGGCACAAGAAATTTGAAGTTCCTGCTTCAGAGATACATA  1480

Query 1481  TTGTTATTTGGGAAAGAAAAATATCCCAAGTGACAGATAAAGAAGCTGCCTGCCTTCCACTTAAAAAGACTAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGTTATTTGGGAAAGAAAAATATCCCAAGTGACAGATAAAGAAGCTGCCTGCCTTCCACTTAAAAAGACTAAT  1554

Query 1555  GACCAACACGCTCTCAGTAATGAGAAACCAGTATCTTCAACATCGTGTTCTGTGGGTGATGCTGCCTCAGCTGA  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACCAACACGCTCTCAGTAATGAGAAACCAGTATCTTTAACATCGTGTTCTGTGGGTGATGCTGCCTCAGCTGA  1628

Query 1629  AACAGCCTCAGTAACTCACCCTAAAGATATATCAGTTGCCCCTCGTACTCTTTCACAGGACACAGCTGTAACTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AACAGCCTCAGTAACTCACCCTAAAGATATATCAGTTGCCCCTCGTACTCTTTCACAGGACACAGCTGTAACTC  1702

Query 1703  ATGGAGATCATTTACTTTCAGGTCCAAAAGGTTTGGTTGACAATATTTTACCTCTGACACTTGAAGAAACTATC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGGAGATCATTTACTTTCAGGTCCAAAAGGTTTGGTTGACAATATTTTACCTCTGACACTTGAAGAAACTATC  1776

Query 1777  CAGAAAACAGCCTCAGTTTCACAGTTAAATTCTGAAGCTTTCCTGTTAGAAAATAAACCTGTAGCAGAAAATAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGAAAACAGCCTCAGTTTCACAGTTAAATTCTGAAGCTTTCCTGTTAGAAAATAAACCTGTAGCAGAAAATAC  1850

Query 1851  AGGAATTCTCAAAACCAATACTTTGCTATCACAAGAATCACTAATGGCTTCTTCAGTATCAGCTCCATGTAATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGAATTCTCAAAACCAATACTTTGCTATCACAAGAATCACTAATGGCTTCTTCAGTATCAGCTCCATGTAATG  1924

Query 1925  AAAAGCTTATTCAAGACCAATTTGTGGACATAAGTTTTCCATCCCAAGTTGTAAATACAAACATGCAGTCAGTA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAAAGCTTATTCAAGACCAATTTGTGGACATAAGTTTTCCATCCCAAGTTGTAAATACAAACATGCAGTCAGTA  1998

Query 1999  CAGCTGAATACAGAAGATACTGTAAATACTAAATCTGTGAATAATACTGATGCTACTGGTCTTATACAGGGAGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGCTGAATACAGAAGATACTGTAAATACTAAATCTGTGAATAATACTGATGCTACTGGTCTTATACAGGGAGT  2072

Query 2073  GAAGTCAGTAGAAATTGAGAAGGACGCTCAGTTAAAACAATTCCTTACACCAAAAACTGAACAATTAAAACCAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAAGTCAGTAGAAATTGAGAAGGACGCTCAGTTAAAACAATTCCTTACACCAAAAACTGAACAATTAAAACCAG  2146

Query 2147  AACGTGTCACATCTCAGGTATCTAATTTGAAGAAAAAAGAAACTACAGCAGATTCTCAAACCACAACATCTAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AACGTGTCACATCTCAGGTATCTAATTTGAAGAAAAAAGAAACTACAGCAGATTCTCAAACCACAACATCTAAG  2220

Query 2221  TCATTACAGAATCAGTCTCTGAAAGAAAATCAGAAGAAGCCATTTGTGGGAAGTTGGGTTAAAGGCTTAATAAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCATTACAGAATCAGTCTCTGAAAGAAAATCAGAAGAAGCCATTTGTGGGAAGTTGGGTTAAAGGCTTAATAAG  2294

Query 2295  CAGGGGTGCTTCTTTTATGCCACTCTGTGTTTCAGCTCATAATAGAAACACTATAACTGATTTACAACCTTCAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CAGGGGTGCTTCTTTTATGCCACTCTGTGTTTCAGCTCATAATAGAAACACTATAACTGATTTACAACCTTCAG  2368

Query 2369  TTAAAGGGGTAAATAATTTTGGTGGCTTTAAAACTAAAGGTATAAACCAGAAGGCCAGCCACGTATCCAAGAAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTAAAGGGGTAAATAATTTTGGTGGCTTTAAAACTAAAGGTATAAACCAGAAGGCCAGCCACGTATCCAAGAAA  2442

Query 2443  GCTCGTAAGAGTGCAAGTAAGCCTCCTCCCATCAGTAAGCCACCAGCAGGCCCTCCATCGTCTAATGGCACAGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCTCGTAAGAGTGCAAGTAAGCCTCCTCCCATCAGTAAGCCACCAGCAGGCCCTCCATCGTCTAATGGCACAGC  2516

Query 2517  TGCCCACCCACATGCTCATGCTGCTTCAGAAGTTTTGGAAAAGTCTGGAAGCACCTCATGTGGAGCTCAACTCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGCCCACCCACATGCTCATGCTGCTTCAGAAGTTTTGGAAAAGTCTGGAAGCACCTCATGTGGAGCTCAACTCA  2590

Query 2591  ACCACAGTTCTTATGGGAATGGTATTTCTTCAGCAAACCATGAAGACTTGGTGGAAGGTCAGATTCATAAACTT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACCACAGTTCTTATGGGAATGGTATTTCTTCAGCAAACCATGAAGACTTGGTGGAAGGTCAGATTCATAAACTT  2664

Query 2665  CGTCTAAAACTTCGTAAAAAGCTAAAGGCAGAAAAGAAGAAATTAGCTGCTCTTATGTCTTCCCCGCAAAGCAG  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CGTCTAAAACTTCGTAAAAAGCTAAAGGCAGAAAAGAAGAAATTAGCTGCTCTTATGTCTTCCCCGCAAAGCAG  2738

Query 2739  AACAGTTCGAAGTGAAAATCTAGAACAGGTGCCCCAGGATGGGTCTCCAAATGATTGTGAATCAATAGAGGACT  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AACAGTTCGAAGTGAAAATCTAGAACAGGTGCCCCAGGATGGGTCTCCAAATGATTGTGAATCAATAGAGGACT  2812

Query 2813  TGTTAAATGAGCTACCATATCCAATTGATATTGCCAATGAGTCTGCATGCACCACTGTTCCTGGTGTTTCCCTG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TGTTAAATGAGCTACCATATCCAATTGATATTGCCAGTGAGTCTGCATGCACCACTGTTCCTGGTGTTTCCCTG  2886

Query 2887  TACAGTAGTCAAACTCATGAAGAAATTTTAGCGGAATTATTGTCTCCTACACCTGTTTCAACAGAGCTGTCAGA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TACAGTAGTCAAACTCATGAAGAAATTTTAGCGGAATTATTGTCTCCTACACCTGTTTCAACAGAGCTGTCAGA  2960

Query 2961  AAATGGGGAAGGTGACTTTAGGTATTTGGGAATGGGAGATAGTCATATCCCACCACCAGTACCAAGTGAATTCA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AAATGGGGAAGGTGACTTTAGGTATTTGGGAATGGGAGATAGTCATATCCCACCACCAGTACCAAGTGAATTCA  3034

Query 3035  ATGATGTTTCCCAGAACACACATCTGAGACAGGACCATAATTATTGTAGCCCCACCAAGAAAAATCCATGTGAA  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATGATGTTTCCCAGAACACACATCTGAGACAGGACCATAATTATTGTAGCCCCACCAAGAAAAATCCATGTGAA  3108

Query 3109  GTTCAGCCAGACTCTCTGACAAATAATGCCTGCGTTAGAACATTAAACTTGGAGAGTCCGATGAAGACTGATAT  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  GTTCAGCCAGACTCTCTGACAAATAATGCCTGCGTTAGAACATTAAACTTGGAGAGTCCGATGAAGACTGATAT  3182

Query 3183  TTTCGATGAGTTTTTTTCCTCCTCAGCATTAAATGCTTTAGCAAATGACACATTAGACCTACCTCATTTCGATG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TTTCGATGAGTTTTTTTCCTCCTCAGCATTAAATGCTTTAGCAAATGACACATTAGACCTACCTCATTTCGATG  3256

Query 3257  AATATCTGTTTGAGAATTAT  3276
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AATATCTGTTTGAGAATTAT  3276