Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07619
• Subject: XM_017027593.1
• Aligned Length: 2301
• Identities: 2299
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAACGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAACGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCC  74

Query   75  TTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAG  148

Query  149  ACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGT  222

Query  223  CAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGTTTCCTCCAGCTTATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGTTTCCTCCAGCTTATGG  296

Query  297  AGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCGAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGCGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCGAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGCGAG  370

Query  371  GTGCTCAGTCCCCTCTGATCTTTCTCTATGTGGTTGACACATGCCTGGAGGAAGATGACCTTCAAGCACTCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGCTCAGTCCCCTCTGATCTTTCTCTATGTGGTTGACACATGCCTGGAGGAAGATGACCTTCAAGCACTCAAA  444

Query  445  GAGTCCCTGCAGATGTCCCTGAGTCTTCTTCCTCCAGATGCTCTGGTGGGTCTGATCACATTTGGAAGGATGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGTCCCTGCAGATGTCCCTGAGTCTTCTTCCTCCAGATGCTCTGGTGGGTCTGATCACATTTGGAAGGATGGT  518

Query  519  GCAGGTTCATGAGCTAAGCTGTGAAGGAATCTCCAAAAGTTATGTCTTCCGAGGGACCAAGGATTTAACTGCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGGTTCATGAGCTAAGCTGTGAAGGAATCTCCAAAAGTTATGTCTTCCGAGGGACCAAGGATTTAACTGCAA  592

Query  593  AGCAAATACAGGATATGTTGGGCCTGACCAAGCCAGCCATGCCCATGCAGCAAGCACGACCTGCACAACCACAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAAATACAGGATATGTTGGGCCTGACCAAGCCAGCCATGCCCATGCAGCAAGCACGACCTGCACAACCACAG  666

Query  667  GAGCACCCTTTTGCTTCAAGCAGATTTCTGCAGCCTGTTCACAAGATTGATATGAACCTCACTGATCTTCTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCACCCTTTTGCTTCAAGCAGATTTCTGCAGCCTGTTCACAAGATTGATATGAACCTCACTGATCTTCTTGG  740

Query  741  GGAGCTACAGAGGGACCCATGGCCAGTAACTCAGGGGAAGAGACCTTTGCGATCCACTGGTGTGGCTTTGTCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGCTACAGAGGGACCCATGGCCAGTAACTCAGGGGAAGAGACCTTTGCGATCCACTGGTGTGGCTTTGTCCA  814

Query  815  TTGCTGTTGGCTTGCTGGAGGGCACTTTTCCAAACACAGGAGCCAGGATCATGCTGTTTACTGGAGGTCCCCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGCTGTTGGCTTGCTGGAGGGCACTTTTCCAAACACAGGAGCCAGGATCATGCTGTTTACTGGAGGTCCCCCT  888

Query  889  ACCCAAGGGCCTGGCATGGTGGTTGGAGATGAATTAAAGATTCCTATTCGTTCTTGGCATGATATTGAGAAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCCAAGGGCCTGGCATGGTGGTTGGAGATGAATTAAAGATTCCTATTCGTTCTTGGCATGATATTGAGAAAGA  962

Query  963  TAATGCACGATTCATGAAAAAGGCAACCAAGCACTATGAGATGCTTGCTAATCGAACAGCTGCAAATGGTCACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAATGCACGATTCATGAAAAAGGCAACCAAGCACTATGAGATGCTTGCTAATCGAACAGCTGCAAATGGTCACT  1036

Query 1037  GCATTGATATTTATGCTTGTGCCCTTGATCAAACTGGACTTTTGGAGATGAAGTGTTGTGCAAATCTTACTGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATTGATATTTATGCTTGTGCCCTTGATCAAACTGGACTTTTGGAGATGAAGTGTTGTGCAAATCTTACTGGA  1110

Query 1111  GGCTACGTGGTAATGGGAGATTCTTTCAACACTTCTCTCTTCAAGCAGACATTCCAAAGAATCTTTACTAAAGA  1184
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCTACATGGTAATGGGAGATTCTTTCAACACTTCTCTCTTCAAGCAGACATTCCAAAGAATCTTTACTAAAGA  1184

Query 1185  TTTTAATGGAGATTTCCGAATGGCATTTGGTGCTACTTTGGACGTAAAGACCTCTCGGGAACTGAAGATTGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTTAATGGAGATTTCCGAATGGCATTTGGTGCTACTTTGGACGTAAAGACCTCTCGGGAACTGAAGATTGCAG  1258

Query 1259  GAGCCATTGGTCCATGCGTATCTCTGAATGTGAAAGGACTGTGTGTGTCAGAAAATGAGCTTGGTGTTGGTGGC  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGCCATTGGTCCATGCGTATCTCTGAATGTGAAAGGACCGTGTGTGTCAGAAAATGAGCTTGGTGTTGGTGGC  1332

Query 1333  ACGAGTCAGTGGAAAATCTGTGGCCTAGATCCTACATCTACACTTGGCATCTATTTTGAAGTTGTCAATCAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACGAGTCAGTGGAAAATCTGTGGCCTAGATCCTACATCTACACTTGGCATCTATTTTGAAGTTGTCAATCAGCA  1406

Query 1407  CAACACCCCGATCCCCCAAGGAGGCAGAGGAGCCATCCAGTTTGTCACGCATTATCAGCACTCCAGCACCCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAACACCCCGATCCCCCAAGGAGGCAGAGGAGCCATCCAGTTTGTCACGCATTATCAGCACTCCAGCACCCAGA  1480

Query 1481  GACGCATCCGCGTGACCACCATCGCCCGAAATTGGGCAGATGTACAGAGTCAGCTCAGGCACATAGAAGCAGCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GACGCATCCGCGTGACCACCATCGCCCGAAATTGGGCAGATGTACAGAGTCAGCTCAGGCACATAGAAGCAGCA  1554

Query 1555  TTTGACCAGGAGGCTGCGGCAGTGTTGATGGCACGGCTTGGGGTGTTCCGAGCGGAGTCAGAGGAGGGGCCCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTGACCAGGAGGCTGCGGCAGTGTTGATGGCACGGCTTGGGGTGTTCCGAGCGGAGTCAGAGGAGGGGCCCGA  1628

Query 1629  TGTGCTCCGGTGGCTGGACCGACAACTCATCCGACTGTGTCAAAAGTTTGGACAGTATAACAAAGAAGACCCCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTGCTCCGGTGGCTGGACCGACAACTCATCCGACTGTGTCAAAAGTTTGGACAGTATAACAAAGAAGACCCCA  1702

Query 1703  CTTCTTTTAGGTTATCAGATTCCTTTTCTCTATATCCTCAGTTTATGTTCCATCTGAGAAGATCTCCATTTCTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTTCTTTTAGGTTATCAGATTCCTTTTCTCTATATCCTCAGTTTATGTTCCATCTGAGAAGATCTCCATTTCTT  1776

Query 1777  CAAGTGTTTAACAACAGTCCTGATGAGTCGTCATATTACAGACATCATTTTGCCCGGCAGGACCTGACCCAGTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAAGTGTTTAACAACAGTCCTGATGAGTCGTCATATTACAGACATCATTTTGCCCGGCAGGACCTGACCCAGTC  1850

Query 1851  CCTCATCATGATCCAGCCCATTCTCTACTCTTACTCCTTTCATGGGCCACCAGAGCCAGTACTCTTGGATAGCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTCATCATGATCCAGCCCATTCTCTACTCTTACTCCTTTCATGGGCCACCAGAGCCAGTACTCTTGGATAGCA  1924

Query 1925  GCAGCATTCTAGCTGACAGAATTTTGCTGATGGATACTTTCTTTCAAATTGTCATTTATCTTGGTGAGACCATA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCAGCATTCTAGCTGACAGAATTTTGCTGATGGATACTTTCTTTCAAATTGTCATTTATCTTGGTGAGACCATA  1998

Query 1999  GCCCAGTGGCGTAAAGCTGGCTACCAGGACATGCCCGAGTATGAAAACTTCAAGCACCTTCTGCAGGCACCACT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCCAGTGGCGTAAAGCTGGCTACCAGGACATGCCCGAGTATGAAAACTTCAAGCACCTTCTGCAGGCACCACT  2072

Query 2073  GGATGATGCTCAAGAAATTCTGCAAGCACGCTTCCCGATGCCACGTTACATCAACACGGAGCATGGAGGCAGTC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGATGATGCTCAAGAAATTCTGCAAGCACGCTTCCCGATGCCACGTTACATCAACACGGAGCATGGAGGCAGTC  2146

Query 2147  AGGCTCGATTCCTTTTGTCCAAAGTGAACCCATCTCAGACACACAATAACCTGTATGCTTGGGGACAGGAAACT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGGCTCGATTCCTTTTGTCCAAAGTGAACCCATCTCAGACACACAATAACCTGTATGCTTGGGGACAGGAAACT  2220

Query 2221  GGAGCACCCATCCTAACTGATGATGTTAGCCTGCAGGTGTTCATGGACCATTTGAAGAAGCTGGCTGTCTCCAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GGAGCACCCATCCTAACTGATGATGTTAGCCTGCAGGTGTTCATGGACCATTTGAAGAAGCTGGCTGTCTCCAG  2294

Query 2295  TGCCTGT  2301
            |||||||
Sbjct 2295  TGCCTGT  2301