Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07589
- Subject:
- NM_001144907.2
- Aligned Length:
- 1197
- Identities:
- 990
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAG 74
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAG 74
Query 75 ACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTACAG------------------ 130
Query 149 CCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAG 222
.||||.|.||| ||||.||.||||||||||
Sbjct 131 --------------TTCCTTTTCTT-------------------------------CTTGGCCCAGTGTCCAAG 159
Query 223 GTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 GTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC 233
Query 297 AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234 AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCA----------------- 290
Query 371 GTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAG 444
||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 ----------------------------------------------------GCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAG 312
Query 445 TTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313 TTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCC 386
Query 519 AGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 AGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGA 460
Query 593 AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCC 534
Query 667 AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTG-------------------------- 582
Query 741 GCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACT 814
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 -------------------------------------------GAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACT 613
Query 815 GGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 GGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGC 687
Query 889 CAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688 CAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAG 761
Query 963 GAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 GAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCAC 835
Query 1037 CTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 CTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAA 909
Query 1111 TTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 TTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTG 983
Query 1185 CTTCAGAGACGAA 1197
|||||||||||||
Sbjct 984 CTTCAGAGACGAA 996