Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07648
- Subject:
- NM_001256428.2
- Aligned Length:
- 1788
- Identities:
- 1419
- Gaps:
- 366
Alignment
Query 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG 370
||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------------ATGG 4
Query 371 CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 78
Query 445 GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT 152
Query 519 GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA 226
Query 593 AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 227 AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG 300
Query 667 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATGGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATGGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTA 374
Query 741 TACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 375 TACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGC 448
Query 815 GTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449 GTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAA 522
Query 889 GAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCAGGAGCCTTCTCCGCAGTTGGCTTCCTCGGTAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 GAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCAGGAGCCTTCTCCGCAGTTGGCTTCCTCGGTAGC 596
Query 963 TTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGGTTACCAGCCTCACAACTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 597 TTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGGTTACCAGCCTCACAGCTG 670
Query 1037 CAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 CAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTA 744
Query 1111 CCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAGCTTTGGGACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 CCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTACTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAGCTTTGGGACA 818
Query 1185 AACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 AACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGT 892
Query 1259 GCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACCATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 GCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACCATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTC 966
Query 1333 AACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 AACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCT 1040
Query 1407 GTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1041 GTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAGTGCGT 1114
Query 1481 TGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 TGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCAC 1188
Query 1555 TTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 TTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATT 1262
Query 1629 TCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 TCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAG 1336
Query 1703 TGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCAT 1410
Query 1777 TCTGTGAATTTT 1788
||||||||||||
Sbjct 1411 TCTGTGAATTTT 1422