Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07648
- Subject:
- XM_006501738.1
- Aligned Length:
- 2219
- Identities:
- 1557
- Gaps:
- 448
Alignment
Query 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA 74
|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA 74
Query 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG 148
||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG 148
Query 149 TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA 222
||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct 149 TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG 222
Query 223 GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA 296
|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||||.||
Sbjct 223 GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGGGTGA 296
Query 297 ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG 370
||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 297 ACCTAAGGAAGTAGTTAAGCCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTATCCAAAGTCACTTCCACTACCAACATGG 370
Query 371 CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 444
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCTACAATAAAGCACCACGGCCCTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 444
Query 445 GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT 518
||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|.||||||.|.||.
Sbjct 445 GCGTTCACCCCAGCCCATGCCGCCACTTCATCACATGCTTCCCCCACACCTGTGGCCGCTGCCACTCCCCTCCA 518
Query 519 GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA 592
..||.|||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||.||.|.||||||
Sbjct 519 CCTCTCTGCATCCGGACTGCATGTTAGTGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTGTTCATCTCCACCGAACACTGGTA 592
Query 593 AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG 666
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 593 AACCTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAG 666
Query 667 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG------------------------------- 709
||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 667 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTAAGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAA 740
Query 710 --GCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCA 781
|||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCA 814
Query 782 AGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATC 855
||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 815 AGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATC 888
Query 856 CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAA---TAAC-- 924
|||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...||.|||||.||||||||||| |.||
Sbjct 889 CTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGTTTTACAG 962
Query 925 -TCTCAGGA-----GCCTT-------------------------CTCCGCAG---------------------- 945
||||.||| .|||| ||||.|||
Sbjct 963 TTCTCTGGAAGACCCCCTTAAGAACGGACCACACCCACCTGCAGCTCCCCAGCTGTTAAAAGTTCATAGTCAAG 1036
Query 946 -----------------------------------------------------------------------TTG 948
|||
Sbjct 1037 TAGCCATAGTTTCTAAGGAAGCAGCCACTTACTCTAGTGTAAGCAGGTCTACAAGAACTGTAGAAGGTGCTTTG 1110
Query 949 G----------------------CTTC----------CTCGGTA-------------------------GCTTC 965
| |||| ||.|.|| |||.|
Sbjct 1111 GAAGGCTTTGGAAACTTTCCTGCCTTCTCCCCTCCTACTAGATACAGTGCTGTAGTCGTCAGTGATGCGGCTGC 1184
Query 966 CAC-------------------------AC--GGAGCAT--GCCC-GAGAGC------------CTGGA----- 992
||| || ||..|.| |||| ||.|.| |||||
Sbjct 1185 CACTGTGTCTGCTGCTCTCGCTGCGAAAACCAGGCTCTTCGGCCCTGAAAACTCCCAGTCTCTTCTGGATGCAC 1258
Query 993 -------CAG-------CCCAA--------------------------CCTCTG-------------------- 1006
||| ||||| ||||||
Sbjct 1259 TGTGCATCAGCACTGTCCCCAAGCCTCTAGCTCTTTCCTGTCTTCAGTCCTCTGAGGAGTCGAGTGGCTCTGTC 1332
Query 1007 -------------GCAG-----ACCAGGGG--TT-------ACCAGCCTCA----------CAACT-------- 1035
|||| .|||||.| || |||.||.||| ||.||
Sbjct 1333 CACGTTAAGAAGAGCAGTAGCACCCAGGAGCCTTCTCAGCAACCGGCGTCATCTGGAGCTTCACCTCTGAGCGC 1406
Query 1036 ----------------------------------------------------------GCAGCTGCCTTCAAGC 1051
||.|||||.|||||||
Sbjct 1407 GTCTGAGGGCCCCGAGAGCCCAGGTTCCAGCAGGCCCTCGGTGGCTGGCCTCCGCTCCGCTGCTGCTTTCAAGC 1480
Query 1052 CTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAACGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGA 1125
|||||||||||||..||| ||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||.||||||.|||||.|||
Sbjct 1481 CTGTAGGATCCACCAGCG---TCAAGTCACCTAGCTGGCAGCGTCCAAACCAAGCAGCACCTTCTACTGGGAGA 1551
Query 1126 ATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGCCAACTCAG-CTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTG 1198
||.|||||||..||...||..|||||..|||.||| | ||.||||.|...||||||||||||
Sbjct 1552 ATTTCAAACAATGCACGTTCTTCAGGTACAGGGGC-------------GTCTGTGGGGCCTCCCCAGCCAAGTG 1612
Query 1199 ACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAGGGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAAC 1272
||||.|||||..|.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1613 ACCAAGACACACTTGTGCAGAGAGCGGAACACATTCCAGCGGGCAAGCGGACCCCCATGTGTGCCCACTGCAAC 1686
Query 1273 CAGGTCATCAGAGGACC-ATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCTTGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACT 1345
||.||.|||||.||||| .||||| |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1687 CAAGTTATCAGGGGACCTTTTCTT-GTGGCTCTGGGGAAGTCCTGGCATCCAGAAGAATTTAACTGTGCTCATT 1759
Query 1346 GCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGGAGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAA 1419
|||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1760 GCAAAAACACAATGGCCTACATAGGCTTTGTAGAGGAGAAGGGAGCACTGTACTGTGAGCTATGCTATGAGAAG 1833
Query 1420 TTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTG 1493
||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1834 TTCTTTGCTCCTGAATGTGGCCGGTGCCAAAGGAAGATCCTTGGAGAAGTCATCAATGCTTTGAAGCAGACCTG 1907
Query 1494 GCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATTCGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTG 1567
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1908 GCATGTGTCCTGTTTTGTGTGTGTGGCCTGTGGAAAACCCATTCGTAATAATGTTTTCCACTTGGAAGATGGCG 1981
Query 1568 AACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTATATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCT 1641
|.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1982 AGCCCTACTGTGAGACAGACTACTACGCCCTTTTTGGAACAATATGTCGTGGATGTGAATTCCCCATAGAGGCT 2055
Query 1642 GGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACACTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAG 1715
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 2056 GGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGATACACTTGGCATGATACTTGCTTTGTGTGCTCTGTGTGTTGTGAAAG 2129
Query 1716 TTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTGTGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT 1788
|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130 TTTGGAAGGGCAGACATTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCACTTTGCAAAAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT 2202